| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779 | = 2521059 | NA (NA) | intergenic (+170/+30) | Y75_RS12570/Y75_RS12575 | IS4‑like element IS421 family transposase/sensor domain‑containing phosphodiesterase | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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> 1:1209879/1‑239 (MQ=34) ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttt > 1:40531/1‑239 (MQ=34) ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttt > 2:1613555/1‑239 (MQ=34) cATCGCTGGATTTCCACCCCAGAAGTACCGGAACCGAAAAGAAGACCTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGTTTACAGGTGGGCATTCGCGGGACCGTAACACTGACAGCCTACAAAACGCAATTGCAGAACGCTAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGGGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCCCAAGTTTGCGCTCATTGTATAATTCCCCGGt < 2:837896/236‑1 (MQ=11) cGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttttttt > 1:1200561/1‑239 (MQ=37) cGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGt < 1:2138427/233‑1 (MQ=33) cGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAGGGGATAATTCCCCGGt > 2:2138427/1‑233 (MQ=18) 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1:1100605/82‑1 (MQ=255) gTCGCATTCTGCAGATGGTTCAACACTTATGTTAGCGCTTATGTGATAAGTCCCCGGCTTTTTTACGCCTGTTAATCAGATAATGGCTGCGTGCGACCAATCAAATTCCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTTTCGACAAACTTCGTGACCACACTCAATGACCTCGCTTTCGCCAGATCGGTTATTGATCTTCCAATCATCGCAACCa < 2:2013267/238‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACTTCGCTTTCGCCAGATCGGTAATTGATCTCACAATCATCGCATCCAGc > 1:11869/1‑239 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACTTCGCTTTCGCCAGATCGGTAATTGATCTCACAATCATCGCATCCAGCgtg < 1:1297857/238‑1 (MQ=255) 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> NC_007779/2520832‑2521296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |