Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 812,143 | T→G | 29.8% | V67G (GTG→GGG) | bioC → | malonyl‑ACP O‑methyltransferase BioC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 812,143 | 0 | T | G | 29.8% | 193.2 / 17.8 | 103 | V67G (GTG→GGG) | bioC | malonyl‑ACP O‑methyltransferase BioC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/63); new base G (33/2); total (38/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.40e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GAAATGCAGGATATCGACCGTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAAACAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGCCTTACTGGCAATGCTTCCACAGCGTAAATACACCCACGTACTGGACGCGGGTT‑GTGGACCT‑GGCTGGATGAGCCGCCACTGGCGGGA‑ACGTCACGCGCA‑GGTGACGGCCTTAGATCTCTCG‑CCGCCAATGCTTGTTCAGGCACGCCAGAAGGATGCCGCAG‑ACCATTATCTGGCGGGAGATATCGAATCCCTGCCGTTAGCG‑ACTGCGACGTTCGATCTTGCATGGAGCAATCTCGCAGTGCAGTGGTGCGGTAATTTATCCACGGCACTCCGCGAGCTGTATCGGGTGGTGCGCCCCAAAGGCGTGGTCGCGTTTACCACGCTGGTGCAG > NC_007779/811907‑812372 | gAAATGCAGGTTATCGACCTTCTGCTGGAGGTGCTGCATGGCAACGGTTAATAACCAAGCCATTGCAGCGGCATTTGGTCGGGCAGCCGCACACTATGAGCAACATGCAGATCTACAGCGCCAGAGTGCTGACGCCTTACTGGCAATGCTTCCACAGCGTAAATACACCCACGTACTGGACGCGGGTT‑GTGGACCT‑GGCTGGATGAGCCGCCACTGGCGGGA‑ACGTCACGCGCA‑GGTGa < 1:2057860/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |