Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,732,053 | A→C | 15.2% | T324P (ACC→CCC) | bglF → | PTS beta‑glucoside transporter subunit IIABC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,732,053 | 0 | A | C | 15.2% | 401.9 / 8.9 | 142 | T324P (ACC→CCC) | bglF | PTS beta‑glucoside transporter subunit IIABC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (91/24); new base C (3/23); total (94/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.39e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TTTCTTCACACCATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCAAACGA > NC_007779/3731815‑3732290 | cttcACACCATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCa > 1:547545/1‑239 (MQ=255) cacCATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATc < 1:1412342/239‑1 (MQ=255) acCATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATcc < 2:804613/239‑1 (MQ=255) cATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGTTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCg < 1:336013/239‑1 (MQ=255) gCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGt < 1:1319095/239‑1 (MQ=255) tCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATccc < 1:273192/228‑1 (MQ=255) tCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATg > 1:807294/1‑238 (MQ=255) tCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATg > 1:332100/1‑238 (MQ=255) tCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGCGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGGTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCCGCTTCTGGCCACTCTTCGTCATGGTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTTCCGCTGTGTATCAATAACTTCCCCGTTCTGGGC‑TAGGAACCCATGATCCCTCTGTTAATg > 2:480831/1‑238 (MQ=255) aTGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTTGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCg > 2:519765/1‑238 (MQ=255) tGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGcc > 1:2125070/1‑239 (MQ=255) aTCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTAt > 1:463083/1‑239 (MQ=255) cccGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTa > 1:1145175/1‑232 (MQ=255) tttCTTGTGGTGGGCCCGTTATCAACCTGGATAAGCGATCTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGTCTTTATCGGGCGGTTCCGTCATTGGCGGGGGGGTTAAGGGGCGGCTTCTGGAAAATCTTCGTCAGGTTCGGCCGGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGCC‑TACGACCCCCGGACCCCACTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGggc < 2:463083/239‑1 (MQ=255) gtggGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCCTTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCg > 2:1805975/1‑238 (MQ=255) gtggGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCg > 2:1768194/1‑238 (MQ=255) gtggGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACGGGGGCCTGGGGCCGCTGTGTATCAATCACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCACTTATGGCCCAGGTCGGGGAGGCGCCCg > 2:1569944/1‑238 (MQ=255) tATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCt < 1:409008/226‑1 (MQ=255) tggttaTAAGGGCAGTGTTTGCGCCCGGTTATCTCTGGTTTTATCGGGCGTTTCCTTCATTGGGGGGGGCGGTAAGGGGCGGTTTCTGGAAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCTTGGTGCCGCTGTGTATCAATACCTTCCCCGTGCTGGGT‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGa < 2:903775/233‑1 (MQ=255) aGCGAGGTGATTGCCGCCGGGTTACTCTGGTTTTATCGGGGTGTTCCTGCATTTGCGGGGGCGGAAATGGGCGGCTTTGGGCAAATTTTCGTCAGGTTCGCACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCCCCGTGCGGGGC‑TACGACGCCATGATCCCGCTGTTAAGGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATgc < 2:2101092/239‑1 (MQ=255) aGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATgc > 2:1562929/1‑239 (MQ=255) cGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATgcgc > 2:1269906/1‑239 (MQ=255) gAACTGATTGCGGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCCCCGTGCTGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCa < 1:1225657/239‑1 (MQ=255) cTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCGGaa > 1:503861/1‑239 (MQ=255) ggTGATCTGGGGTTTTTTCAGGGTGTCCCTGCTTGTGCGGGCGCGGTAATGGGCGTCTTCGGGAAATTCTTCGCCATGTTCGGTGTGCACTGGGGCCTGGTGCCGTTGTGTATCAAAAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACCCCATGACCCCGGTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGc < 2:2125070/239‑1 (MQ=255) gTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCCCCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATgcg > 1:903775/1‑221 (MQ=255) gTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGcc < 1:1740812/163‑1 (MQ=255) gCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGCTCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGATCGCGATGAGCAGAAAAAAGAGGTGGC‑tggggtcgccg > 2:1840289/1‑231 (MQ=255) tttATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAgcggc < 1:1903572/238‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGacac > 2:1446127/1‑127 (MQ=255) aTCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCCGAGGCGTTg > 1:750397/1‑239 (MQ=255) aTCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTg > 1:1350826/1‑239 (MQ=255) aTCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGCGGTGGC‑GGGATCACCCGCGTTg > 1:991976/1‑239 (MQ=255) aTCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGCGGTGGC‑GGGACAAGCGGTGttt > 2:801959/1‑238 (MQ=255) gCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCt > 2:385607/1‑173 (MQ=255) gCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCt < 1:385607/173‑1 (MQ=255) gCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCCGCGGCGTTGACGAg > 1:464157/1‑239 (MQ=255) cGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGAGCAGGGGCGTTGACGAg > 1:1546643/1‑238 (MQ=255) tGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGCGGC‑GGGATCAGCGGGGTTGTCGAGGTGGTTTGGGATc > 2:278513/1‑238 (MQ=255) gTAATTGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGCCTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATACCTCCCCCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAg < 1:93903/238‑1 (MQ=255) gggCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGtat > 1:1763150/1‑239 (MQ=255) ggcggcTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGc < 1:1003338/103‑1 (MQ=255) cTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGGAAAAAGCGGTGGCGGGGATC‑GCGGCGGTGACGAGGCTGGTTGGTATCACCGAATCACCGGGATCTTGCg > 2:1113429/1‑239 (MQ=255) gTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGGCAACCTGCCGCGT‑AAGTAc > 1:1272834/1‑238 (MQ=255) cGGACTGCCCTGGGCCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCCCCGTGCGGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCt < 1:212000/239‑1 (MQ=255) cGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTTTGTATCAATATCTTCCCCGTGCGGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCt < 1:278513/239‑1 (MQ=255) cGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGGTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCt > 1:1904875/1‑239 (MQ=255) gtcTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCGGTTTATCAATAACTGCACCGTGCTGGGC‑TACGGCACCATGATCCCGCTTTAATTGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCtt < 1:1161020/236‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGGCCTGGGGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCGGGGC‑TAGGACCCCATGATCCCCCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTGCCCCTTTG‑tt < 1:1313805/239‑1 (MQ=255) gcccTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATACCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTa < 1:955606/236‑1 (MQ=255) cgcTGGGGCGGGGTGCCGCTGTTAACCAATAACGCCCCCGTGCGGGGC‑TCCGACACCATGCTCCCGCTTTTACTGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTa < 2:1904875/236‑1 (MQ=255) ggggtcggggtccGTTGTGTTTC‑ATAACCTCCGCCTGCTGGGCGAACGACCCCGTGTTCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGc < 2:584040/227‑1 (MQ=255) gggCCTTGTGCCGCTCTGTATCAATAACTTCACCGTGCTACGC‑CACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCACGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTATTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGGTCAGCGGCCTTTACCACGCTGTTTGGGCTCACCGGACGCCTGGTAAATGGCCTTCACGTGCCCCGTAAACTACCCCtagtccgcggc > 2:1591946/1‑228 (MQ=255) gggCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCACCGGCGGTTACGAGTCTGTTTGGTATCCCCCAACCAGCGGGATATGGCGTCCACCTGCCGCGT‑AAGGACCCCTTTT‑TTATCGccc > 2:1660778/1‑238 (MQ=255) ggCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCg > 1:183473/1‑235 (MQ=255) ggCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGAACAGCGGCGTTGACGAGGCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCCACCTGCCGCGT‑AAGCACCCCCTtt‑ttctgc > 2:1166330/1‑231 (MQ=255) gCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TCCGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAAc < 1:1611893/186‑1 (MQ=255) tGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCa > 2:563859/1‑127 (MQ=255) tGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCa < 1:563859/127‑1 (MQ=255) tGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATc > 1:203949/1‑239 (MQ=255) gCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCCGCGGGGTTGGCCAGGCTGTTTGGGATCACCGAAACAGCGGgata > 2:1611893/1‑186 (MQ=255) gCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTgggg > 1:772305/1‑239 (MQ=255) tgtATCAATAACTTCCCCGTGGTGGGC‑TACGACACCATGACCCCGCTTTTAATCCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCa < 2:981357/174‑1 (MQ=255) tataactAACTTCCCCGTGCGGGGC‑TACGACCCCTGGGCCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAAc < 2:1006837/164‑1 (MQ=255) tATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCCGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTgg > 1:702449/1‑239 (MQ=255) tATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCCGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGTAGATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAATACCCCTTTG‑TTACCGCCTGTATCCGTGGGGC‑TTTgg > 2:1065901/1‑239 (MQ=255) aaTAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACCCCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGc < 1:1065901/239‑1 (MQ=255) aTAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTTACGCGTCTTTTTGGTAGTACCGGACCCGCGGTATATCGGGTCAACCTGCCGCGC‑AAAGACCCCCTTG‑TTATCGCCCGTCTCCGTGGGGG‑TTTgggggt > 2:313208/1‑237 (MQ=255) tagcgtCACCGTTCTGGGC‑TACGACCGCCGGTACCCTCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGcca < 2:1214584/234‑1 (MQ=255) tAACTTCCCCGTGCGGGGC‑TCCGACCCCATTGCCCCGCTGTTAAGGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGcca < 1:1113429/239‑1 (MQ=255) tcTTCCCCGTGAGGGGC‑TACGACCCCTTGTCCCCGTTGTTAAGGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGccacc < 1:380806/238‑1 (MQ=255) aCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGGCGAGTCTGTTGGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCCGCCACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑CTAACGCCTGTTTCCGTGGGGC‑GTGGGGGGcgac > 2:43855/1‑238 (MQ=255) aCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATg > 1:981357/1‑174 (MQ=255) aCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTgggg > 1:1445095/1‑233 (MQ=255) aCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGGTTGGTATCACCGAACCAGGGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGG‑AAGTACCCCTTTG‑TTTTCGCCTGTATCAGTGGGGG‑TTTGGGGGccac > 1:2007310/1‑238 (MQ=255) aCTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTGGACGAGTGTGTTTGGGATCACCGAAACAGCGGGATATGGCGTCAACCTGCCCCGT‑CAGTACCCCTCTT‑TTATCGCCCGTATCAGTGGGGG‑TTTGGGGGgcac > 2:291752/1‑238 (MQ=255) ttCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGGTCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGGTTCCCCGGACCAGCGGTATATGGCCTCAACCTGCCCCGT‑AAGTACCCCTTTG‑GTATCGCCCGTATCCGCGGGGCGTTTGGGGGcgccct > 2:1080606/1‑234 (MQ=255) ttCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCCGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATAACCGAACCAGCGGTATACGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGGACCCCCTTG‑TTATCCCCCGTATCTGGGGGGC‑CTTGGGGGCCACCat > 2:1135270/1‑239 (MQ=255) ttCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGtata > 1:1006837/1‑170 (MQ=255) ttCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTCTACAAGACTGATTGGTATCCCCGAACCAGCGGAATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTATCCCTTTG‑TTATCCCCCGGACCAGCGGGGC‑CTTGGGGGCCACCat > 2:694340/1‑239 (MQ=255) ttCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTAAGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGAGGTGGC‑CGGGTCAGCGGCGGTTGCGAATCTGTTTGGTAACAGCGAATGCGCGGGATCTGGGGGTACCCTACCGCGT‑AAGGACCCCTGTG‑TTTTTGCCTGTTGTCGCGGGGC‑TGTTGGGGcccccct > 2:1010160/1‑237 (MQ=255) cACCGTTCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGGCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCCCCattt > 2:2184757/1‑238 (MQ=255) cACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCatta > 1:1452442/1‑239 (MQ=255) cACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGGTTGGTATCCCCGAACCAGCGGTAAATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGGACCCCTTTGTTTATC‑CCCGTTTCAGGGGGGC‑GTTGGGGGCCACCattt > 2:127197/1‑238 (MQ=255) cACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGGTGACGAGTCTGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCCCGT‑AAGAAACCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCCGTGGGGC‑CTTTGGGGCCCCCctta > 2:1936846/1‑239 (MQ=255) cACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCCTTGACGGGTCTGTTTGGAATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGTCGCCT‑AAGTACCCCCTTG‑TTATGCCCTGTAACAGTGGGG‑‑TCTGGGGGgcaccacttt > 2:908395/1‑235 (MQ=255) cGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTTACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCcgc > 1:440691/1‑182 (MQ=255) gTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGGATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTg > 1:486383/1‑214 (MQ=255) gTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTg > 1:702717/1‑238 (MQ=255) cTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCt > 1:1369606/1‑238 (MQ=255) tGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATg > 1:178928/1‑162 (MQ=255) ctggctcaCGACACCATGTCCCCGCTTTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAg < 2:2140456/176‑1 (MQ=255) ggC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGCTCAACGGCGTTGACGAGTCCGTTTGGGATCACCGAAACAGCGGGATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACGCTTATTGGCTAcg > 1:1634734/1‑238 (MQ=255) cGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCg < 2:757823/148‑1 (MQ=255) cGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCg > 1:757823/1‑148 (MQ=255) cGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGGATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCaa > 1:1591231/1‑238 (MQ=255) cGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGAACAGCGGCGTGGACGAGTCTGTTTGGGAACACCGAACCACGGGCCTAAGGCGGCAACCTGCCGCGT‑AATAACCCCTTTG‑TTTAGGCCTGTTAACGTGGGGC‑CTTTGGGGCCACCCCTTCTGGCTAcccccca > 2:1760081/1‑232 (MQ=255) acacCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCAAACg > 2:979279/1‑239 (MQ=255) cacCATGTCCCCGCTGTTAAGGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCaaa < 1:1662700/236‑1 (MQ=255) cacCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCAAACGa < 1:1269906/239‑1 (MQ=255) | TTTCTTCACACCATTGCTATGTCTGATGGTTATCACACCCGTCACCTTTCTGCTGGTGGGGCCGCTATCAACCTGGATAAGCGAACTGATTGCCGCCGGTTATCTCTGGCTTTATCAGGCGGTTCCTGCATTTGCGGGCGCGGTAATGGGCGGCTTCTGGCAAATCTTCGTCATGTTCGGACTGCACTGGGGCCTGGTGCCGCTGTGTATCAATAACTTCACCGTGCTGGGC‑TACGACACCATGATCCCGCTGTTAATGCCCGCCATTATGGCGCAGGTCGGGGCGGCGCTCGGCGTCTTCCTCTGCGAACGCGATGCGCAGAAAAAAGTGGTGGC‑GGGATCAGCGGCGTTGACGAGTCTGTTTGGTATCACCGAACCAGCGGTATATGGCGTCAACCTGCCGCGT‑AAGTACCCCTTTG‑TTATCGCCTGTATCAGTGGGGC‑TTTGGGGGCCACCATTATTGGCTACGCGCAAACGA > NC_007779/3731815‑3732290 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |