| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,205,094 | G→A | 25.2% | intergenic (‑182/‑25) | ttdR ← / → ttdA | DNA‑binding transcriptional activator TtdR/L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,205,094 | 0 | G | A | 25.2% | 153.9 / 27.3 | 105 | intergenic (‑182/‑25) | ttdR/ttdA | DNA‑binding transcriptional activator TtdR/L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/62); new base A (10/14); total (28/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_007779/3204860‑3205326 | aCGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACa < 1:262937/238‑1 (MQ=255) tttCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc < 1:930054/239‑1 (MQ=255) tttCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc < 1:310874/239‑1 (MQ=255) ttCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTTAAATTTTTCATACTAATCCa > 2:310874/1‑239 (MQ=255) cTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCACACAaaaaaaaa > 1:1609975/1‑239 (MQ=255) aCCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACaaaaa < 1:1314451/239‑1 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTATATTTTTTTACACAaaaaaaaaaaaagaa > 2:2173286/1‑234 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:1142877/239‑1 (MQ=255) ccTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCACACAaaaaaaaaaaaaggggt > 1:214487/1‑232 (MQ=255) tGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAAc < 1:639514/231‑1 (MQ=255) aaGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGATTTGcc < 2:1756666/238‑1 (MQ=255) tCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGAAGTTTGAGGC‑GGCGAGTATTTCTAAGTCAATACAAAAACAgggagtggcatgc > 2:500598/1‑228 (MQ=255) cTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCatg < 1:1577247/237‑1 (MQ=255) tGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATATTTTTATACAAATAAAAAAACAGgtgtggtcagtgtc > 2:639514/1‑227 (MQ=255) gCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAg < 1:1171643/224‑1 (MQ=255) ccAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 1:412377/237‑1 (MQ=255) cAGCTATTCATCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCATTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCGCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGT‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTTGAGTTGGCATGATGAGCTAAAGtaat < 2:133121/238‑1 (MQ=255) cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGtaat < 1:1141431/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGAAGTTGCCATGATGAGGGAAAGgaataa > 1:1719332/1‑239 (MQ=255) tATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGc < 1:662540/238‑1 (MQ=255) atcATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:308502/237‑1 (MQ=255) agaTCGTTAATTCTCCGCAGTTGTGATAAGCGCCGTGTAGTTCGCAAGACGTTGCCATTCCCTGCGCTGGCGCAATATTAATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTAGCGGTGGCAAAATATATAAATCCACACTTA‑TAGTGGTAGTTTGTAGC‑GGTGAAATTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCaaagggc < 2:1406584/237‑6 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:1323538/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:588017/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTG‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:1876689/236‑1 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTAGAAAAAAAAAAAAAACGGAGTTGTCATGATGAGGGGAAAAAATAAACAAAAAGCAGTgga > 1:1407995/1‑237 (MQ=255) tATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc < 2:1273157/183‑1 (MQ=255) tATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc > 1:1273157/1‑183 (MQ=255) aTCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGtt < 2:31421/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAAAAGAAGGTGTCATGATGTGTGAAAAGAAAAAGCAACAGGCAAAGAATAAAGTT‑ACAGAGATTGTG‑GCTaa > 1:1151094/1‑239 (MQ=255) cAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAg < 1:1171191/186‑1 (MQ=255) aGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATAGAGTTGGCATGTTGAGCGAAAAAAATAAAAAAAAAACAATGAAAAAGTTG‑TCAGAGATTGGC‑GCTAAAtt > 1:1627444/1‑239 (MQ=255) aGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGC‑‑AAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGCGGAAGGAAAAAAAAACAAGCAGAGAATAAGTTG‑ACAGAGAATGTC‑GCCAACttt > 1:1315421/1‑238 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGT‑GC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATa < 2:1676685/206‑1 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGT‑GC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATa > 1:1676685/1‑206 (MQ=255) aaacCATTGCCTTTCCCTTCTCTGACATAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTAATTCACGAACTTTTAATTACATTTTCACGGTGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCAAAAAAAATACAAAATCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAAAAATAAACAACAGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGAt < 2:388867/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAAAGGAGTTTCCCTGATGTGCGGAAAAAATAAAAAACAAGCAATGAAAAAAATG‑GCAGAGATTGTCGGCTAAATTAACcccctgat > 1:1694704/1‑235 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTTAAACAAAAACAAAAAAATGAGGTGGCATGATGGTGGAAAGTAATAAACAAAAAGCAGAGAAAAAATTT‑ACAGAAATTTTC‑GCTAACTTTAACGCCATGAttt > 1:1327067/1‑239 (MQ=255) ttgcttttccttccTCTGGCAAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAAGTTTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATAAAAACCCACTTTTT‑TGGGGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTAAATAATTTG‑ACAGAGTTTGTC‑GTTACTTTTACCGCCATGATTTCTAc < 1:1645703/233‑1 (MQ=255) tGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCCAACAAAAAAAAAAAAAGGAGGTGTCATGGTGAGGGGAAGGAATAAAAAAAACACAGTGAAAAAAGTG‑AAAAAAAATGTC‑GCTAAATTTTCAGCCAAGATTTTTaa > 1:388867/1‑237 (MQ=255) tGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGtaat < 1:1331696/176‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTTTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTGTGGTTAATTCACGAATTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAATTAAAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTCCCAAACAAATACAAAAACTGGAGTGGCCTGGATGAGCGAAAGTAAAAAACAACAGCCGGTAAATAAGTTG‑ACAGAGTTGGTC‑ATTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:995965/239‑1 (MQ=255) ccggccatGGCGAAATATTCCTTCTTATTTACGCTTTGATTCCCAAACGGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAACCCACAGTTT‑AAGTGGTAGTTGGCGGA‑GGTGATTTTTCCCACACAAATCCAAACACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAATTAAAAAGCACAAGGCAGTGAAGAAGTTG‑AAAGAGTTGGTG‑GTTATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGcc < 1:682509/232‑1 (MQ=255) gcgttGGCGGAATATTCATTCTTATTTCCGGGTTGATTCACAAATTTTTAATTACTTATTCAGGGGGACAAAAAATAAAAAACCATATTTT‑TAGTGGTAGTTTGGGGT‑GGTGAATTTTTCAAGACAAAGAAAAAATCTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAATCAACGGGCAGTGAATAAGTGG‑CCAGAGATTTCC‑GCTAATTTACCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtg < 1:1862950/234‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGAt < 1:1583993/196‑1 (MQ=255) tggggCGAAATTTTATTTCTTTTTTTCGTTTTGATTCACAATTTTTTAATTACATTTTCACGGTGAAAAAAAAAAAAAAACAAAATTTT‑TGTTGGAAGTTTGTGGA‑GATAAATTTTCAAAGAAAAAAACAAAAACGGGATGTGCCATGAAGGGCGAAAGAAATAAGCAACGGGCGATAAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GTTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 2:1627444/236‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTTAGAAAAAAACAAAAAAAGGAGGTGGTCTTGTGGGAGAAAGTAATAAAAAACACACAGAAAAAAAAAAG‑ACAGAGAGTTTC‑GCGAAATTTACACCCCTGATTTTTACCCGAATGACtgatgatgg > 2:1217012/1‑236 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGTTTCACGAACTGTTAATTAAATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTA‑ACAGAGTTTGTG‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑gt < 1:426740/238‑1 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAAATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TGGGGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGATTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTTTC‑GCTAGTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑gt < 1:1568805/238‑1 (MQ=255) ttttcatttTTATTTTCGCGTTAATTCACGATCTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCAAAACAAATACAAAAACTGGGGTTGCCAGGATGAGGGAAAGTAAAAAGCACCAGGAAGTAAATAAGTGG‑AAAGAGTTTGTC‑GTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 2:214487/237‑1 (MQ=255) tatTCTTTCTTATTTTCGCTTTGATTCACGAACTTTTATTTACATATTCACGGTGGAAAAAAATAT‑AAACCAAATTTTATGGTGGTAGTTTGGGGC‑GGGGAATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAAGGGGTGTTGCAAGGATGAGCGAAAATAATAAGCAACAGGTGTTTAATAAGTGG‑ACAGGGATTGGC‑TCTATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 2:1631661/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAACCCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 1:533044/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGtaat < 1:35871/153‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAGCAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 1:132101/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTATTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACGGGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGAAATGGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 1:1216472/239‑1 (MQ=255) tatCCATTCTTATTTTCGCGTTTATTCACGAAGTGTTAATTACTTATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTT‑AAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGATTTTTTCCAGACAAAAACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGAAACAGCCAGTAAAAATGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGa < 1:1532701/239‑1 (MQ=255) ttcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGta < 1:1421467/149‑1 (MQ=255) ttttATTTTCGCGTTGATTCACGAATTGTTAATTAAATATTCAGGGTGG‑AAAAAA‑AAAAACCCACATTTT‑TAGTGGTTGTTTGTGGG‑GGGGAATTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGAGAAAATAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GTTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTaaa < 2:1315421/237‑1 (MQ=255) ttttttttCGTGTTGATTCACGAATTGTTAATTAAATATTCGCGGTGATAAAAAATAAAAAACCACATTTT‑TGGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTAAATTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAATGGGATTTGCCATGAGGAGCAAAAGAAATAAGAAACGGGCAGTAAATAAGTGG‑ACAGAGATTGTC‑GTTAATTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTaa < 2:2046569/235‑1 (MQ=255) ttATTTTAGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGAGTTTGCC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTaaa < 1:461701/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGCCATGATTAAGGGAAGGAATAAACAAAAAGCAGTGCATAAAGTT‑ACAAAGAATTTC‑GCTAAATTTTACCCCATGATTTTTTCCCCAAAGCCCTATAGA‑GGGGTGGGTAAACCaaaa > 1:45412/1‑239 (MQ=255) tGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTGGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAgg < 1:466271/238‑1 (MQ=255) cGAACTGTTAATTACATATTAAGGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAAATTTT‑TAGTGGTATTTTGGGGG‑GGAGAATTTTACAAAAAAAAAAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCATTGAATAAGTTG‑ACAGAGATGGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGa‑a < 1:2126145/239‑1 (MQ=255) agAATTGTTAATACAATTTTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTT‑TGGTGGTATTTGGGGGG‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAAGTGGAGTTGCAATGAGGAGCGAAAATAAAAAACACAGGGCAGAAAATAAGTTG‑ACAGGTTTTGTC‑GTTATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGa‑a < 2:45412/238‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTaaaa < 1:636118/214‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTGGTGGC‑GGTGAATTTTCCCAGAAAAAGACAAAAACTGGAGTTGCAAAGGTGGGCGAAAGTAATAGCCAACGGCCAGTGAAAAAGTTG‑ACAGAGATTGCC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCt < 1:718776/190‑1 (MQ=255) ttACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGAt < 1:1217012/239‑1 (MQ=255) cATATTCACGTTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTACCAGACAAATACAAAAACTGGATTAGCAAGGATGGGCAAAAGTAATAAGCACCGGCAAGTAAATAAGTTG‑AAAGAGTTTGTC‑GCTAATTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATggg < 1:1301791/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTTAAACAAAAAAAAAAAATGTAGGTTCTATGAGGAGGGAAAATAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATAAATTG‑ACAGAGAGTGTC‑GTTAAATTTACCGCCATGCTTTTTAACCCAAAACACGATGAA‑GGTGTGGGTAAAATAAAAAAGATAAAAGATATCGAGAACG‑CCTCGATgggg > 2:1080861/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTC‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTTAAACAAAAACAAAAAAAGAAGTTGTCATCATTAGAGGCAGTAATAAACAAAAAGAAGTGGAAAAGATT‑ACAGAGAATGTT‑GCCAACTTTAACGCCATGATTTTTTCCCCAAAGACTGATGAC‑GGGGTGGGTAAAATAAAAAAACCAAAGGAAGCCGG‑AACATGGTCGGAgggg > 2:414497/1‑239 (MQ=255) ttttaaCGTTGACAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGTTATGTTGGGGC‑GGTAAATTTTCCAAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCAATGATGAGCGAAATTAATAACCAACAGGAAGTAAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGa < 1:2023847/234‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTGG‑AAGGAGATTGTC‑GTTATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGa < 1:2173286/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TATGGGTATTTTGTGGT‑GTTGAATTTTCCCAAAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAACCAACAGGCAGTGAATAATTTG‑AAAGAGTTTGTC‑GATAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGa < 1:188275/239‑1 (MQ=255) attccgggTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TGGTGGTAGTTGGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAATGGGAGTGGCCATGAGGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGa < 1:1181194/232‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAACAGGAGTTGGCATTATGAGGGGAAGTAATAAGCAAAAAGCAATGAAAAAATTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTATCGCCCTGATTTTTACCCCAATGCCTGATGAC‑GGGGTGGTTAAACAAAAACAACTAAAGGAAGACGA‑AAAAGCGTCGATggggga > 1:1323629/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGGGTTGTCATGATGAGGGGAAGTAATAAACAACAGGCAGTGAAAAAGTTG‑ACAAAGAATGTC‑GCTAAATTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAA‑GGGGTGGGTAAAATAAAACAGCTAAAAGATGCCCA‑AAAGTCGTCGGTggggga > 1:1746119/1‑237 (MQ=255) ttccgggtgcaaaaaaaaaTAAAACCACTTTTT‑TAGGGGTATTTTGGGGA‑GGGAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACAGGAGTGGCCATGAGGAGTGAAAGAAATAACCAACGGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGATATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGa < 1:719537/226‑1 (MQ=255) cACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCACACAAAAACAAAAAATGGAGTTTGCCTGATTGGGGGAAGGAATAAACAACAAGCAGAGAAAAAAGTG‑ACAGAGATTGTT‑GCTAACTTTACCCCCATGATTTTTACCCCACAGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAACTAAAAGATGCCCA‑AACGTCGTCGGTGGGGgaaaa > 1:1621840/1‑238 (MQ=255) ggtaggCAAAAAAAAAAAAACCAATTTTT‑TAGTGGTATTTGGTGGG‑GAGGAATTTTTCAAGACAAAAAAAAAAAGTGGTGTTGCGATAGTGAGCGAAAGTAATAAGAAACAGGTAATTAATAGGCTG‑ACAGAGATTGTC‑GTAATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1719332/234‑1 (MQ=255) ggTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAATTTTTCCAAACAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGGGGAAATAATAAGCAACAAGCAGTGAATAAATTT‑AAAGAGATTGTC‑GCTAAATTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAAGCCTGATGAC‑GTGGGGGAGAAAATAAAACAGCCAAAGGATGCCGC‑AACATCGTCGATGGGGAAAATTAt > 1:386390/1‑239 (MQ=255) ggTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTATTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:378506/239‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1504569/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATAAAAAACAACATTTT‑TGTTGGTAGTTGTGGGG‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAACCTGGAGTTGCGATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCAAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1746119/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTCCCAGGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1440179/238‑1 (MQ=255) tGGAAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATc < 1:343866/238‑1 (MQ=255) ggCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACACGAGGTGCCATGATGAGGGGAAAAAATAAACAACAGGCAGGGAATAAGTTG‑ACAGAGAATGTT‑GCTAACCTTACCGCCATGATTTCTACCCCAAAGCCCGATGAC‑GGGGTGGATAAACTAAAAAAGCTAAAGGAAGCCCA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCt > 1:305333/1‑238 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGGAATTTTTAACAACAAA‑AAAAAAAAAGGAGGTTGCATGGTGGGGGGAAGGAATAAACAACAAGCAGGGAAAAAGATGAAAAGAGA‑TATA‑GCCAAAATTAACTCCATGATTTTTACACGAATTACTGGTGACAGTGG‑GGGTAAACTAAAACAGCTAAAAGATGACGA‑AACGTAGCCGATGGGGaaaaattaatat > 2:1181194/1‑231 (MQ=255) aaaaaaaaaaCCCACTTGTT‑TGGTGATAGTTTGTGCC‑GGTAAATTTTTCAAGAAAAAAACAAAAACGGGAGTTGCCATAATGATAAAAAAAAATAACCAACAGACGGTGAAT‑AGTTGAACGGGGTTTGTC‑GCTATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:2098269/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaCCACTTTTT‑AAGTGTTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGCAACAGGAAGTGAATAATTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:891232/234‑1 (MQ=255) aaTATAAACCCAAATTTT‑TAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTAAATTTTCCAAAAAAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATAATGAGCGAAATTAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTGG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1080861/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTT‑AAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAATAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTG‑ACAGAGTTTGTC‑GCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:54633/239‑1 (MQ=255) tataAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGa < 1:2083132/83‑1 (MQ=255) taaaaaaCCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1674910/234‑1 (MQ=255) aaacCCACATTTT‑TAGTGGTAGTTGGGGGC‑GTTAAATTTTCCAAGAAAAATACAAAAATTGGATTTGCCATGATGAGAGAAAGAAATACGAAAGTCACATTAAATAATTTG‑ACAGAGTTTGTC‑CATACTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGtt < 1:1677301/239‑1 (MQ=255) aTTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGAGGAGCAAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTAcc < 1:243035/142‑1 (MQ=255) aTTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTaaa < 1:61940/174‑1 (MQ=255) ggTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTCCCAAAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTACTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCaaaa < 1:342922/237‑1 (MQ=255) gTAGTTTGTGGC‑GATGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGc > 2:2098050/1‑239 (MQ=255) tttCAAGAAAAAAAAAAAAACGGGAGTGGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGCAACGGGCAGGGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGCC‑CCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1903959/239‑1 (MQ=255) tttcAGACAAATAAAAAAAAAGGAGGTGCCCTGGTGGGCGAAAGTAATAAGAAAAAGGCAGTGAATACGGTG‑GCAGAGATTGTA‑GGTAACTTTACCGCCAGGATTTCTAACCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAAAAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGGTGGGGAAAATTATCTACCATACCATGTTTGACAAAACGCAAAAAGTGAGTGACCTGAAACgcactc > 2:1616941/4‑233 (MQ=255) | ACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTT‑TAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTC‑GCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAC‑GTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGA‑AACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_007779/3204860‑3205326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |