Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,764,880 | G→T | 7.9% | T33N (ACC→AAC) | Y75_RS18670 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,764,880 | 0 | G | T | 7.9% | 652.3 / 9.1 | 209 | T33N (ACC→AAC) | Y75_RS18670 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (94/95); new base T (4/16); total (98/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
AAATTTCTTTTTCCCCGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGATCTAAAT > NC_007779/3764642‑3765115 | aaaTTTCTTTTTCCCCGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCgg < 1:1079650/239‑1 (MQ=255) aTTTCTTTTTCCCCGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTa < 2:1174315/239‑1 (MQ=255) aTTTCTTTTTCCCCGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTa < 1:1268184/239‑1 (MQ=255) ccccGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCa < 2:1094750/239‑1 (MQ=255) ccGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGAGAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACATTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCaga < 2:446854/239‑1 (MQ=255) tttAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGGTCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCCGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGCGCAtg < 2:2155635/239‑2 (MQ=255) tAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCGGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACg < 2:521590/239‑1 (MQ=255) cAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATATCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATTGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAGCCGCCCTTTGCGTTAAGGCAAACCAGGGCATACGAGATa < 1:922005/239‑1 (MQ=255) cAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATa < 2:1883117/239‑1 (MQ=255) aaaTGTTGCGGCTTCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGACCATCTTAACGATGTCATCGGTACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATAc < 2:1586392/239‑1 (MQ=255) aaTCTTGCGACATCGGCAAACTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGAACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGATCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCCGTGATGGTGTATGACAGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTCTGGGAAACCATAGCATACGAGATACa > 2:1053524/1‑239 (MQ=255) aTCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGACGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGTCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACAAGAGCTTACGCAATACa > 2:2087981/1‑238 (MQ=255) gCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAATTGCTGGACCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCTCCATCAGTGATAAGGTAATTCAGCGATTCCCCTACAAAAACATACCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGCTAGCCCAGTGATGGTGTCTGTCTGCGATTAATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCATAGCATACGAGATACCGCCTGa > 2:828723/1‑239 (MQ=255) gCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGa > 1:2149473/1‑239 (MQ=255) gAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTAAAGGAAAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGt < 1:2087981/239‑1 (MQ=255) aaaTATTGTGACGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCAACATCAGTGATAAGGTAGTCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGGCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTAAACTACCCTTTTTTTTCAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGt < 1:1161378/238‑1 (MQ=255) aaTATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTg > 1:1461345/1‑239 (MQ=255) tatTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTTTTGTCAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTggg < 1:6058/239‑1 (MQ=255) gtgCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATgg < 2:651326/187‑1 (MQ=255) gtgCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATgg > 1:651326/1‑187 (MQ=255) tgCCGGTTAAGTGCTGGGTCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATaa > 1:961336/1‑239 (MQ=255) tgCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGaaa > 1:1319764/1‑217 (MQ=255) tgCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGaaa < 2:1319764/217‑1 (MQ=255) gCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATaa > 1:1704645/1‑238 (MQ=255) gTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGa > 1:1666702/1‑183 (MQ=255) gTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGa < 2:1666702/183‑1 (MQ=255) cttgaacATTGAGCATCTTAACGATGTCATCTGCACCATAAGTGATAAGGTAATACAGCGATTCCCCTACAAAAACATACCCTTTTGTTCCATTACTATCTTATGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGGTTCTGACTGCGATAGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACTCGAGCATACGAGACACATCCTGAAAGCATCAGCCCCATGAGGAATAAAACGCCAGCCTTa > 2:2066651/7‑239 (MQ=255) cTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGc < 2:309607/184‑1 (MQ=255) cTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGc > 1:309607/1‑184 (MQ=255) gATCCTTGAGCATCTTAACGATATCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCCTTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGAGTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACAAGAGCATACAAGATACACCCTGAAAGCATCAGCACCAGTGAGAATAAACTGACAGCCTCaaaa > 2:1218931/1‑239 (MQ=255) gATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGCCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATa > 2:394833/1‑191 (MQ=255) ttGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATATCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGATAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACAGTCAGCCTTAAAAAATc > 2:37441/1‑238 (MQ=255) ttGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTAGGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGATAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATc > 1:38816/1‑238 (MQ=255) cgaaTCTTAACGTTGTCATCGGCACCAGCATTGATAAGGTAATCCAGGGATTCCCCTACAAAAACATCGCCTTTTATTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTTATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCt < 2:1503584/235‑1 (MQ=255) ggCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGTTAAGGCAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTa < 1:1397731/239‑1 (MQ=255) cACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCTTTAAGGGAAACGACAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTaa < 1:1520068/238‑1 (MQ=255) cACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTaa < 1:1742404/238‑1 (MQ=255) aCCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAACGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAAt > 1:78125/1‑238 (MQ=255) tCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTaaaaaa < 1:2029161/206‑1 (MQ=255) gATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGTGGTCAAGGAGAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACg < 1:341580/239‑1 (MQ=255) tAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTAAGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGa < 1:1648517/238‑1 (MQ=255) aaGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCTGTGGGAATAAACCGGCATCTTTAAAAAATCCCTTAAAAATCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGCGt > 1:87723/1‑239 (MQ=255) tAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGt < 1:1515134/168‑1 (MQ=255) tAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGt > 2:1515134/1‑168 (MQ=255) aTCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTc < 1:1210998/211‑1 (MQ=255) aTCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTaa > 2:1550823/1‑239 (MQ=255) aTCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCATGAAAGCATCAGCGCCAGTGCGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAAATTCATGATTAATCCTTTAAACTAGTAGCTaa > 2:1466313/1‑239 (MQ=255) tCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGTTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAACATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTaa > 1:1104278/1‑238 (MQ=255) cGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATa > 2:75963/1‑129 (MQ=255) cGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATa > 1:1240339/1‑136 (MQ=255) cGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATa < 2:1240339/136‑1 (MQ=255) gATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTTCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTg < 1:537830/239‑1 (MQ=255) gATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGTGGTCAGGGAGAAGAGGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTg < 1:1218931/239‑1 (MQ=255) gATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAg < 1:1906782/158‑1 (MQ=255) tCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGaaa < 2:1765064/239‑1 (MQ=255) ccTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGCTGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTTCGGCATGGGAGACCAGTCCATACGAGATACAGCCTGAAATCATCAGCGACTGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAATATCCCTTAACATTCAACTTCATGATAAATCTTTTAAACGAGTAGCTAACCGGTTGCAAGCa > 2:50308/1‑239 (MQ=255) tACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATa < 2:1461345/239‑1 (MQ=255) tACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTAAGGCAAACCACAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATa < 1:1964935/239‑1 (MQ=255) aTAGTCTTATGTTCCATTCCTATCTTTTGCCTGCGATAGCACAGTGATTGTTTCTGACTACGATTGATACTTTCCTGATTTTTTTTTTTTTTTCAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCttt < 1:1007934/239‑1 (MQ=255) gCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGAGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAACATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCTTTTAAACGAGTAGCTAAGACGTTGAAAGCATACTCTTCTTTcca > 2:1678174/1‑238 (MQ=255) ttGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAATCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCACCTTCATGATTAATCCTTTATACGATTATCTAAGCCGTTTAAAGAATACTCTTCTTTcctt > 2:809380/1‑233 (MQ=255) ttGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCcct > 2:1058300/1‑235 (MQ=255) tagttataTTACTATCCTTTACCTGAGATCGCCCAGAGATGGTGTCTGACTGCGATTCATACTTTCCTGAAATACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAACATACGATATACACCCTGACAGCATCAGCGCCACTGGCAATAAACAGACATCCTTAAAAAACCCCTCAAAATTCTACTTCATGAGTACTCCGTTAATCTAGTAGCTAAGCCGTTAAAAGCATACTCTTCtttacat > 2:1630819/8‑231 (MQ=255) tGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATAct > 2:165719/1‑223 (MQ=255) ccATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATCCTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATAATCTTCTTTCCCTCCTGTTTa > 2:1408762/1‑238 (MQ=255) cATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACtcttc > 1:1616521/1‑222 (MQ=255) cATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAgc < 1:1813395/239‑1 (MQ=255) aTTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGTGGTAAAGCAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAgcg < 1:449087/239‑1 (MQ=255) aTCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGat > 2:952526/1‑239 (MQ=255) tttGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATcc < 1:2052064/239‑1 (MQ=255) gCGATAGCCCAGTGAGGGAGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACAACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGCGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAATTTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACTACTAGCTAAGCCTTTGAATGCATACTCTTCTTTCCATCCTGTTGACCGCCTGATATCTCTTTTCa > 2:115748/1‑239 (MQ=255) tAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATAGCAAACCACAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGAt < 1:1053524/238‑1 (MQ=255) tGATTGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTGTCTTTTTCTTTCAAGCAGAACACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATActct < 1:699570/190‑1 (MQ=255) aTGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAgcg < 2:2035330/208‑1 (MQ=255) gtgtCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAg > 1:729929/1‑203 (MQ=255) gtgtCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAg < 2:729929/203‑1 (MQ=255) tCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTaa > 2:1812139/1‑151 (MQ=255) tCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTATCGcc > 2:852767/1‑204 (MQ=255) tCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGcc < 1:852767/204‑1 (MQ=255) cTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCTCTCCTGTTTATCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTc > 1:1426353/1‑239 (MQ=255) tGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCATATTTTTGCCCGACCCATGTCa > 2:2001573/1‑239 (MQ=255) tGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCa < 1:509891/239‑1 (MQ=255) cTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCAtt < 1:178477/238‑1 (MQ=255) cTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCAtt < 1:1058300/238‑1 (MQ=255) tGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCAtttt > 1:61821/1‑239 (MQ=255) cGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAgcg < 2:1941904/77‑1 (MQ=255) cGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAgcg > 1:1941904/1‑77 (MQ=255) cGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCATTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTACTCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCAtttttt > 2:2117215/1‑239 (MQ=255) aTACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAATCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTACGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCa > 2:436512/1‑239 (MQ=255) tACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTCAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCAt < 1:115748/239‑1 (MQ=255) aCTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCttttt < 1:50308/238‑1 (MQ=255) aCTACCCTTTGCGGTATGGCAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCttttt < 1:404164/238‑1 (MQ=255) tACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTtgtg < 1:1368097/239‑1 (MQ=255) gccTTTGAGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACAGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTAAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTATTTCCCTCCTGGTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCTGATTTCTGCCCGCCTCATGTAATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGa > 2:2086944/2‑238 (MQ=255) cccTTTGCGGTATGGGAGACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGAt < 1:1467909/239‑1 (MQ=255) cccTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCt < 2:1395198/117‑1 (MQ=255) cccTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGa > 2:252288/1‑238 (MQ=255) accTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAACCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGATCCTGATATACCTTTTCAGATTTCTGCCTGACGCATGTCATTTTTTTATGCTTTGTCCTTTTtgtca > 2:1719014/2‑236 (MQ=255) tGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAACCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTcc > 1:1569440/1‑154 (MQ=255) gCGGTATGGCAAAACAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGATCTAAAt < 2:1437254/239‑1 (MQ=255) | AAATTTCTTTTTCCCCGCATTTAAAACAAATCTTGCGTCATCGGCAACCTGAATATTGTGCCGGTTAAGTGCTGGATCATTGAGCATCTTAACGATGTCATCGGCACCATCAGTGATAAGGTAATCCAGCGATTCCCCTACAAAAACATAGCCTTTTGTTCCATTACTATCTTTTGCCTGCGATAGCCCAGTGATGGTGTCTGACTGCGATTGATACTTTCCTGAACTACCCTTTGCGGTATGGGAAACCAGAGCATACGAGATACAGCCTGAAAGCATCAGCGCCAGTGGGAATAAACCGGCAGCCTTAAAAAATCCCTTAAAATTCAACTTCATGATTAATCCTTTAAACGAGTAGCTAAGCCGTTGAAAGCATACTCTTCTTTCCCTCCTGTTTAGCGCCTGATATCCCTTTTCAGATTTCTGCCCGACGCATGTCATTTTTTTATGCATTGTTCTTTTTGTGATCTAAAT > NC_007779/3764642‑3765115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |