Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,521,793 | C→G | 11.1% | intergenic (+15/‑183) | curA → / → Y75_RS07665 | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase/DNA‑binding transcriptional regulator McbR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,521,793 | 0 | C | G | 11.1% | 302.6 / 4.6 | 135 | intergenic (+15/‑183) | curA/Y75_RS07665 | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase/DNA‑binding transcriptional regulator McbR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/73); new base G (12/4); total (56/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGTTGAGAA > NC_007779/1521555‑1522028 | cTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACAGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGATTCAAAGgcg‑gcgg > 1:1629691/1‑238 (MQ=255) gAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑aa > 1:533113/1‑239 (MQ=255) aaaaaaCGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑aa > 1:936681/1‑238 (MQ=255) aaaaaaCGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAAAGGCG‑GCGT‑aa > 1:728575/1‑238 (MQ=255) tATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGGTGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GGGT‑AA‑G‑CCGCCATa > 1:1019335/1‑239 (MQ=255) ttCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GGGT‑AA‑g‑ccgcccataa > 2:851606/1‑234 (MQ=255) tGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CTGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑GA‑A‑CCGCCACacaaaacat > 2:464163/1‑235 (MQ=255) tGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGAAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGATTCAACGGCG‑GGGG‑AA‑A‑CCGCCAAAAACAttcc > 1:938745/1‑236 (MQ=255) gCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAg > 1:437006/1‑239 (MQ=255) ttttcttgcggCTAAGGATT‑TGGTCACCCGCACCAATGTGTTTCGGGGGGAGATGGGGCAAGGGGGGAAAGAGGAAAAAATCCCCTACCGCGAAGAAATTACTGAGGGTTTAGAGAAGGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGTTAAAACCTT‑CGGAAA‑AGGGGTGACCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGA‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCaaaa < 2:1232180/229‑1 (MQ=255) ttattaTCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCaaaaa > 1:1232180/1‑238 (MQ=255) tattatCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGc < 1:274435/239‑1 (MQ=255) tattatCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTAAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTCCCGCGAAGAAATTACTGACGTTTTAGAGAATGCGCCACAGCCGTTTATCGGCCTGCGGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGc < 1:1455076/239‑1 (MQ=255) gCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑A‑CCGCCCTAAAAAACCCGGGAAAAAACTtttttt > 1:325018/1‑239 (MQ=255) gCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGGTGGTTAAAAATTCAAAGGCC‑GGGG‑GA‑G‑ACCCCATAAAAAACTAGGGAAAAAAATTAtttt > 2:1894135/1‑239 (MQ=255) tGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaatt > 1:1494358/1‑239 (MQ=255) tGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTACACGGCG‑GGGT‑AA‑A‑GCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaatt > 1:1379736/1‑239 (MQ=255) tGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGTAAA‑G‑CCGCCCTAAAACACAAGGAAAAAACCTtttttttgcttttaat > 2:1382971/1‑229 (MQ=255) ggTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTTAGC‑Tttaatta > 1:1279503/1‑239 (MQ=255) cccctagtcaaTGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGAAATGAGTGAAAGAGTATAAATTCCACCACCGAGAAGAAATTGCGGGGGTTTTAGAGAAGGGGCCACAGAGTTTTTTCGGCTAGCTGAAGGGTAAAAACTT‑‑GGCAAGAGTGGTAATCCGCGTGAAGGGTGATGATTAAATTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaact < 2:1629691/229‑1 (MQ=255) a‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GGGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGGAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaaata > 1:278094/1‑239 (MQ=255) a‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGAATAAAAGTTCAAAAGCG‑GCGT‑AA‑T‑ACCACATACAAATCCAGGCACAACACTTCATTTCAGA‑Cttaattaaatc > 2:1581474/1‑236 (MQ=255) cGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑A‑CCGCCCTAAAAAACCAGCGAAAAAACTTATTTTTAGC‑TTTTATtaactaa > 1:2049173/1‑238 (MQ=255) aaaccATGGTTTTCAGGGGGTAGTGGGGGCATGTGTAAAAGAGTATAAAATACACTCCCGGGAAGAATTTACTGAGGGTTTAGAGAATGCCCCGCAGGCGTTTAGCGGCCTGCAGAAGGGTAAAATCTT‑GGGCAA‑AGTGGTGACCCGCGTGGCGGTTGATAATTAAAGTTTAATCGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGTCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑Cca < 2:278094/236‑1 (MQ=255) aGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGGTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTTAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACCTTAttt > 1:1572114/1‑238 (MQ=255) tttCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGTTGATTAAAGTTTCCACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAAACCAGGCAAAAAAGTTATTTTTAAC‑Tttaattta > 1:969979/1‑220 (MQ=255) ttCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGGTGGTGAAAGGTTTAACGGCG‑GGGG‑AA‑GTCTCCCCAAAAAATACAGGGAAAAAACTAATTTTTGGT‑TTTAATT‑ACTAA‑CCACATCACTGttt > 2:1642098/1‑238 (MQ=255) aaggggggagtGGGGAAAGGGGAGAAAAGGAAAAAAACCCACTCCCGGGAAGAATTTCCTGAGGGTTAAGAGAAGGGCCCACAGACGTTTAGCGGCCGGCGGAAGGGTAAAATCTT‑CGGCAA‑GGTGGTGACCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCACCGGCG‑GCAT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTctg < 2:1323151/229‑1 (MQ=255) aTGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCTCTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGCCGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑TGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑T‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 1:963748/238‑1 (MQ=255) tGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCGCTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCtaat < 1:234139/237‑1 (MQ=255) cAAGGGGTGATATGGGATAAACTCCAGTGCCGCAAAGAATATATTGGTGTTGTAGCTAATGCTGCAGAGTGTTTTATGGGCATGATGAATTGTAAAAATTT‑GGATGA‑AGTTGTGATCCGGGAGGCGGGTGGTGAATAATTTTTCACGGGCG‑GTTT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAGTTTCAGC‑GTTAATTAACTAA‑CCCCATCATTGTTCTGCTGCTAATAacaaca < 2:150929/239‑1 (MQ=255) aTGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCCGCCTAAAAATCCAAGGAAAAAACTTATTTTTTGC‑CTTAAATAACTAACCCACA‑CATTTTTCTTCTGCTAATAATAACaaa > 2:825956/1‑239 (MQ=255) gAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAAAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCCCAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGTTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 1:1382971/238‑1 (MQ=255) gAAAGAGGATAAAATCCACACCCCCAAAGAAATTACTGACGGTTAAGAGAATGCACCACAGACTGTGAGCGGCCTGCTGAAGGGAAAAAGCTG‑CGACAA‑AGTGGGGATCCGAGTGGAGGGTGATGATTAAGTTTTCAACGGCG‑TGGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 1:1190128/239‑1 (MQ=255) gAAAGAGGATAAAACCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 1:851606/239‑1 (MQ=255) aaaaGAGGAAAAAACCCCCTCCCGCAAAGAAATTACGGACGGTTTAGAGAAGGCGACAAAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAATTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGGGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 2:1279503/238‑1 (MQ=255) aaggagaATAAAACCCACTACCGCGAAGAAGTTACTGACGGTTAAGAAAAGCCGCCACGGACGTTTAGCGGCCTGTTGAAGGGTAAAACCTT‑CGAAAA‑GGTGGTGATCCGCGTGGGGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCTT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 2:936681/235‑1 (MQ=255) aaaGAGGAAAAAATCCACTCCCGCAAAGAAATTACTGCGGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGATAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 2:437006/238‑1 (MQ=255) ggAAAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGAAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGtt < 1:531664/238‑1 (MQ=255) aTAAAACCCACTCCCGCGAAGAAATTACGGACGGTTAAGAGAATGCGCCCGGGTCGTTTAGCGGCGGGCTG‑AGGGTAAAAACTTGCGGAAG‑AGGGGTGATCCGGGGGGCGGGTAAAGATAAAATTTTCAACGGGG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTAt < 2:1227361/239‑1 (MQ=255) aTCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑CCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGatta < 1:2124732/239‑1 (MQ=255) cccctcccGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCGGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑GGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 1:1894135/233‑1 (MQ=255) ccACTCCCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 1:270968/239‑1 (MQ=255) ccACTACCGGGAAGAAATTCATGAGGGTTTGGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTC‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 2:2042535/239‑1 (MQ=255) ccACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 1:1654705/239‑1 (MQ=255) ccACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCAACAGACGTTTATCGGCCGGCTGAAGGGAAAAAACTG‑GGAAAA‑AGGGGGGATCCGCGTGGAGGGTTATAATTAAAGTTTCAACGGGG‑GCAA‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 1:1208708/239‑1 (MQ=255) tACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGATTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAAAAAAGGTGA‑GGGGGTTATGATTATTCACt > 1:1585721/1‑239 (MQ=255) gcaaagaaATAACGGAGGTTTGAGAGAAGGCGCCACAGACTTTTAGCGGCCTGATGAAGGGTAAAAACTT‑CGGAAA‑AGTGGTGACCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTaa < 2:1585721/236‑1 (MQ=255) cgAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCCTAAAAATCCAGGGAAAAAAGTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACGACATTGTTTTGCTGCTTATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAAt > 1:1168226/1‑239 (MQ=255) cgAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGGAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAAAAACAAAGGTGA‑GAGGTTTATGATTATTCACTTTAAt > 1:2042535/1‑239 (MQ=255) cgAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAACTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCAcatca > 1:1329926/1‑184 (MQ=255) aagaaATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTTACTTTAATac > 1:1257030/1‑239 (MQ=255) aaaaTTACTGACGGTTTAGAGAAGGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACCTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATacac < 1:1581474/238‑1 (MQ=255) aaTTACTGACGGTTTAGAGACTGCGCCGCAGACGTTTGTCGCGCGGCTGAAGGGTAAAAGCTT‑CGGCAA‑AGGGGTGACCCGCGTGGCGGGTAATGATTAAAGTTCAAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCGCTTTAATacac < 2:500351/237‑1 (MQ=255) aaTTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATacac < 1:443387/237‑1 (MQ=255) cTGAGGGTTAAGAGAATGGGCCACAGACGTTTACCGGCCTGGGGAGGGATAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGa < 2:325018/239‑1 (MQ=255) ggTTTAGAGAAGGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGGGTGGCGGGTGATGATTAAATTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCAc < 1:1476489/217‑1 (MQ=255) tcgagaATCGGCCAGAGACGTTTGTCTGCCTGCTGAAGGATAAAAACGT‑CGGCAA‑AGTGGTTATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCt < 2:1019335/237‑1 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGG‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAACTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GGGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgca > 1:105512/1‑239 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGGTTCAACGGCG‑GGGT‑AA‑A‑CCGCCCTAAAAATCCCGGCAAAAAACTTATTTTTCGC‑TTTTATTAACTAA‑AACCAACAATTGTCTCCTGCCAATAAAAACAAAAGGGAGGGGGTTTATATTTTTTCCTTTTAATA‑AC‑CAAGGGAATTTCCTTCTG‑ccttca > 2:600085/1‑235 (MQ=255) gcCACAGACGTTTAGCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACCTT‑CGGCAA‑AGTGGTGACCCGCGTGGGGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgcagg < 1:471043/239‑1 (MQ=255) gcCACAGACGTTTAGCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTC‑CGGAAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgcagg < 1:890742/239‑1 (MQ=255) gacgcaGACGTTTGTCGGCCTGCGGAAGGATAAAATCTC‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgcagg < 2:105512/235‑1 (MQ=255) gCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGGAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTTACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAAAAACCAAGGTGA‑GGGGGTTATGATTATTTACTTTTATAAAC‑CAGGTGAA‑TTTCTTCTG‑ACATGCAGGCA‑GGGTTTG‑ACAGaaaa > 1:532530/1‑239 (MQ=255) gCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGGGGTGATCCGCGTGGCGGGCGATGATTAAAGATTCAACAGCG‑GCGG‑AAGG‑CCGCC‑TAAAAAACCCGGGAAAAAACTTATTTTTCGC‑TTTTATTAACTAA‑CCAAAACATTGTTCTTCTGCTAATAAAAACAAAAGTGG‑GGGGTTTTTAAATATTCAATTTAAAAAAC‑CAGGTGGA‑TTACCTCTC‑ACATGTAGGCAGGGGTTGG‑A‑AGaaaa > 2:1789356/1‑239 (MQ=255) tggtgAAGGGTAAAATCTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATTATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCa < 1:1350225/179‑1 (MQ=255) gctgAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGAGCAGCTTAAAGGTTCAACGGCG‑GCGG‑GA‑A‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAATGTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTTA‑CCACATCATTTTTCTGCCGCTAAAAAACACAAAGGt > 1:112946/1‑161 (MQ=255) ctgAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgcaggca < 1:866438/219‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGGGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGa < 1:970417/239‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGa < 1:926656/239‑1 (MQ=255) ggTAAAAACTT‑AGGAAA‑AGTGGTAATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑Cca < 1:1525609/121‑1 (MQ=255) tAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑g < 1:1874228/155‑1 (MQ=255) aaaaCTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAAC‑TTTAATTAAATAA‑ACAAATCATTGTTCTGCTGCTAATAAAAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGt > 1:854006/1‑186 (MQ=255) aaaaCTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAAATTCAACAGCG‑GCGG‑CA‑G‑CCCCCCTAAAAATCCAGGGAAAAAAATTATTTTCATCTTTTAATTAA‑TAA‑ACACAAAATTGTTCTGCTGCTACAAACAAAAAAAGTGA‑GGGGGTTATTAGTATTTACTTTTATACAA‑CACAGGAA‑TTTCCTTTC‑TCATGTCAGCA‑GGGTTGGTGCGGAAAAAAC‑AGAAGG‑AATTa > 2:1144765/1‑239 (MQ=255) tt‑CGGAAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAATTTTCAAGGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 2:1806167/163‑1 (MQ=255) t‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa > 1:1559955/1‑146 (MQ=255) t‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAATTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 2:1559955/146‑1 (MQ=255) t‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GGGG‑AA‑A‑CCGCCCTAAAAAATCCGGCAAAAAAGTTATTTTTCGC‑TTTTATTAACTAA‑CCACAACATTTTTTTGCCTCCAATAACAAAAAAAGGGA‑GGGGGTTATTTATATTTTATTTAATACACACAGG‑GAA‑TTTCTTTTGCCCATACGGGC‑‑GGGTTTG‑AAAAAAAAAACACGAAGGAAATTaaaact > 2:878182/1‑237 (MQ=255) ggCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑A‑CCGCCACAAAAATCCCGGCAAAAAACTTATTTTTCGC‑TTTTATTAACTAA‑CCACAACATTTTTTTGCTGCTAAAAACAAAAAAGGTGG‑GTGGtttttta > 2:1874228/1‑151 (MQ=255) aGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑A‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAAATAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAAc > 1:1984679/1‑239 (MQ=255) tggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GGGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGa < 1:1552901/216‑1 (MQ=255) tggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTTTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATa > 1:1806167/1‑163 (MQ=255) tggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATgcagg < 1:715930/192‑1 (MQ=255) gggtgATCCGCGTGGGGGGTGAAGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTGAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCAt < 2:954888/186‑1 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGGGGGTGATGATAAAAGTTTAAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACggg < 1:306386/239‑1 (MQ=255) gtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGattatt < 1:410436/151‑1 (MQ=255) gtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACggg < 1:884576/238‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGaa < 1:179923/167‑1 (MQ=255) ggggCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGaa < 1:478584/236‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AT‑A‑CCGCCCTAAAAAACCAGGCAAAAAACTTTTTTTTAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTTTGCTGCTAATAAAAACAAAAGTGA‑GTGGGTTTTTATTATTTACTTTtata > 2:410436/1‑151 (MQ=255) ggTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑AAAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAAAATGTc > 1:1189132/1‑239 (MQ=255) agtagttAAAGTTTAAAGGGGG‑GCGT‑AA‑T‑CCGCCATAAAAAATCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAg < 2:1189132/233‑1 (MQ=255) taaaaTTTTCACCGGCG‑GGTT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGAc < 2:532530/237‑1 (MQ=255) agaatgttCAACCGCGTGCTT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGAc < 2:2040924/233‑1 (MQ=255) attttAAACGGCG‑GTTT‑AA‑A‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTg < 2:623991/237‑1 (MQ=255) aGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTg < 2:1140422/239‑1 (MQ=255) tCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACCAGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAAATAAACAAGGCCGTTTGACTCTTCaag > 2:2129036/1‑237 (MQ=255) cAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGt > 2:1906/1‑239 (MQ=255) cAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGAATCTGCAGGt > 1:1071946/1‑239 (MQ=255) cgacgT‑AA‑T‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAATCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAGCTGA‑CCAAATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAGCAAAGGTAA‑GTGGATTATGATTATTCACTATAATACAC‑CAGGCTAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCCAAGG‑AATTAAAATTCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCACATCGACTCCACAGCTTgaaa < 2:1379736/235‑3 (MQ=255) | TGCTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCA‑CCGCATCCATGAGTTTCAGAGGGAGATGGGGCAATGGGTGAAAGAGGATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTT‑CGGCAA‑AGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCG‑GCGT‑AA‑G‑CCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAA‑CCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGA‑GTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACAC‑CAGGTGAA‑TTCCTTCTG‑CCATGCAGGCA‑GGGTTGG‑ACAGAAAACACGCGAAGG‑AATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGTTGAGAA > NC_007779/1521555‑1522028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |