| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 567950 = | 55 (0.370) | 4 (0.030) | 4/380 | NT | 8.6% | coding (33/150 nt) | Y75_RS24780 | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | 568069 = | 33 (0.240) | intergenic (+2/‑56) | Y75_RS24780/Y75_RS02795 | hypothetical protein/recombinase family protein | |||||
CTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCACCATGAAAAAAGCCATAGCATATATGCGATTTTCATCACCAGGTCAGAT > NC_007779/567713‑568171 | ctgattgtgcatgctttcctttgaatgcacttaatcctaaatcttcatatgttatggtatcaagataataatcactatttacctttaaccattcagcaataagtcttctctgtcggtttaatgagtcgccagacatctgacctggtgatgaaaatcgcatatatgctatggcttttttcatggtgacacctgctaacgtatgcttttataaaccttagtggtgggatataatttttgtt > 1:1205217‑M1/238‑239 (MQ=255) tATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTAtttt < 2:1770735/238‑1 (MQ=255) aTCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTAtttttt < 1:738879/239‑1 (MQ=255) aatgcacttaatcctaaatcttcatatgttatggtatcaagataataatcactatttacctttaaccattcagcaataagtcttctctgtcggtttaatgagtcgccagacatctgacctggtgatgaaaatcgcatatatgctatggcttttttcatggtgacacctgctaacgtatgcttttataaaccttagtggtgggatataatttttgtt > 2:277428‑M1/215‑216 (MQ=255) aatgcacttaatcctaaatcttcatatgttatggtatcaagataataatcactatttacctttaaccattcagcaataagtcttctctgtcggtttaatgagtcgccagacatctgacctggtgatgaaaatcgcatatatgctatggcttttttcatggtgacacctgctaacgtatgcttttataaaccttagtggtgggatataatttttgtt < 1:277428‑M1/2‑1 (MQ=255) atgcacttaatcctaaatcttcatatgttatggtatcaagataataatcactatttacctttaaccattcagcaataagtcttctctgtcggtttaatgagtcgccagacatctgacctggtgatgaaaatcgcatatatgctatggcttttttcatggtgacacctgctaacgtatgcttttataaaccttagtggtgggatatattttttgTTTATTTTTTATGTATTCTTTtgt < 2:1233271‑M1/24‑1 (MQ=255) ttGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGTTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCttt < 2:1636276/239‑1 (MQ=255) tCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCaa > 1:225886/1‑239 (MQ=255) tGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGAt > 2:558175/1‑239 (MQ=255) cTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTTATTTGTTCCGGTGTGTTGAGTATTAATTTATTGTCACGAACCAGACCACATTAAATTAATTTGTTTCTAAACTAATAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATCATTCTCGTTTTATTCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTAtagta > 2:1773873/1‑235 (MQ=255) tagggggATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATATGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACAACACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGTGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGaaaa < 2:1319331/236‑1 (MQ=255) gggATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGc > 2:792114/1‑239 (MQ=255) aTTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCaa < 1:558175/238‑1 (MQ=255) aTTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCaa < 2:225886/238‑1 (MQ=255) aTTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAAt > 1:1280669/1‑239 (MQ=255) tttttCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAAt < 1:792114/238‑1 (MQ=255) ttttCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATAc > 2:480053/1‑239 (MQ=255) ttttCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTAGAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGAGTTGATTACTAATTTATTGTCACGAAGAACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTTTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTAGTAATGTATTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGTGTAATAAAATTGCTAt > 2:1149921/1‑237 (MQ=255) ggCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATtgttgt < 1:184397/239‑1 (MQ=255) ggCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATtgttgt < 1:1773873/239‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATTGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATAtt < 2:497642/238‑1 (MQ=255) ccTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTc < 1:480053/238‑1 (MQ=255) atttacctttaaccattcagcaataagtcttctctgtcggtttaatgagtcgccagacatctgacctggtgatgaaaatcgcatatatgctatggcttttttcatggtgacacctgctaacgtatgcttttataaaccttagtggtgggatataatttttgTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCa < 2:1795126‑M1/78‑1 (MQ=255) 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aTTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATtgttgt < 1:736664/204‑1 (MQ=255) aTTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTta > 2:68865/1‑239 (MQ=255) tgCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTtaaataa > 2:1408481/1‑239 (MQ=255) gtgtgtTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTAtttttt > 2:103150/1‑133 (MQ=255) 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2:969458/239‑1 (MQ=255) taATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATtat > 1:1080255/1‑239 (MQ=255) ttATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATcc < 1:1408481/239‑1 (MQ=255) tATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAAt < 2:584660/162‑1 (MQ=255) tATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAAt > 1:584660/1‑162 (MQ=255) 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tCTAAACTACTATAATATGGAGTCTTTTATATTTATATGAACTTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTAGTTTTTAGATATTATTTTGTGCTTTCAAGATTATTGCGTAAGATATTTGCAATCCGATTATTGTTGTATATTCAAAATAATGTGACCTTAATTGAATTTATAAAGAAGAAATAATCAAAAATTATATCCCTCCTTTAAGGCATATAAAATCTTACCTTATCAGgtgt < 2:1152548/239‑1 (MQ=255) tGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCACCATGAAAAAAGCCa < 1:1149921/239‑1 (MQ=255) atatttatatGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCGCCATGAAAAAAGCCATAGCATATATg < 1:68865/239‑1 (MQ=255) 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gCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGAc > 2:71724/1‑118 (MQ=255) ccTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATAc < 1:744710/86‑1 (MQ=255) ccTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATAc > 2:744710/1‑86 (MQ=255) ccTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCACCATGAAAAAAGCCATAGCATATATGCGATTTtcatca > 1:265487/1‑238 (MQ=255) tGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCCTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCACCATGAAAAAAGCCATAGCATATATGCGATTTTCATCACCAGGTCAGAt > 2:342847/1‑239 (MQ=255) | CTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGTCTTTATTTTTTATGTATTCTTTTGTGCTTTCAAGATTATGGCGTAAGAAAATTGCAATACGATTATTGTTGTATATTCAAGATAATGTGACCTTAATTGTCTTTTTAAATAAAAAATAAACAAAAATTATATCCCACCACTAAGGTTTATAAAAGCATACGTTAGCAGGTGTCACCATGAAAAAAGCCATAGCATATATGCGATTTTCATCACCAGGTCAGAT > NC_007779/567713‑568171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |