| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 2537411 | 193 (1.080) | 15 (0.090) | 6/390 | NT | 7.0% | coding (503/762 nt) | cysZ | sulfate transporter CysZ |
| ? | NC_007779 | = 2537613 | 218 (1.280) | coding (705/762 nt) | cysZ | sulfate transporter CysZ | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGTTTGT‑GTGAAACA‑GGGGTGG‑CTTATGCCGCCCCTTATTCCATCTTGCATGTCATTATTTCCCTTCTGTATATAGATATGCTAAATCCTTACTTCCGCATATTCTCTGAGCGGGTATGCTACCTGTTGTATCCCAATTTCATACAGTTAAGGA > NC_007779/2537376‑2537848 | ttACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTg < 1:1446711‑M2/239‑2 (MQ=255) tACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTg < 2:1476925‑M2/238‑2 (MQ=255) cccTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCGTGCCCGTTGCCGTTTGTggcgcgacg < 2:2144016‑M2/238‑10 (MQ=255) cccTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgcgacg < 2:943898‑M2/238‑10 (MQ=255) gtgTATTGGGATAACCGTTGCGCTGGTACGGTGGTTCCTGTTTAGCGCGTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAGCCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCTCCCTGCGCACACGCAAAATCACCATTATGCAGTTTGGTGCTTTAACCTGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGGTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGa < 2:1675342/237‑1 (MQ=255) ggTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGAt > 1:1280936/1‑239 (MQ=255) ggTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGAt > 2:315790/1‑239 (MQ=255) tATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGAtg < 2:742842/238‑1 (MQ=255) ggCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTc > 2:495551/1‑239 (MQ=255) gCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTc < 1:2087439/238‑1 (MQ=255) aaaCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGa < 1:1966159/238‑1 (MQ=255) aCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGAtt > 2:773164/1‑238 (MQ=255) gTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTAT‑TGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTa < 2:721483/239‑1 (MQ=255) 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atatGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGGTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGTTTGT‑GTGAAACA‑GGGGTGG‑CTTATGCCGCCCCTTATTCCATCTTGCATGTCATTATTTCCCTTCTGTATATAGat < 1:1201126/239‑1 (MQ=255) aGTGTGGTGCGGTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTAGATTGCTATCGCGAGAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATGTTGTAAACCGGTTGT‑GTGAAACA‑GGGGTGG‑CTGATGCCGCCCCTTATTCCATCTTGCATGTCATTATTTCCCTGCTGTATATAGATATGCt < 1:1518096/238‑1 (MQ=255) tttGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGGAACAATCTACCGGGTATTTTTTAAAACGTTTGT‑GGGAAACA‑GGGGGGG‑GTTAAGCCGCCCCTTATTCCATCTTGTGTGTCATTATTTTCCTTTTTTATATAGATATGCTaaa > 2:1600952/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |