New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779 | 4032736 = | 136 (0.720) | 9 (0.050) | 5/382 | NT | 6.1% | coding (1229/2199 nt) | zntA | Zn(II)/Cd(II)/Pb(II) translocating P‑type ATPase ZntA |
? | NC_007779 | 4032846 = | 148 (0.830) | coding (1119/2199 nt) | zntA | Zn(II)/Cd(II)/Pb(II) translocating P‑type ATPase ZntA |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
GCAACCTGTGCTTCGCGTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCGGAGGTAATCGCCGCAGGCGTTGAGATAACTAACGCACACGGGCAGCCAATCAGCAGCAGCGTCAGCCCTTTATAAATCCACTCCTGCCAGCTGGCGGCAAACAGCAGCGGTGGCACCAGCGTCACCAGCAGAGCGACGGCCATAATCGCGGGCGTATAGATACGGCTGAAACGGTCGATAAACCGCTCAATGGGAGCGCGACGCTCTTCGGCTTCTTCGATCA > NC_007779/4032502‑4032970 | cgcgcaacgggcgataaagtccctgctggtgccaccagcgtagaccgtctggtgacgttggaagtgctgtcagaaccgggagccagcgccattgaccggattctgaaactgatcgaagaagccgaagagcgtcgcgctcccattgagcggtttatcgaccgtttcagccgtatctatacgcccgcgattatggccgtcgctctgctggtgacgctggtgccaccgctgctgtttgccg < 1:1685676‑M1/4‑1 (MQ=255) 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tgCTTCGCGTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCgg > 1:1111475/1‑239 (MQ=255) tgCTTCGCGTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCgg > 2:1534071/1‑239 (MQ=255) cgcgTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGCCCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCGGAGGTa < 1:1033419/239‑1 (MQ=255) cgcgTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCGGAGGTa > 1:411874/1‑239 (MQ=255) cgcgTACGATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCGGAGGTa > 2:1473298/1‑239 (MQ=255) gATGGCTTGCGCCAGTGGATGCGTCGCGCCTTGCTCGACCGCCGCCGCCAGTGTCAGCAGTTCAGATTCACTAATACCCGTTGCCGGATGAATCGCGGTAACGCGCGGTTTACCGACGGTCAGCGTACCGGTTTTATCAAACGCCACCTGAGTAACACGACCCAGCTGTTCCAGCGCCGCTCCGCCTTTAATCAACGCCCCACGACGCGCTGCCGCCGCCAGCCCGGAGGTAATcgccg < 1:1746127/239‑1 (MQ=255) 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NC_007779/4032502‑4032970 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |