Predicted mutation | |||||||
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? | NC_007779 | 705230 = | 7 (0.050) | coding (865/1947 nt) | nagE | PTS N‑acetyl glucosamine transporter subunit IIABC |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCTGCCGGGTGCGGCGCTGGCGATGTACTTCGCAGCACCGAAAGAGCGTCGTCCGATGGTTGGCGGTATGCTGCTTTCTGTTGCTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/704993‑705229 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAA > NC_007779/705230‑705460 ||| ACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGTGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCTGCCGGGTGCGGCGCTGGCGATGTACTTCGCAGCACCGAAAGAGCGTCGTCCGATGGTTGGCGGTATGCTGCTTTCTGTTGCTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTC < 1:74447/238‑1 CGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCTGCCGGGTGCGGCGCTGGCGATGTACTTCGCAGCACCGAAAGAGCGTCGTCCGATGGTTGGCGGTATGCTGCTTTCTGTTGCTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGT < 1:459623/239‑1 ACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCTGCCGGGTGCGGCGCTGGCGATGTACTTCGCAGCACCGAAAGAGCGTCGTCCGATGGTTGGCGGTATGCTGCTTTCTGTTGCTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCA > 1:1025563/1‑238 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CTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTA > 1:1420219/1‑237 CTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTA > 1:1235747/1‑237 CTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCCGGAATTCCTGTTCATGTCCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGAC < 2:699539/97‑1 GTTACTGCGTTCCTGCCCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTT < 1:628461/239‑1 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TGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGGGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCG < 1:435457/239‑1 cttcccgtcCCGGTGTGACGGGCCCGCTGGATTCCCTTTTCGTGTCCCTGGCCCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCCCGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGC < 2:830011/229‑1 TTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCGGAACGTCTGGCTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTA > 2:269949/1‑238 TTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCG > 2:537058/1‑165 TTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCG < 1:537058/165‑1 TTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTACACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTA > 1:455275/1‑238 TTCCTGACCGGTGTGACTGAACCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCAATGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTA > 2:1813455/1‑238 CCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCG > 2:501469/1‑55 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TGTGAATGAGCCGCTGGAATTACTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCAATCGACTACGCGTTGATGTATAACCCGCCGGCCGCCAGCCAGCACGTCTGGATGCTGCTTGTGATGGGCGTTGTCTTCTTCTCTAACTACTTCcggg > 2:1268637/1‑235 GTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGT < 1:1127545/239‑1 CCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTT > 2:156956/1‑239 CCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGT < 1:1010196/145‑1 CCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGCACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACT > 2:1039345/1‑139 TGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTT > 1:1588683/1‑220 GGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTA < 1:1088666/239‑1 TGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATG > 1:979499/1‑239 TGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACG < 1:647512/93‑1 TGTTCATGTTCCTTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACG > 2:647512/1‑93 TTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTC > 2:1832840/1‑188 TTGCTCCGCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTC < 1:1832840/188‑1 ||| ACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGCACCGCGGGGATGTTCATGTCCGGCTTCTTCCCGATCATGATGTTCGGTCTGCCGGGTGCGGCGCTGGCGATGTACTTCGCAGCACCGAAAGAGCGTCGTCCGATGGTTGGCGGTATGCTGCTTTCTGTTGCTGTTACTGCGTTCCTGACCGGTGTGACTGAGCCGCTGGAATTCCTGTTCATGTTCCTTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/704993‑705229 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTTGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAA > NC_007779/705230‑705460 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |