Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 3,797,639 | C→G | 6.7% | G338G (GGC→GGG) | Y75_RS18845 → | adenine permease AdeQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,797,639 | 0 | C | G | 6.7% | 1089.7 / 4.6 | 420 | G338G (GGC→GGG) | Y75_RS18845 | adenine permease AdeQ |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.06e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |