Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,104,281 | C→G | 10.3% | R150R (CGC→CGG) | ompR → | two‑component system response regulator OmpR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,104,281 | 0 | C | G | 10.3% | 291.6 / 5.2 | 140 | R150R (CGC→CGG) | ompR | two‑component system response regulator OmpR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/54); new base G (2/14); total (70/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.13e-01 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AGTCAGAGCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCGTCTGGGGTCTGG > NC_007779/4104045‑4104516 | aGTCGGGGCAACCGGATGCGGATCATTTTGCAGACGGAGGAAGGGGGAGAGGTGGACCGTATCGTGGGCGTGGAGATTGTCGCTGACGGCTACATTCCAAAGCCGTTTAACCCGCGGGAACTCCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGGACTGCCAGGCGCGCCGGCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCCTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTAcgcgcg < 2:910128/238‑1 (MQ=255) agagCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑ATGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACACCGGGACACGCGAAATg > 1:825667/1‑239 (MQ=255) gagCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑ATGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCACGGTACGCGCGAAAAGt > 1:1032274/1‑239 (MQ=255) gagCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGGAATTTGCTTCCGGA‑AGGTTCAAA‑TTAAACCCGGTAACCGCGGAATgg > 2:1801141/1‑238 (MQ=255) gCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATg < 1:1050166/236‑1 (MQ=255) gCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGt < 2:297185/237‑1 (MQ=255) tGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGGAA‑ATGTTGTTGGG‑AAGGTTAAACTTAACCTCGGGACGCCCGGAAAGttgtgcgcgaa > 2:931292/1‑229 (MQ=255) aTCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAAACTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑Gcc > 1:249172/1‑239 (MQ=255) aTCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAAATTAACCCCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAAACGA‑Gc > 1:1082625/1‑238 (MQ=255) aTCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAATTCAAAATTTACCCCGGCAACCGCGAAAAGTTCCGCCAAAACGA‑Gc > 2:1333122/1‑238 (MQ=255) tATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGGATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGCACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCCGG‑TAGCTCTAAATTAAACCCCGGACGGGCGTAAAGTTCCCCGCAGACAG‑GCCgcacc > 2:1080736/1‑235 (MQ=255) tGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTCCATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTCCGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCg < 1:1909388/239‑1 (MQ=255) tGGGGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTACCCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGACCTGCCAGGCGCCCCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCg < 1:1370464/239‑1 (MQ=255) aCGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGGTTTCGGT‑AAGTTCCAACTTAACCCCGGTAAGCGGGGAATGGTCCGCGGAAACCA‑GCCgcttcaccccc > 2:233986/1‑228 (MQ=255) aCGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GGCGCTGCCGCTCa > 1:1920196/1‑238 (MQ=255) aagaagTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGGAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGGTCAAACTTAACCTCGGGACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGCAGCCGCCCACCAGCGGGGGGttt > 1:951236/1‑239 (MQ=255) agaagGGGCCCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTACCCCGCGTGACCTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTACCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTg < 1:701579/239‑1 (MQ=255) aagTGGACCGTATCGTCGGCCGGGAGATTGGCGCGGACGACTACATCCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGACCGGCTGGCCCGTATCCGTGGGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTACCCTCGGTACGCGCGAATTGTCCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTg < 2:118018/237‑1 (MQ=255) agggcaCCGTATCGTACGCCGGGAGATTGGCGCTGACGACTCCATTCCAAACCCGTTTAACCGGCGTGAACTGCTGGCCCGTAGCCGTGCGGTTCTGGGTCGCCAGGCGAACGAACTGCCAGGCCCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAAACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCg < 2:456912/233‑1 (MQ=255) ggACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAACCCGTTTACCCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGt < 1:1463495/237‑1 (MQ=255) gACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGGTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCCCACCAGCCGGGAGTTTTCggg > 1:481141/1‑235 (MQ=255) gACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGGAA‑TTTCTTTTGGT‑GAGTTCAAACTTAACCTCGGTACCCGCGGAATGTTTCGCGGAGACGAGGCCGTGGCCCCCCCCCGGCGGGGGGTTTGGGGtcc > 2:1150178/1‑237 (MQ=255) tATCGTAGGCCTGGAGATTGGCTCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTTCTTTCGGG‑AAGGTCAAACTTAACCCCGGTACGCGCGAAATGTTCCCCGAAGACGC‑GCCGATGCCGCCCCCCAGCGGTGAGCTTGCGGTACTGAAgg > 1:696090/1‑239 (MQ=255) tATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGGTCAAACTTAACCTCGGGACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGGTTGCGGGACTGAAgc > 1:118018/1‑238 (MQ=255) tATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCAAACTTAACCCCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCCCACCAGCGGGGAGTTTGCGGTACTGAAgg > 1:1062852/1‑239 (MQ=255) tAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCCCGGTACGCGCGAAATGGTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGTTTGCGGGACTGAAGGCACTg > 1:283476/1‑239 (MQ=255) ccTGGAGTTGGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTACCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGa < 1:33052/186‑1 (MQ=255) cTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGCATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGCGGCGGGCA‑CTGCCTTCGGG‑AAATTCCAACCCACCCTCTGCAAGCGCGAAAAGTTCCGCGGAGACAA‑GCCCACACACCTCACCAGCGGCGAGATTGCGGGCTCTAAGACACTGGTCAg > 2:26206/1‑239 (MQ=255) tGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGAAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGGTCAAACATAACCCCGGTACGCGCGAAAAGTTCCCCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGGGTTTTCGGTACTGAAGGCAcctgtct > 1:255323/1‑231 (MQ=255) ggAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAATTCAAACTTAACCTCGGAACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGAAGG‑GCCGCTGCCGCCCACCAGCGGGGAGATTGCGGGACTGCAGGCACTGGTAAGc > 1:1267647/1‑238 (MQ=255) gagaTTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGGTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCa > 1:1812010/1‑239 (MQ=255) ggCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGAAA‑TTGCTTTCGGT‑CAGGTCAAACTTTACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCGCACCAGCGGTGGGGTTGCGGTACTGACGGCACTCGTCAGCCATCcccg > 1:1533095/1‑239 (MQ=255) cccAAACCCTTTAAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACG‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTAAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAgg < 1:873208/202‑1 (MQ=255) aaacCCGTTCAACCCGCGAGAACTGCTGGCCGGTACCCGGGCGGTGCTGGGTCTCCGGGCGAACGAACGGCCAGGCGAACCTCCCAA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGGGAAATGTCCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATa < 2:1032274/239‑1 (MQ=255) aaaaCCGTTAAACCGGCGAGACCTGCGGCCCCGTAGCCGGGGAGTGCGCCTGCGGCAGGCAAGCGAACGGCCAGGCTCGCGGCCACG‑GGAAGGGGCGGTAA‑TTTCTTTAGGT‑AAGTGCAAATTTAACATCGGAACGCGGGAAATGTGCCGAAAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATa < 2:248423/239‑1 (MQ=255) tAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGGGTTTGCGGGACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCtgatga > 1:658738/1‑239 (MQ=255) cccGCGTGACTGGCTGGCCCGTATCGGTGCGGTGCTGCGCCGTCAGGCTAACGAACTGCAGGCCGCCCCGTCACC‑GGAAGAGGGAGTAA‑TTTCTTTCGGT‑AAGTCCAAGCTTAACCTCGTTCCGCGCGAAATTTTCCGGGAAGGCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCATCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAAcc < 2:725078/239‑1 (MQ=255) gacctgtgggCCCTTGTCCGGGTGTTGCTGTGCCTTCAGGCGAACTAACTCCCCGGCCCACTCTCACA‑GGAAGAGGCGTTAA‑TTGCTTGCGTT‑AAGTTCATACTGCCCCTCGGTCCGCGCAAATTTTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg < 2:1487337/231‑1 (MQ=255) acctgcggGCCCGTATCCGTGCGGTGCGGCGTCGCCAGGCGAACAAACTGCAAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGGGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTAAACCTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGGGAAGCCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg < 1:612246/236‑1 (MQ=255) acctgcgcgCCGGTATCCGTGCGGTGCTG‑GGCGGGAGGCCAACCGACCGGCCGGCGGATCAGCCCAGGGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTGCGGT‑AAGTTAAAACTTACCCTCGGTCCGCGGGAATTGTCCCGGGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg < 2:487915/230‑1 (MQ=255) ctgGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGGTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGGTGATGAACCTTGCCCGTGGTCg > 1:487915/1‑239 (MQ=255) ggCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCCTTCGGG‑AAGTTCAAACTTAACCCCGGTACGCGGGAAATGTTCCGCGGAGACGA‑GCCGATGCCGCCCCCCAGCGGGGGGTTTTCGGTACTGAAGGAACTGGTTAGCCCTCCGCGGGGGCCGCGCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGctgtcgcctatt > 2:329387/1‑228 (MQ=255) ccccGTTTCCGGGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGGGGTAA‑TGGCTTTCGGT‑AAGTTCAACCTTACCCTCGGTCCGCGGGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAAcc < 1:1877556/222‑1 (MQ=255) cGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCGGGCGAACGACCGGCCGGGCGCCCCGTCACA‑GGAAGAGGGGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTACCCTGGGTACGCGCGAAATTTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAata < 1:1813600/239‑1 (MQ=255) gTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCATCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCAAACTTAAACTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGGGTTTGCGGGACTGAAGGCa > 1:1708728/1‑164 (MQ=255) gCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCaa < 1:1210037/238‑1 (MQ=255) gctggGCCGTCGGGGGAACGAACTGCCAGGCGCCCCGTCACG‑GGAAGGGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTCCGCGGGAAATGTTCCGGGAAGCCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGaa < 1:1801141/238‑1 (MQ=255) cgggggtctcaaGGCGGACGAACTGCGAGGCGCACCGTCGAG‑GGAAGGGGGGGTAG‑TTGCTTTCGTT‑ATGTTCAAACTTACCCTCGGTACGGGCGAATTGTCCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGaa < 2:2069292/227‑1 (MQ=255) ctgcGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGGTTGCGGGACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCCATGGAAc > 1:658383/1‑238 (MQ=255) cgtcAGGCGAACGACCTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTGGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTGGGTACGCGCGAAATGTCCGGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCa < 1:1012574/238‑1 (MQ=255) cgccgggCGAACAGACTCCCAGGGGCACGGTCACA‑GGAGGGGGCGGTAA‑TTTCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTACCTTCGGTAGGCGGTAATTGTTCCGCGAGGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCa < 2:1812506/233‑1 (MQ=255) gtcAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCAAA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGTTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTACCCTGGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATc < 1:1333122/239‑1 (MQ=255) tcAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGGGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCg > 1:2050347/1‑239 (MQ=255) tcAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAAAGGCGGGCA‑TTGCTTTCTGT‑AAGTTCAAACATAACATCGGGAAGCGCGAAATGTGTCGCGCAGAAGA‑GCCGTTGCCGCTCGCCAGCTGAGGGGTTGGCGTACTGGAGACACTAGCGAGCCCTCCGCGGGAGTCCCTCTACCGCGGTAACCTGATGAACACTCCCCGAGGGCGTGAAGATTTCTCAATgggtccaccactc > 2:2116283/1‑227 (MQ=255) cAGGCGAAGAAACGGCCGGCCGAACGGTCGAG‑GGAAGAGGGGGTAA‑TTGCTTGGGGT‑AAGGTAAACTTTACCCTGGGTAGGGGGGAATTGTGCCGGGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGa < 2:1360500/239‑1 (MQ=255) cAGGCGAACAAACTGCCAGGCGCACCGTAACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTGGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCg < 1:1150178/238‑1 (MQ=255) cgaacgaaCTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCCAACCTAACCCCGGGACGCGCGGAATGGTCCGCGAAGACGA‑GCCCATTCCGCCCACCAGCGGGGAGTTTTCGGGACTGAAGGCACTGGGCAGCCATCCGCGCGGGCCGCCCTCCCCCGGTAAACTGAAGAACCCTCCCCCCGGCCGTGAATATTTCGCGATGGAACGCTcccaccacgg > 2:355163/1‑230 (MQ=255) gaacgaacTGCCAGGCGCACCGTCACG‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTg < 1:1251449/238‑1 (MQ=255) accTGCCAGCCCCCCCGTCAAG‑GGAGGGGGCGGTAT‑TTGCTTTCGGT‑AGTTTCAAACTTACCCTCGGTACGCGCGAAATGTCCCGCGAAGAGGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGaa < 2:249633/216‑1 (MQ=255) tGCCAGGCGCACCGTTACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTTCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGGGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGGGGGCGGGAATATTCCGCCATGGAACGCCCCATCg > 1:2147711/1‑225 (MQ=255) ccggCGCACCGTCCCA‑GGAAGAGGCGTTAA‑TTGCTTTCGTT‑AGGTTCAAACTTACCCTCGGTAGCCGCGAAATGTCCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGt < 2:798950/237‑1 (MQ=255) gcggcccGTCACA‑GGAAGGGGCGGTAA‑TTGTTTGCGGT‑AAGTTCAAGCTGACCCGCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGAGGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCt < 2:591631/233‑1 (MQ=255) cGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGG‑AAGTTCAAACCTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGGGAGTTTGCGGTACAGAAGGCACTGGTCAGCCATCCCCGTGAGCCGCTCTCCCGCGGCAAGCTGAGGAGCCTTTCCCGGGGTCGGGAATATTc > 2:82939/1‑193 (MQ=255) gTCACA‑GGAGGAGGCGGTAA‑TTTCTTTGGGT‑AAGTTCAACTTTAACCTCGGTCCGCGCGAATTGTTCCGGGAAGCCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCa < 1:1133306/239‑1 (MQ=255) tCACG‑GGAAGAGGCGTTAA‑‑TGCTTTCCGTAAATTTCAAACTTACCCTCGGTCCGCGCGAATTGTCCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCa < 1:931292/238‑1 (MQ=255) tCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGTTTTCGGT‑AAGTTAAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTc < 1:1371147/181‑1 (MQ=255) caca‑GAAAGGGGGGGTAA‑TTTCTTGCGGT‑AAGTTAAAACTTACCCTCGGTACGCGGGAATTGTCCGGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGcgccgc < 1:1720605/236‑1 (MQ=255) agacggaaaGGGGCGGTAT‑TGGCTTTGGGT‑AGGTTCAAACTTACCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCGGCGAAGCGGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCa < 1:352215/231‑1 (MQ=255) aca‑GGAAGAGGCGTTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTCCGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCAtgg < 1:49830/239‑1 (MQ=255) gAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGGGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg < 1:78269/170‑1 (MQ=255) gaggggtgttta‑TTGCTGTCGGT‑AGGTTCAAACTGACCCGCGGGCCGGGGGAATGGTCCCGCGAGGCCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGga < 2:1703681/227‑1 (MQ=255) agGCGGGAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAAACCCGGTAAGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCCCACCAGCGGTGAGTTTGCGGGACTGAAGGCCCCGGTCAGCCCACCCCGGGAGCCGCTCCCCCGCGATAAGCTGATGGACCTTGCCCCTGGTCGGGAACATTc > 2:1371147/1‑181 (MQ=255) ggTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGGACTGaa > 1:883093/1‑102 (MQ=255) ttCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATcc > 2:1621942/1‑239 (MQ=255) tCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCa > 1:2076231/1‑230 (MQ=255) cGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCcgc > 2:722391/1‑239 (MQ=255) cGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCcgc > 2:322383/1‑239 (MQ=255) cGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCcgc > 1:1696087/1‑239 (MQ=255) t‑AAGTTCAACCTTACCCTCGGTACGCGAGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGt < 1:1821829/238‑1 (MQ=255) t‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg < 1:383885/147‑1 (MQ=255) t‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCg > 2:383885/1‑147 (MQ=255) t‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGt < 1:1586312/238‑1 (MQ=255) aaGTTCAAACTTACCCTCGGTCCGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGtt < 1:233986/238‑1 (MQ=255) accTTACCTTCGGTACGCGCGAAATGTCCCGGGAGGGCGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAg < 2:560106/237‑1 (MQ=255) aaCTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGa < 1:456517/163‑1 (MQ=255) ccTTAACCTCGGTACGCGCGAAATTTTCAGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGa < 1:1343627/238‑1 (MQ=255) aCTTAACCTCGGTACGCGGAAAATGTCCCGGGAGGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGa < 1:26206/239‑1 (MQ=255) aCTTAACCTCGGTACGCGCGAGATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAg > 1:311981/1‑238 (MQ=255) ttAACCGCGGTCCGCGGGAAAGGGCCCGGGAGGACGA‑GCCGAGGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGAc < 1:2030800/238‑1 (MQ=255) aCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCg > 1:617404/1‑237 (MQ=255) aCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCg > 1:1208872/1‑237 (MQ=255) aCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCg > 2:569325/1‑237 (MQ=255) aCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCg > 1:1701462/1‑237 (MQ=255) aCCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCg > 2:1824552/1‑237 (MQ=255) ggTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGaa > 2:649374/1‑153 (MQ=255) ggTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGaa < 1:649374/153‑1 (MQ=255) ggTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCgtctgggg > 2:2055355/1‑239 (MQ=255) cgcgAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCgtctggggtctgg > 2:644884/1‑238 (MQ=255) gcgAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGt < 1:1989301/212‑1 (MQ=255) gcgAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGt > 2:1989301/1‑212 (MQ=255) | AGTCAGAGCAACCCGATGCCGATCATTATGGTGACGGCGAAAGGGGAAGAAGTGGACCGTATCGTAGGCCTGGAGATTGGCGCTGACGACTACATTCCAAAACCGTTTAACCCGCGTGAACTGCTGGCCCGTATCCGTGCGGTGCTGCGTCGTCAGGCGAACGAACTGCCAGGCGCACCGTCACA‑GGAAGAGGCGGTAA‑TTGCTTTCGGT‑AAGTTCAAACTTAACCTCGGTACGCGCGAAATGTTCCGCGAAGACGA‑GCCGATGCCGCTCACCAGCGGTGAGTTTGCGGTACTGAAGGCACTGGTCAGCCATCCGCGTGAGCCGCTCTCCCGCGATAAGCTGATGAACCTTGCCCGTGGTCGTGAATATTCCGCAATGGAACGCTCCATCGACGTGCAGATTTCGCGTCTGCGCCGCATGGTGGAAGAAGATCCAGCGCATCCGCGTTACATTCAGACCGTCTGGGGTCTGG > NC_007779/4104045‑4104516 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |