| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
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cAAGGAACCACTGGTAAGTGCTGGCAAGCCCCGCTTCCAGTGAGATTTCGTGATACCAGCCAAGCTGATGCAGGCGCGTCACATCCAGCAGTTTGCGCGGCGTGCCATCCGGTTTGCTGGCATCAAAAACCACCCGGCCTTTGTAACCCACCACTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGgggt > 1:764210/1‑237 (MQ=255) tGCTGGCAAGCCCCGCTTCCAGTGAGATTTCGTGATACCAGCCAAGCTGATGCAGGCGCGTCACATCCAGCAGTTTGCGCGGCGTGCCATCCGGTTTGCTGGCATCAAAAACCACCCGGCCTTTGTAACCCACCACTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCCTgc > 2:2015292/1‑239 (MQ=255) cTGGCAAGCCCCGCTTCCAGTGAGATTTCGTGATACCAGCCAAGCTGATGCAGGCGCGTCACATCCAGCAGTTTGCGCGGCGTGCCATCCGGTTTGCTGGCATCAAAAACCACCCGGCCTTTGTAACCCACCACTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGCGTTCTCCAGCCAGCCTTCATgcg > 1:2026204/1‑238 (MQ=255) 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aCCCACCACTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCAGCTCCATGACATGAATGCTCGCCGCCGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATTCTGTGCCGTCGCCTCGTGGAAg > 2:910900/1‑235 (MQ=255) ccccccccTTTGGCGAGTTTTTGCGCCAGC‑CGCGGAGTAGTGCATTAAACGCCCCTGCGGCGGTTACTGTGCGCCACCATCGGCT‑GGGCTTTTTCCAGCCGGCCTTCATGCGCCATTGCCATGACATGAATGCTGGCCGCAGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATCCCACCACGTCCGGCGCATTCTTTGCCGTCGCCTCGTGGAAGCGACg < 2:324851/239‑1 (MQ=255) accacTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCTGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCa < 1:495966/112‑1 (MQ=255) accacTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCAGCTCCATGACATGAATGCTCGCCGCCGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATTCTGTGCCGTCGCCTCGTGGAAGCGACgcag < 1:1765883/239‑1 (MQ=255) accacTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCAGCTCCATGACATGAATGCTCGCCGCCGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATTCTGTGCCGTCGCCTCGTGGAAGCGACgcag < 1:1501798/239‑1 (MQ=255) accacTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCAGCTCCATGACATGAATGCTCGCCGCCGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATTCTGTGCCGTCGCCTCGTGGAAGCGACgca > 1:67140/1‑238 (MQ=255) cacTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCCGACTTCATGCGCCAGCCCCATGACATGACTGCTCGCCGCCGCCACATCCTCGACGTGCAGCAATTCCCGCATCGGTGTCCCGCCGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATCCTGCGCCGTCCCCTCGTGGCACCCACccagca > 2:384905/1‑239 (MQ=255) 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TCTTGATTCTCAAGGAACCACTGGTAAGTGCTGGCAAGCCCCGCTTCCAGTGAGATTTCGTGATACCAGCCAAGCTGATGCAGGCGCGTCACATCCAGCAGTTTGCGCGGCGTGCCATCCGGTTTGCTGGCATCAAAAACCACCCGGCCTTTGTAACCCACCACTTTGGCGATGGTTTGCGCCAGCTCGCGGA‑TAGTGCAGTCAACGCCCGTGCCGACGTTAATGTGCGACAACATCGGCT‑GGGTGTTCTCCAGCCAGACTTCATGCGCCAGCTCCATGACATGAATGCTCGCCGCCGCCATATCATCGACGTGCAGAAATTCGCGCATCGGTGTACCGCTGCCCCATACCACCACGTCCGGCGCATTCTGTGCCGTCGCCTCGTGGAAGCGACGCAGCAATGCTGGGATCACATGCGAATTACTCGGGTGGAAGTTGTCGTGTGGCCCGTACAGGTTGGTCGGCATGACTGAG > NC_007779/2128378‑2128851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |