| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779 | 2080119 = | 202 (1.150) | coding (43/195 nt) | Y75_RS10530 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TGTGTGATGCGGTGAACTTTCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA > NC_007779/2079881‑2080351 | tgtgtgATGCGGTGAACTTTCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTgg < 1:527689/239‑1 (MQ=255) 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cTTTCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGt < 1:1359596/239‑1 (MQ=255) tttCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGcaca > 1:546603/1‑234 (MQ=255) tttCTCGTGGAAAAATACGCGCTGGTGCGTACCGACCAGCCGGGATTCAGCGCCTGTACCCGCTCTCAGTTAATAAACAGCATCGATATCCTCCGGGCTCGCAGGGCGACCGGCCTGATGACCCGCGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTc > 1:326176/1‑239 (MQ=255) 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1:1661631/1‑239 (MQ=255) tACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACa < 1:1945253/239‑1 (MQ=255) tGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGta < 1:176475/239‑1 (MQ=255) ggTAAGTATCCGGAGGGGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTc < 1:1841510/142‑1 (MQ=255) ggTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGa > 2:643702/1‑91 (MQ=255) ggTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGa < 1:643702/91‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |