New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_007779 | 4056220 = | NA (NA) | intergenic (‑209/+15) | Y75_RS25055/Y75_RS20055 | hypothetical protein/IS1‑like element IS1A family transposase |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GAGTGTAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTG‑TCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCT‑AATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAAT‑GACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/4055983‑4056454 | tgtAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTG‑TCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCT‑AATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTaa > 2:84170/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |