Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 1,065,700 | C→T | 100% | R415C (CGT→TGT) | Y75_RS05220 → | YccE family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,065,700 | 0 | C | T | 100.0% | 534.7 / NA | 138 | R415C (CGT→TGT) | Y75_RS05220 | YccE family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (68/70); total (68/70) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GAAGAATTTTCTTGTTGTTCTTTCAGATAGCATTTGCTCATTATTTATTGTTAATAGTAATGTGGCATCAATCTCCTTGGGGAATGAATCCTTTTCAACAGATGAAGATCTTGAGTATGGTTATTTAATGAACACTGGCAATCATTATGACGTTTACCTCCCTCCTGAACTTTTTGCTCAGGCTTACAAGTTAAACAATAAGGAAATGAATGCGCAACTCGACTATTTAAATCGTTATGCAATTTAATGGCAAAGGCATATGCTAAAAACCATTGTTATTAGTCTCACACTTTTTTATTGGTAAATATTGTCTCTGTATTGGTAACGCCGCAGATATTCTGTTTAGCCACAGGTGCAATTATCAGCGGCGTACGCGAGGCAGGGGCTAATCAGGCATAGTTTGCGTCAAACCTTGCCTGTTTTTGAAGATGTATATAGAAAAACAGGCGTTCAACAAGCCA > NC_007779/1065468‑1065928 | gaagaaTTTTCTTGTTGTTCTTTCAGATAGCATTTGCTCATTATTTATTGTTAATAGTAATGTGGCATCAATCTCCTTGGGGAATGAATCCTTTTCAACAGATGAAGATCTTGAGTATGGTTATTTAATGAACACTGGCAATCATTATGACGTTTACCTCCCTCCTGAACTTTTTGCTCAGGCTTACAAGTTAAACAATAAGGAAATGAATGCGCAACTCGACTATTTAAATTGTTATg < 1:126414/239‑1 (MQ=255) gttgttCTTTCAGATAGCATTTGCTCATTATTTATTGTTAATAGTAATGTGGCATCAATCTCCTTGGGGAATGAATCCTTTTCAACAGATGAAGATCTTGAGTATGGTTATTTAATGAACACTGGCAATCATTATGACGTTTACCTCCCTCCTGAACTTTTTGCTCAGGCTTACAAGTTAAACAATAAGGAAATGAATGCGCAACTCGACTATTTAAATTGTTATGCAATTTAATGGCa < 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |