| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 1388812 | 174 (0.970) | 19 (0.110) | 10/398 | NT | 10.1% | coding (379/1542 nt) | tyrR | transcriptional regulator TyrR |
| ? | NC_007779 | = 1388962 | 171 (0.980) | coding (529/1542 nt) | tyrR | transcriptional regulator TyrR | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACAGGCGCAGAAACTGGCGATGCTAAGCGCGCCGCTGCTGATTACGGGTGACACAGGTACAGGTAAAGATCTCTTTGCCTACGCCTGCCATCAGGCAAGCCCCAGAGCGGGC > NC_007779/1388724‑1389198 | tatGAAAAGCAAAGGGGATATGGCGACCCCGGCGAGCTGTCATCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACcg < 2:203733/239‑1 (MQ=255) 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aaaaGCAAAGTGGACATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGAACGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACACTTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGGTGGCTGGCAATCAAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTGATTAATGGGAAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCGGGTTATCTTCAGGATGAAATGGATCAACACGGCCTGAACGgagc < 2:1097449‑M2/239‑5 (MQ=255) cAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCggtgg > 2:1570748/1‑239 (MQ=255) aaaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCggtggt < 1:1570748/239‑1 (MQ=255) aaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGgtggtg < 1:1051668/239‑1 (MQ=255) atatGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGtt > 1:26921/1‑238 (MQ=255) atatGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGtt < 1:745141/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |