| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 3748316 = | 2 (0.010) | 229 (1.220) | 117/400 | NT | 99.1% | pseudogene (665/873 nt) | tnaB | low affinity tryptophan permease TnaB |
| ? | NC_007779 | = 4056987 | NA (NA) | coding (391/417 nt) | Y75_RS20060 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3748553‑3748316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCAT < NC_007779/4056987‑4056763 TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGG > 1:20233/1‑239 AAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGG > 2:486426/1‑239 CGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGAT > 1:1801121/1‑238 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GCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCC < 1:1197209/239‑1 ATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:96486/239‑1 ATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:1452678/238‑1 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GTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:260179/238‑1 TTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:858324/1‑238 CTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCCTTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 2:1566527/239‑1 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CTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG < 1:1268875/238‑1 TACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTA < 2:1177482/239‑1 TTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT < 1:1922169/239‑1 CGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCT > 1:1684064/1‑237 CGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCT > 1:2256534/1‑237 TCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCCCCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 1:988227/239‑1 TCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 1:439178/239‑1 TCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 1:795163/239‑1 TATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 2:818597/214‑1 TTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC > 2:1402891/1‑239 TTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC > 2:1021373/1‑239 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACA > 1:840655/1‑239 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTG < 2:1929760/220‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 1:1897016/159‑1 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:1113012/1‑149 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:722571/1‑107 TGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:973453/1‑94 TGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCA > 2:417180/1‑238 GTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAA > 2:1312357/1‑238 GTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:556713/1‑89 GTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTG < 1:1402891/239‑1 GTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACT < 1:302368/238‑1 CATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 1:111774/1‑148 ATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 1:697508/188‑1 TTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 2:17514/146‑1 TTTGGTTTCCACGGAAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 1:17514/1‑146 TTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCG < 2:1084376/239‑1 TTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACC < 1:884964/238‑1 CGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGC‑AAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCA > 1:1055236/1‑239 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGC > 1:1342457/1‑238 AGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG > 1:1016741/1‑207 CTGATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTT > 2:511621/1‑206 GATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC > 1:1861455/1‑158 GATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 2:1861455/158‑1 ATTATTTGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAA > 2:1903604/1‑239 TGCTATGGAAAACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 2:618191/195‑1 TAAGTTCGTTAGCCGCCAGTCGTATTACCTCATTGTTCCTCGGGCTGAAGATTATCTCCTTTGTGATCGTGTTTGGTTCTTTTTTCTTCCAGGTCGATTACTCCATTCTGCGCGACGCCACCAGCTCCACTGCGGGAACGTCTTACTTCCCGTATATCTTTATGGCTTTGCCGGTGTGTCTGGCGTCATTTGGTTTCCACGGCAATATTCCCAGCCTGATTATTTGCTATGGAAAACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/3748553‑3748316‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCAT < NC_007779/4056987‑4056763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |