New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 4185837 = | 191 (1.020) | 12 (0.070) | 7/390 | NT | 5.9% | coding (820/1470 nt) | gspA | type II secretion system protein GspA |
? | NC_007779 | 4185923 = | 200 (1.090) | coding (906/1470 nt) | gspA | type II secretion system protein GspA |
AACAGGCAATTTTTTGTCCCCGACTTTAAGCGATGCGATCCAGGGCAAATTCTGATCTACCAATGTTTGTAAAGAAGCATTCCCACTTTTACATGCCAGCCCCGCTCTTACTGCCTGATCGCACCAGGCCGAATCAGCTGGGACCTCGTACCCCCATACGCCGTATAACACGCTTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4186079‑4185837 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgtATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTGAG > NC_007779/4185923‑4186160 AACAGGCAATTTTTTGTCCCCGACTTTAAGCGATGCGATCCAGGGCAAATTCTGATCTACCAATGTTTGTAAAGAAGCATTCCCACTTTTACATGCCAGCCCCGCTCTTACTGCCTGATCGCACCAGGCCGAATCAGCTGGGACCTCGTACCCCCATACGCCGTATAACACGCTTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTG < 1:772411/239‑1 AGGCAATTTTTTGACCCCGACTTTAAGCGATGCGATCCAGGGCAAATTCTGATCTACCAATGTTTGTAAAGAAGCATTCCCACTTTTACATGCCAGCCCCGCTCTTACTGCCTGATCGCACCAGGCCGAATCAGCTGGGACCTCGTACCCCCATACGCCGTATAACACGCTTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCG < 2:1797972/239‑1 TTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGC > 2:428917/1‑239 TTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGC > 1:686956/1‑239 TTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGC > 1:503568/1‑239 CCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGT > 2:115488/1‑239 TCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAG < 1:115488/239‑1 CGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTTGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC < 2:1468607/206‑1 CGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC < 2:1874200/206‑1 CGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC > 1:1468607/1‑206 CGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC > 1:1874200/1‑206 TCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGAT < 1:428917/239‑1 TCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTATTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGAT < 2:686956/239‑1 ATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGC < 2:503568/239‑1 GGCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTT < 2:323771/239‑1 GCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACG > 2:437277/1‑215 GCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACG < 1:120153/215‑1 GCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACG > 2:120153/1‑215 GCGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACG < 1:437277/215‑1 CGTATGGGGGTACGCGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTG > 1:2005695/1‑239 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTTGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGCCGGGG > 1:814525/1‑143 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTTGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGCCGGGG < 2:814525/143‑1 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTG > 1:552689/1‑239 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTG > 1:30880/1‑239 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGGTTG > 2:1964764/1‑239 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGA > 1:1791122/1‑224 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGA < 2:1791122/224‑1 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTG < 1:1308002/216‑1 CGTATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTG > 2:1308002/1‑216 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTTCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTGAG > 2:2218751/1‑239 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTGAG > 2:1165656/1‑239 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTGAG > 1:315229/1‑239 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGT < 2:840264/234‑1 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGT > 1:840264/1‑234 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAA > 2:426258/1‑230 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAA < 1:426258/230‑1 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGT > 2:122840/1‑193 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGT < 1:122840/193‑1 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGGTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACCTAAATGGTTTGAG > 1:1110560/1‑239 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC > 2:43250/1‑154 TATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCC < 1:43250/154‑1 AACAGGCAATTTTTTGTCCCCGACTTTAAGCGATGCGATCCAGGGCAAATTCTGATCTACCAATGTTTGTAAAGAAGCATTCCCACTTTTACATGCCAGCCCCGCTCTTACTGCCTGATCGCACCAGGCCGAATCAGCTGGGACCTCGTACCCCCATACGCCGTATAACACGCTTAGCGCCTCACTATCGCGCATCACCACATGAGCAATATCCTTAGTCATATCTTGTTTAACTACTGGCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4186079‑4185837 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgtATGGGGGTACGAGGTCCCAGCTGATTCGGCCTGGTGCGATCAGGCAGTAAGAGCGGGGCTGGCATGTAAAAGTGGGAATGCTTCTTTACAAACATTGGTAGATCAGAATTTGCCCTGGATCGCATCGCTTAAAGTCGGGGACAAAAAATTGCCTGTTGTGGTCGTTCGCGTCGGTGAGGCTAGCGTTGATGTCCTCGTAGGTCAGCAAACGTGGACGCTGACACATAAATGGTTTGAG > NC_007779/4185923‑4186160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |