New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 3876427 = | NA (NA) | 3 (0.020) | 3/388 | NT | 9.9% | coding (1806/4134 nt) | Y75_RS19225 | RHS element protein RhsA |
? | NC_007779 | 3876545 = | 29 (0.160) | coding (1688/4134 nt) | Y75_RS19225 | RHS element protein RhsA |
CCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTCCGGCTGCCGGTGGCATCTTCCGTTGCGCAGGGTAAGTCACTGTGTGGATTATCATAACGGTAGCGGGTGATATCGCCGTCAGGGGCAGTTTCCTGAATCAGACGGCCCAATTCATCATATTCCCGGCGCAATT > NC_007779/3876307‑3876782 | cgacccGGCGGCATCGTTTTCCATACTGCGGCTTCGCCCGCCGTGTTGGGTTCGGACGGCCTGTCCCCGCGCATCGTACGGTGTCCCGTTTAGGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCGTGGCCCTGGGTGTGTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTACGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCa < 2:2023274/235‑1 (MQ=11) ccGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCa < 1:443770/239‑1 (MQ=31) gTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGGGTCTTTCACGGCCATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGGGCAc > 1:443461/1‑238 (MQ=14) acgcggccccgggaaaaccaggccgtggggccttacgggtcggttcctgagtttcaccgactgttccggttatgtacccggttgtgcccatgcccgcttcgggcagatgacggcggtgccccgcgaggaagggcggagtcagtaccgcgaatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgAccg < 2:2033819‑M2/4‑1 (MQ=255) accggcagccggaaacccatgacgtggagcctttacggtcagttgctgagcttcaccgactgttccggttatgtaacccgttatgaccatgaccgcttcgggcagatgacggcggtgcaccgcgaggaagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgAccgc < 1:845877‑M2/5‑1 (MQ=255) accggcagccggaaaaccatgacgtggagccgttacggtcagttgctgagcttcaccgactgttccgggtatgtaacccgttatgaccatgaccgcttcgggcagatgacggcggtgcaccgcgaggaaaggcagagtcagtaccgcgcacacgacagccgcggacaggtaattgccgtgaaagacacgacgggccaagtaacgcggtatgaatacaacctccgcggggacctcAccg > 2:1538682‑M2/235‑238 (MQ=255) ccggcagccggaaaaccatgacgtggagccgttacggtcagttgctgagcttcaccgactgttccggttatgtaacccgttatgaccatgaccgcttcgggcagatgacggcggtgcaccgcgaggaagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgAccgcc > 1:1515141‑M2/234‑239 (MQ=255) cagccggaaaaccatgacgtggagccgttacggtcagttgctgagcttcaccgactgttccggttatgtaacccgttatgaccatgaccgcttcgggcagatgacggcggtgcaccgcgaggaagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCa > 1:532717‑M2/230‑239 (MQ=255) tCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCt > 1:1730637/1‑238 (MQ=31) ttCCTTGCTGCGCGTTAGCCGTCCCTGGGTGGTACGGACGGCCTTGCCCCAGCCATCGTACTGTGTCCCGTTTTTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTACCCGGCGATGTTTTATTCAGCCCGCGTTGCATGGCCTTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGCCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGa < 2:1903378/239‑1 (MQ=11) ccATCCTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCTTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAg < 1:848717/239‑1 (MQ=14) ccATCCTGCGCCGTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGCGGGCCTTTCCCCCCGCTTCGTGCGGTGTCCCGTTTCTGCGGCCGTCCGGGGCAATGACGGGGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTACCTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAg < 2:1183449/239‑1 (MQ=11) ccATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAg < 1:91303/239‑1 (MQ=31) ccATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAg < 1:573834/239‑1 (MQ=31) cATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGGTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCCCGGCCTTCGTTGGCGCGGTACCGCACCCGCCCTTCCCCCAGGTGGCCCAGCGGCCTCTGCCCGCAGc > 2:2070985/1‑239 (MQ=11) tACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATTCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCCCCCCCGTCGTCCTCCCCGAGCgg > 2:339934/1‑239 (MQ=11) cTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTTCGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCGCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTTTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtc < 1:856519/239‑1 (MQ=14) cTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtc < 1:1835360/239‑1 (MQ=31) cTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtc < 1:2057117/239‑1 (MQ=31) cTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtc < 1:155704/239‑1 (MQ=31) tccgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGTGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtca > 1:1184495/3‑239 (MQ=14) tGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCgggca > 1:1337302/1‑239 (MQ=14) gcgcGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGGCATCTGCCCGAAGCggccat > 1:457507/1‑239 (MQ=14) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGGCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGGACTGCCTCACCCCTTCCTCGCGGTGCCCCGCCCTCATCTGCCCCAAGCggtccgg > 2:764905/1‑236 (MQ=11) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCCCGGCCATTACCTGTCCCCGGCTTTCGGATTCCCGGTACTGAACCAGCCCTTCCTCGCGGGTCGCCCCCGTCACCTGCCCGAAGccggc > 2:1023286/1‑232 (MQ=11) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCa > 2:138317/1‑211 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCa < 1:138317/211‑1 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg > 1:356905/1‑239 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg > 1:306523/1‑239 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg > 1:232492/1‑239 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg > 1:1979408/1‑239 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg > 1:1247029/1‑239 (MQ=31) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCCGATGCGCGGTCCTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGGGCCCCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggacatg > 1:1009487/1‑239 (MQ=9) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGGCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCCTGGCCCTGCGGGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACCGCCGTCGTATGCGCGGTACTGACTCCGCCCTTCCTCTCCGTGCACCCCCGTCATCCTCCCGCAGCggtcctc > 2:564253/1‑236 (MQ=11) cgcgTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGATTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcctg > 1:389132/1‑239 (MQ=14) tcggtAGCCGGCCCCGCGTGGTCCTGAGGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCGGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCGCCGGCGATGTTGTATTCATTCCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTACCTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatg < 2:76336/234‑1 (MQ=11) tAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCCGGTCACCGGCGCTGTTGGATTCATACCGCGTTTCATGGCCCCGCGTGTCTTTCCCCGCCATTAACTGTCCACGGCTTGCGTATGGCCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCCGGGCACCGCCGGCATCCGCCCCAAGCggtccgtgtga > 2:1735021/1‑231 (MQ=11) tAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCggtcatggtcat > 1:670762/1‑239 (MQ=11) tAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCCCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCCCGGTGCACCCCCGTCATCTTCCCGAAGCggtcctggtcct > 1:1222634/1‑237 (MQ=2) tgcatcgcgaggaggggcagagtcagtaccgcgattccgccagcggtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTc < 2:1483874‑M2/96‑1 (MQ=255) ggaagggctgagtcagtaccgcgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTcc > 1:1483874‑M2/110‑215 (MQ=255) cgcatacgatagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCa < 1:1706556‑M2/10‑1 (MQ=255) cgcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCa > 2:1706556‑M2/89‑98 (MQ=255) gcatacgacagccgtggacagttaattgccgtgaaagacacgcagggccatgaaacgcggtatgaatacaacatcgccggtgacctgACCGCCGTCATCTGCCCGAAACGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTCCGGCTGCCGGTGGCATCTTCCGTTGCGCAGGGCAAGTCACTGTGTgg > 1:2065631‑M2/88‑239 (MQ=255) ACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTCCGGCTGCCGGTGGCATCTTCCGTTGCGCAGGGTAAGTCACTGTGTGGATTATCATAACGGTAGCGGGTGATATCGCCGTCAGGGGCAGTGTCCTGAATCAGACGGCCCAATTCATCATATTCCCGGCGCAAtt > 2:1751487‑M2/1‑238 (MQ=255) | CCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTTAGCCCGCCCTGCGTGGTACGGACGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCATCTGCCCGAAGCGGTCATGGTCATAACGGGTTACATAACCGGAACAGTCGGTGAAGCTCAGCAACTGACCGTAACGGCTCCACGTCATGGTTTTCCGGCTGCCGGTGGCATCTTCCGTTGCGCAGGGTAAGTCACTGTGTGGATTATCATAACGGTAGCGGGTGATATCGCCGTCAGGGGCAGTTTCCTGAATCAGACGGCCCAATTCATCATATTCCCGGCGCAATT > NC_007779/3876307‑3876782 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |