Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,994,338 | 0 | A | G | 10.7% | 344.9 / 2.2 | 144 | D231D (GAT→GAC) | Y75_RS19765 | 23S rRNA (adenine(2030)‑N(6))‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/85); new base G (16/2); total (51/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GTTTAGTCATGACAAAGTGTCCTTATCGTTGATTACCGCGATTGTAGCGCGAGACGTAATAGGTGCCAGCAATGGCTGCAATTACTCCGGCACGATCCAGCTTACGGT‑GGCGTGCC‑CGGTGCCTGCCGGAACCAGTTTGCTGTGCAGCCACGGCAGCACGTTATTCATCTGTTGTTCCAGTTTCCACGGC‑GGGTTAATCACAATCATGCCGGAAGCGGTCATGCCACGGCGATCGCTGTCTGGCAGTACCGCCAGTTCAATTTGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACGCAG‑CACCACCGGATACCACAGTGCGTAAATACCAGTGGCGAAAC‑GTTTGTAACCTTCTGCTATCCCGCTGACCACCGCTTGATAGTCAGTTTTCATTTCATACGGCGGGTCGATAAGGATTAAACCACGGCG > NC_007779/3994107‑3994562 | tttAGTCATGACAAAGTGTCCTTATCGTTGATTACCGCGATTGTAGCGCGAGACGTAATAGGTGCCAGCAATGGCTGCAATTACTCCGGCACGATCCAGCTTACGGT‑GGCGTGCC‑CGGTGCCTGCCGGAACCAGTTTGCTGTGCAGCCACGGCAGCACGTTATTCATCTGTTGTTCCAGTTTCCACGGC‑GGGTTAATCACAATCATGCCGGAAGCGGTCATGCCCCGGCGGTCGCTg > 1:1869422/1‑237 (MQ=255) tttAGTCATGACAAAGTGTCCTTATCGTTGATTACCGCGATTGTAGCGCGAGACGTAATAGGTGCCAGCAATGGCTGCAATTACTCCGGCACGATCCAGCTTACGGT‑GGCGTGCC‑CGGTGCCTGCCGGAACCAGTTTGCTGTGCAGCCACGGCAGCACGTTATTCATCTGTTGTTCCAGTTTCCACGGC‑GGGGTAATCACAATCATGCCGGCAGCGGGCATGCCCCGGCGGTc > 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |