| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 3748316 = | 0 (0.000) | 188 (1.050) | 97/410 | NT | 100% | pseudogene (665/873 nt) | tnaB | low affinity tryptophan permease TnaB |
| ? | NC_007779 | = 4056987 | NA (NA) | coding (391/417 nt) | Y75_RS20060 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3748553‑3748316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCAT < NC_007779/4056987‑4056763 TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGG > 1:1479803/1‑239 TCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTG < 1:1596733/237‑1 CGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGATCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGAT > 2:693420/1‑238 TTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGC < 2:1216501/238‑1 TTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGAT > 1:1634077/1‑236 CCGCCAGTCGTTTTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTGCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCCTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATGTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCC < 1:989191/238‑1 GCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTG > 1:229814/1‑228 AGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:1242992/239‑1 cTTACCTCCATGTTTGTCGTGCTGAAGTTGATCTCCTTTGTGATCGGCTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGAGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGTGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCCTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 2:1925521/237‑1 ATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:2124556/239‑1 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1:1487660/1‑219 GAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCGCCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:2084359/239‑1 TTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGTTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:394170/237‑1 ATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGTTTATTTGCTATGGTAACCGGGTGCTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 2:221337/1‑232 ATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTGTTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACGTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 2:321064/1‑239 ATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 2:30533/1‑239 TTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 2:489913/1‑239 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< 1:3638/238‑1 TCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 2:1750235/238‑1 GATTACGCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 2:807358/239‑1 TACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 1:693420/239‑1 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ATGGATTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCACAGTCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTCCTGTTTCTATCAGCTCTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCCAAAGCACCCCCGGACATCAGCGCTATCTTTGCTCTACCTGCCG > 2:543449/1‑239 TTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC < 1:1771062/239‑1 TTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC > 1:1239585/1‑239 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACA > 1:1085372/1‑239 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGGAAAACA > 2:2043325/1‑239 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAC < 2:1164725/185‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT > 1:1822135/1‑134 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 2:1822135/134‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:1368346/132‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:629136/94‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGATTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGAGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCGCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACA > 2:200939/1‑239 CCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATG > 1:207427/1‑239 GTGTGTCTGGCGTCTTTTAGTTGCCACGTCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTCCCAACTTACTGATTTAGTGTAGGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTACCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAGCGGCAAAAGCTCCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGC < 2:1030446/238‑1 TGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCA > 1:1022244/1‑238 TGTGTCTGGCGTCATTTGGCTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCA > 2:772241/1‑238 TCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 1:2003070/196‑1 TGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 1:432281/239‑1 CGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTT > 2:438496/1‑238 CGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 1:265998/191‑1 CGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 2:265998/1‑191 GGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACAC < 1:30533/239‑1 GCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCG > 2:399165/1‑231 GCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCG < 1:399165/231‑1 TCCCACCCTTATTATTGGTTATGGAAAACGGGTGATGCTGCAAACTTACTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTGAGGTGCTCCGGTGGCTTTTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCGCCGCCGGACATCAGCGCTATCCCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTA < 2:248461/239‑1 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTG > 1:1158097/1‑204 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:454621/86‑1 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:1126534/83‑1 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 1:1126534/1‑83 CCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 1:149567/1‑113 CCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:149567/113‑1 tgtTTATTTGCTTTGGAAAACGGTTGATGCTGCCAACTTTCTGTTTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTCTCAGCTGTCCCTCCTGTCCAGCTACTGCCGGGGTGGTGCGTACCGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAG < 2:1902122/236‑1 GATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGC > 1:2056514/1‑200 GATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTGCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGC < 2:2056514/200‑1 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTAGTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGC < 2:296407/162‑1 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAA > 1:1170530/1‑239 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAA > 1:1102706/1‑239 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAA > 2:20241/1‑239 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGATGCCAACTTCCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATAAGCGCTATCTCTGCTCTTACTGCCGTAAAAGATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCCCTTCTCAACCCGCTACGCCCCAGAA > 2:1386912/1‑239 TTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTGTCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAA < 1:1646412/238‑1 TGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCAT > 2:618498/1‑239 ATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 2:1268576/167‑1 ATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGC < 2:986909/150‑1 TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3748553‑3748316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCAT < NC_007779/4056987‑4056763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |