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TAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGGCAAAGGAACTTCCTGCTTTTTTTGCTGGCTTTt > 2:777256/1‑238 ATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑CCATCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTTGCTTTCG > 2:1059857/1‑238 ACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGG < 1:327948/239‑1 ACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGA > 1:546147/1‑154 ACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGA < 2:546147/154‑1 GAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGAAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGGGA > 1:817166/1‑239 TGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAAC < 2:1245762/230‑1 TGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAAC > 1:1245762/1‑230 GATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAA < 1:1059857/239‑1 AGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAT < 2:64410/151‑1 AGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAT > 1:64410/1‑151 CTAAAGCGGTTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTA‑TACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAA < 1:795896/238‑1 TAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAAC > 1:324244/1‑239 AAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGG > 2:1781962/1‑239 AGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGC > 1:129619/1‑239 CTAACAGTTCGATTCAGACAAGCATATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATTCGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTGATGCC‑ACAGCAGGGTCAAAGGAAGTTCCAGCCTTTTTTGCTTGCCTTCGTCCAACGGGGGAGGAAAATCCACCCACGGCAGGTG > 2:1510173/1‑239 CTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTACCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTG > 1:978010/1‑239 AAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATG < 1:551855/239‑1 TCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGAGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTT < 2:316312/239‑1 CGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTG > 1:1376425/1‑239 TCAGACAAGCTTATTACAGCTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTGTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTG < 2:256581/239‑1 TCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTG < 1:98139/239‑1 tAAGCTTATTACAACGTTTTTAAATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTAGGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTGCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTA < 2:1567146/235‑1 AGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACT < 1:178230/239‑1 CTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGG > 1:253692/1‑122 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGGTCCGTTTTTGCC‑ACATCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGTCAGTTGAGTGGGTTGATTGTTGTGCTTACAGTAGAGCG > 2:1658273/1‑239 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGACCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGC > 1:518526/1‑163 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGACCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGC < 2:518526/163‑1 TTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑CCAGCCGGGTAAAAGGAACTTTCAGCTTTTTTTTCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAAAGCAACCAACGGCTGGTGGTGGAGGTGATTGTAGGTCGTACAGTAGCGCGGC > 2:777139/1‑238 TTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGC > 1:515419/1‑238 CATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGCTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTC < 2:42549/239‑1 TTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGC < 1:426902/239‑1 TTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCG > 1:1237133/1‑238 TATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAG > 1:1626773/1‑239 TATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAACGCGGCGCGGGCGCCcg > 2:258440/1‑237 ATTGTGAAATTGGTTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGT < 1:370763/239‑1 GAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA < 1:998761/238‑1 GAGGGGGAATGTTTCGGGCTTCTTGATGACACTGGGAGGGGAGACGAACAGAAATCAGATGTCCTTCCGTTAAAATCCCTCGGGCAAAGTGAGTCGCCATTTTTCGCTCCATGCTTAATGGTCCATTATGAATACAAGAGTAATCATTTACTGGAATGATGGACAGACTAAAGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3742701‑3742935‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTTCCGTTTATGCC‑ACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCA > NC_007779/3744272‑3744501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |