| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 2,530,688 | 0 | C | A | 10.2% | 409.2 / 3.8 | 144 | T39N (ACC→AAC) | Y75_RS12650 | outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/73); new base A (16/2); total (69/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-04 | |||||||||||
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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ATTAATCCACGGTAAAAACTGTATTGGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTGCATTATCTGGACTGGACCAGCCGGACTACCG‑AAAAATCGTCG‑ACCAAATCACACAAAGATGA‑TTTTGGTTA‑TCTTG‑AATTTGAAGGTGGCGCTAACTTTAGTTGGGGAGAAATGTACGGGTTCTTCGACTGGGAAAACTTCTATAACGGTCGCCAT‑AATAAACCAGGTAGCGAGCAGCGTTATACCTTTAAAAATACCAACCGTATTTACCTGGGTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCA > NC_007779/2530452‑2530924 | aTTAATCCACGGTAAAAACTGTATTGGCGATATTAATTCCTTTGCATTAACAATATGTCGTTTTTAGCAAACCACTTTATTAAGCAATCTACTAATAACGATCGGCATAGGGAATTATGCTATGAAAAAACATCTTTTAACTCTGACACTTTCCTCTATATTAGCGATACCTGTTGTATCTCATGCAGAATTTAAAGGCGGTTTTGCAGATATCGGCGTGCATTATCTTGACTGGAccc > 1:796069/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |