Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 249,538 | T→G | 35.1% | H187P (CAC→CCC) | flhA ← | flagellar type III secretion system protein FlhA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 249,538 | 0 | T | G | 35.1% | 99.4 / 16.5 | 99 | H187P (CAC→CCC) | flhA | flagellar type III secretion system protein FlhA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/30); new base G (24/15); total (54/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTT > NC_007779/249300‑249773 | cTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGt > 1:559787/1‑239 (MQ=255) gcgCGGTTTCCCCTGTGTTTTGTCCGCCAGCCACCCCGTTTTGTAACCGAGGTTTAAACTGTAGGGTTCGATCAGCGGAAGGGTTTCCCAACTGACCCGCTCCTCGCTGGTTTCGTTAAAGGTTGGGTTGATCGTTTCGAGGCTTTTCCCTTCCGCCTCCC‑CCGCC‑AGC‑TGC‑TGTTT‑ACGCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCa < 2:1938723/237‑1 (MQ=255) aGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACCGCC‑GGGGGGGcgt > 2:2080800/1‑237 (MQ=255) cGGGTTCCCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCCCCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCAtt < 1:1171379/238‑1 (MQ=255) cGGGTTACCCGGTGCTTTGTCCCCCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCATCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCGCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCAtt < 1:1299386/238‑1 (MQ=255) aCCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTTACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGGGGCACTccccgga > 2:422271/1‑235 (MQ=255) tgtgCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGGGGCGTTCCCGGGac‑ca > 1:517227/1‑238 (MQ=255) tgCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAGAAACGGCA‑GGGGCGGCCATCCCGGGac‑cacc > 1:218424/1‑238 (MQ=255) gCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTATCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCCTCCC‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAAGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGTGGCCTTACCCGCac‑caccc > 2:2051758/1‑237 (MQ=255) tGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGGAA‑CACCGcccg > 1:1648029/1‑236 (MQ=255) tGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGGGGCCATCCCGGGAC‑CCCCGcccg > 1:1303997/1‑236 (MQ=255) gTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGGGGGCATCCCGGTAC‑CACCGccccc > 2:1898527/1‑235 (MQ=255) ccaccaGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAACCTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGCCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑Cg < 1:1631488/239‑1 (MQ=255) accaGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGGGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGa > 1:265506/1‑238 (MQ=255) accaGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCC‑CGa > 1:2004560/1‑238 (MQ=255) ccaccaGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCTGTAG‑CACCCCCAGCC‑AGAAAATaaa > 1:911840/1‑237 (MQ=255) ccaccaGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCC‑CGAACATAAt > 1:310857/1‑238 (MQ=255) tGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGGGGCGCTCCCGCTAC‑CACCCCCACCA‑CGAAAAAAAACCCgcgggtg > 2:1379586/1‑233 (MQ=255) aGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCCGCCGGTAAACCCAAGCAGGGCGCGGAAAAGCCAAAACCGCAGGGTGGGGGCTTCCC‑GTAC‑CCCCCCCCCCACCAAACAAAACCCCGGGGGCgggga > 2:1510168/1‑233 (MQ=255) aGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCCGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACAAAATCCCGGTGGCGGTGTagag > 1:2149126/1‑239 (MQ=255) aGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTaga > 1:1914403/1‑238 (MQ=255) aGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAAACCCGGTGGCGGGGTagg > 1:745297/1‑237 (MQ=255) aGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGGAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGCAC‑CACCGGCAGCA‑CGAACATAAACCCGGGGGCGGGGgaga > 1:1835299/1‑238 (MQ=255) gCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGTagaga > 1:1886798/1‑237 (MQ=255) gATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGGAC‑CCCCGCCCACA‑CGAACATAAACCCGGGGGCGGTGTTGAGCAcccgcgg > 1:1129300/1‑232 (MQ=255) aTAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCCTCCG‑CCAGCCGGTAAAACCCAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGTA‑CGGGGGGGGTTCCCCGGAC‑CCCCCCCCGCC‑CGAAACAAATCCCCGTGGTGGCGGAGCGCAccccacgg > 2:1249494/1‑231 (MQ=255) aTAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CCCCGCCAGCA‑CCAACAAAATCCCGGGGGCGGTGTGGAGCCCCCACcgg > 1:1636264/1‑237 (MQ=255) aTAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTCGAGCACCCACAGGCt > 1:1541140/1‑239 (MQ=255) aTAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGCCCCCACggg > 1:567900/1‑237 (MQ=255) cTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCACGCCGGGCGCTGAACAGCAACAAAGGCC‑GGCGCGGGCTTCCCCGTCA‑CACCCCCCGCA‑CCAACAAACACACGGGGGCGGGGGAGGGCAACCACAGGcggggcc > 2:1613289/1‑233 (MQ=255) gATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCCATCCCCGGAC‑CCCCCCCACCC‑CCAAAAAAAAACCGGGGGCGGTGGAGGGCACCGACGCGCGTGcccccg > 2:223885/1‑235 (MQ=255) tcaatgcgccggTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCAATCCCGGGAC‑CACCGCCCGCA‑CGAAAATAAACCCGGGGGCGGGGGAGAGGACCCACCGGCCTGCcagcac > 1:1077508/11‑237 (MQ=255) cGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACACAATCCCGGGGGCGGGGTCGAGGACCCACCGGCCTGCCCCCAGCAggg > 1:1381169/1‑238 (MQ=255) cGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGGAGAGCACCGCGGGGCTTGCCACCACCTGGt > 1:313271/1‑239 (MQ=255) gtttccccACCTGACCTGCTGCTCGCTGTTTTCGGTGATGGTGCGGTTCAGCTTTTCGAGGCTTTTCTCTCCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCCCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGc < 1:385183/233‑1 (MQ=255) tCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTTCCAGCAGCTGGTTACGCACGTc > 1:2082028/1‑239 (MQ=255) cAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCCTTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGCACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCCACCGGCTTGCCAGCAGCTGGCTACGCACGTCATg > 1:546455/1‑239 (MQ=255) tGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATACTCCCGGTGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACCCCATGGGc > 1:1091494/1‑238 (MQ=255) gACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTagag > 1:948094/1‑195 (MQ=255) gACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGGTACGCACGTCATGGGCGa > 1:756133/1‑239 (MQ=255) aCCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCCTTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCACCCGGTTACGCCCCTCATGGGCggt > 1:1888214/1‑237 (MQ=255) ctCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCCGCAGCCGGCTACGCACGGCATGGGCGATATCGCCGt > 1:2092986/1‑239 (MQ=255) cGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCACTCCCAGTAC‑CACCGCCAGCC‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGTCAGCACCTGGTTACGCACGTCACGGGCGGTATCGcccgtg > 1:639477/1‑235 (MQ=255) gTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGcggg < 1:2079593/153‑4 (MQ=255) tCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGGTACGCACGTCCAGGGCGATATCGCCGTTGTCGCCGAc > 1:126818/1‑239 (MQ=255) tCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGCACCCACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGAc > 1:1396958/1‑239 (MQ=255) gATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCCTTCCCGGGAC‑CCCCGCCAGCA‑CCAACAAAAACCCCGGGGCGGTGGAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCCGGGTACCCCCGTCCTGGGCGCAATCGCCGCGGTCGACGACGCggg > 2:2104253/1‑239 (MQ=255) gtGGTGCGGGTCCGTTTTTCGGGGCTTTTC‑CCCCCCCCCCCC‑CCCCC‑CGT‑GGCTTTTTT‑CCCCCTCCGCCCAGCCGGTAAACCCAGGCGGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCG‑GGGGCGGCATCCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCgg < 2:1077508/237‑1 (MQ=255) gcctttcgggggCTTTTCTCTCCCGCCCCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TTTTG‑GCCCACCCC‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgc < 1:422271/229‑1 (MQ=255) gttttCGCGGTTTTTCCCTTCCGCCCCCGCCCCCC‑GGG‑GGC‑TTTTC‑GCCCACCCC‑ACAGCGGTAAAAACCAAGCGGGGCGCTGAACAGAAAAAGCGGCA‑GGGGGGGCATTCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgc < 2:2149126/236‑1 (MQ=255) cGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGGTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGGGACGATAATcccc > 1:1835459/1‑238 (MQ=255) cGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCA‑CGAAAATAATCCCGGGGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGGTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGGTGTCGCTGACGCGGGTGCAGATAATcggc > 1:1813161/1‑236 (MQ=255) gTTTCGAGTCTTTTCTCTCCCGCCCCCG‑CCGCC‑AGC‑GGT‑TGTTT‑GCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgccg < 1:186417/238‑1 (MQ=255) ttttcggCTTTTTTCTGCCGCC‑CCC‑CCGCCGAGCGGGG‑TGTTTGGCCCCCCCC‑CCAGCCGGTAAAACCAAGAAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATCCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgccg < 2:1367444/233‑1 (MQ=255) ttCGGGGCTTTTCTCTTCCGCCCCCC‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCG‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgccgccg < 1:1552961/239‑1 (MQ=255) tgcGAGTCTTTTCCCTGCCCCCCCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAACCGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CTCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATcgccgccg < 1:2158030/237‑1 (MQ=255) tttccccccccgcccccc‑ccGCC‑CGG‑GGC‑TGTTT‑GCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAACCCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGga < 1:397354/229‑1 (MQ=255) tctcCCCCCCCCG‑CCCCC‑AGG‑GGC‑TGTTT‑GCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGagcag < 1:136582/239‑1 (MQ=255) cctcccgccccgg‑ccGCC‑AGG‑GGT‑TGTTT‑GCTCCCCCC‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGagcag < 1:1031602/235‑1 (MQ=255) ttCCGCCCCCC‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAgcagca < 1:1281667/239‑1 (MQ=255) tccccccccccccgcc‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCACCCC‑CCACCCGGTAAACCCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCTTTCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAgcagca < 1:1228632/228‑1 (MQ=255) ccgcccccg‑cccCC‑GGG‑GGC‑TTTTT‑GCCCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCagg < 1:1864862/239‑1 (MQ=255) cctccg‑ccGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGGGACGATAATCGCCCCCGCGGGGGAGAGCAGCagggaa > 1:1761492/1‑239 (MQ=255) ccg‑ccgCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGGTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTTACGCGGGTGGCGGTAATCGCCGCCGCGGTGGGGAGCCGCcgggaaggg > 1:455799/1‑239 (MQ=255) gC‑TGTTT‑GCCCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCGTTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGccac < 1:1693549/238‑1 (MQ=255) gCTCACCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAACCGGCG‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGt < 1:1898527/239‑1 (MQ=255) cccAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCAGAAAAGCAAAAACGGCG‑GGTCCGGGGTTCCGGGTAC‑CGCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATg < 1:1094853/238‑1 (MQ=255) ccAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTg > 1:1841197/1‑216 (MQ=255) gCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGGGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGCCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCt > 1:524437/1‑159 (MQ=255) ggacgaaacCCAAGCGGGGCCCAAAACAGCAAAACCGGCA‑GGGGGGCCATCCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtca < 2:501841/233‑1 (MQ=255) ccGTTAAACCCAAGCAGGGCGCAGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtca < 2:546455/238‑1 (MQ=255) cGGTAAACCCAGGCGGGGGGAGGACCAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CGCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCAGGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtcat < 2:75108/238‑1 (MQ=255) cGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtcatc < 1:1268654/239‑1 (MQ=255) cGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtcat < 1:946641/238‑1 (MQ=255) ggTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAACCGGCA‑GGTGCGGCTTTCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGtcatca < 1:1510168/239‑1 (MQ=255) acccAAGCAGGGCGCTGAACAGAAAAAACGGCA‑GGGGGGGCTTTCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGcaca < 2:126818/237‑1 (MQ=255) acacAAGCAGGGCCGTG‑ACAGAGAAAATGGGC‑GGGGGGGCGCTCCCGGTGCACACCGCCCGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGAAGCTGGTTACGAACGTCAGGTGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGcaca < 2:791489/236‑1 (MQ=255) aCCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAACCGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACAt < 1:135460/239‑1 (MQ=255) ccAAGGAGGGCGCAGAACAGGAAAACCGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTCC‑CCCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGGGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATa < 1:2104253/239‑1 (MQ=255) ccAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAAGGGCG‑GGGGGGGCATTCCCGGACC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGGGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATa < 1:1018372/239‑1 (MQ=255) ccAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATa < 1:1325315/239‑1 (MQ=255) ccAAGCAGGGCGCTAAACAGCAAAAGCGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATa < 1:1573778/239‑1 (MQ=255) caggCAGGGCGCGAAACAGAAAAGCCGGAC‑GGGGCGGATTCCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATAc < 2:1761492/236‑1 (MQ=255) cAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGGGGAGAGGAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGGCATCAGCACATAct > 1:856444/1‑236 (MQ=255) ggCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGGCATCAGCACATa > 1:501841/1‑231 (MQ=255) ggCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGGAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACAAAATCCCGGGGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCCCGGCAGGGGCGGAATCGCCGGTGTCGCTGACGCGGGGGCCGATAAATGCCGCCCCCGGTGAGGGGAGCAGGGGAGGGGACTGGGCCACCAAGGCGGCGCCGGCGGGCATCCGCACCAACCGCTggg > 2:590768/1‑238 (MQ=255) gcagagaaaggCAAAACCGGCG‑GGTGAGGCATTCCCGGTAC‑AACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGGGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCGCCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATActgctg < 2:1201331/226‑1 (MQ=255) ggtGAACAACAAAAACGGCA‑GGGGCGGCTTTCCCGGTCC‑CGCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAgg < 2:1619253/237‑1 (MQ=255) ccgCAAAACCGGCC‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCAt < 1:2043078/237‑1 (MQ=255) aGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCCTCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATc > 1:1392407/1‑239 (MQ=255) aGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGGGGCGGTGTAGAGCACCCACGGGCTTGCCAGCAGCCGGGTACGCACGTCATGGGCGGGATCGCCGGTGTCGCTGGCGCGGGGGGCGATAATCGCCCCCCCGGGGGGGGGCCGGCGGGGAGGGGTCTGGGCCCCCCAGCCCGCGCCGGGGGTCACCCGCACCAACCGCCGGGAGgcaccaa > 2:629264/1‑237 (MQ=255) aaaacCGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATc < 1:1680813/236‑1 (MQ=255) cacgggCG‑GGGGCGGCCTCCCCGGTCC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGGGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGgcgc < 2:643663/235‑1 (MQ=255) aCGGCA‑GGGGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGGGGAGGGCAGCCGGGAAGGGAGCTGCGCCACCAGGCCGCCGCCGGGGGTCCACCGCCCAAAACGCTGGAAGGGCGCATCGgcgcc > 2:2052517/1‑237 (MQ=255) cgtcA‑GGTGGGGCATTCCCGGTAC‑CGCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGGTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCt < 2:1813161/234‑1 (MQ=255) ggggTGGGGCTTCCCGGGTAC‑CCCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAgg < 2:1648029/236‑1 (MQ=255) aggttGCGGCAGGCCGGGGAC‑CGCCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGGTCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGAGGATAATCGTCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAgg < 2:2025850/234‑1 (MQ=255) a‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGt < 1:2052517/238‑1 (MQ=255) gggTGCGGCTTTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGt < 1:1613289/237‑1 (MQ=255) tGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGtt < 1:629264/236‑1 (MQ=255) | CTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCG‑CCGCC‑AGC‑GGC‑TGTTT‑GCTCATCCG‑CCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCA‑GGTGCGGCATTCCCGGTAC‑CACCGCCAGCA‑CGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTT > NC_007779/249300‑249773 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |