| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | = 3949333 | 155 (1.040) | 168 (1.130) | 88/404 | NT | 52.0% | coding (1526/2340 nt) | bcsB | cellulose biosynthesis cyclic di‑GMP‑binding regulatory protein BcsB |
| ? | NC_007779 | 4056220 = | NA (NA) | intergenic (‑209/+15) | Y75_RS25055/Y75_RS20055 | hypothetical protein/IS1‑like element IS1A family transposase | |||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
TATCAGCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACAGGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGT‑ATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCATGTGGTGATTGGTGACGACTCCACCATCGACTTCTCGAAGTATTACCACTTCATCCCGATGCCGGATCTACGCGCCTTTGCTAACGCGGGCTTCCCATTCAGCCGGATGGCGGATCTGTCGCAAACCATCACCGTGATGCCGAAAGCGCCTAACGAAGCACAGATGGAAACGTTGCTGAATACTGTTGGTTTTATCGGCGCACAGACGGGCTTCCCGGCGATTAATCTGACGGTGA > NC_007779/3949097‑3949569 | tatCAGCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACAGGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGT‑ATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGAATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAt < 2:341418/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |