Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,777,754 | 0 | A | C | 34.0% | 90.1 / 29.9 | 103 | T315P (ACC→CCC) | Y75_RS18735 | PTS transporter subunit EIIC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/26); new base C (8/28); total (47/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.49e-04 | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACGGACAGTTTATCTTTGGTCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCCGGAAGGCGGTTTTGCCC‑TGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCATTTCTTTAGCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAA‑TCGGG‑TAAAA‑GT‑GGCGGG‑CTTGC‑T‑G‑ATT‑CCCG‑CAA‑CC‑T‑T‑AA‑CCGCCAT‑G‑CTGGTGGGAATTACCG‑AAC‑CG‑CTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTG‑TTTGCGGTACACGCCGTG‑CTGGCGGCCTCAATGTCGACCGTAATGTATCTCTTTGGTGTGGTGGGCAACATGGGCGGAGGTCTGATTGACTAGGTTTTACCGCAAAACTGGATCCCGATGTTCAGCAACCACGCGGATATGATGCTGACCCAAATCGCCATTGGGT > NC_007779/3777518‑3777991 | aCGGACAGTTTATCTTTGGTCCGGCAGCTGTTGAAGGCGGCATTCAGATGTACTGGGCGCAGCATCTGCAAGAGTTCAGTTTGAGCGCCGAGCCGCTGAAATCGTTGTTCCCGGAAGGCGGTTTTGCCC‑TGCACGGTAACTCAAAAA‑TCTTTGGTGCCGTGGGCATTTCTTTAGCGATGTACTTCACTGCCGCACCGGAAAA‑TCGGG‑TAAAA‑GT‑GGCGGG‑CATGC‑T‑T‑TTT‑ACCG‑CAA‑cc > 1:1076440/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |