| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | = 2747640 | 181 (0.960) | 10 (0.060) | 6/382 | NT | 5.3% | coding (211/1287 nt) | Y75_RS13680 | HlyC/CorC family transporter |
| ? | NC_007779 | = 2747760 | 186 (1.040) | coding (331/1287 nt) | Y75_RS13680 | HlyC/CorC family transporter | |||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
ACCCTCAACCGCTATCGTCTGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAAT > NC_007779/2747523‑2747996 | cTCAACCGCTATCGTCTGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGtatt < 2:1773848‑M2/239‑5 (MQ=255) tCGTCTGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCa > 2:780502/1‑239 (MQ=255) cTGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTg < 1:52456/238‑1 (MQ=255) tGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGcc > 1:74888/1‑239 (MQ=255) 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tGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCg < 2:491352/239‑1 (MQ=255) tGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCg < 1:1328399/239‑1 (MQ=255) aaGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGctgg < 1:2121625/239‑1 (MQ=255) 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tgtTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAAc < 2:164796/148‑1 (MQ=255) aTCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCg < 2:468961/222‑1 (MQ=255) aaTAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTAt < 1:446442/239‑1 (MQ=255) aaTAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTAt < 2:856930/239‑1 (MQ=255) 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atTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGtattgccgattaacaccaggcttatcaggcggtctggcttacgcagcaatttttcgacgcgtttggccgagcgattaccctgtttcgccatatgtcgcagacgata > 2:2071543‑M2/1‑109 (MQ=255) atTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGtattgccgattaacaccaggcttatcaggcggtctggcttacgcagcaatttttcgacgcgtttggccgagcgattaccctgtttcgccatatgtcgcagacga < 1:1746900‑M2/213‑105 (MQ=255) atTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGATGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGATGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGtattgccgattaacaccaggcttatcaggcggtctggcttacgcagcaatttttcgacgcgtttggccgagcgattaccctgtttcgccatatgtcgcagacgatagcggttgagggtcatcattccggt < 1:619985‑M2/239‑131 (MQ=255) 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> 2:420752‑M2/1‑20 (MQ=255) tACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCaa > 2:1531524/1‑166 (MQ=255) tACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCaa < 1:1531524/166‑1 (MQ=255) cTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTAt < 2:1362363/131‑1 (MQ=255) cTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAAt > 1:1142271/1‑239 (MQ=255) gTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATg < 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2:1146225/1‑238 (MQ=255) tGCTGAGGTAGTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTc < 1:1165234/239‑1 (MQ=255) cTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCa < 1:1933567/201‑1 (MQ=255) cTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCa > 2:1933567/1‑201 (MQ=255) aGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGa < 1:1076138/111‑1 (MQ=255) 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ACCCTCAACCGCTATCGTCTGCGACATATGGCGAAACAGGGTAATCGCTCGGCCAAACGCGTCGAAAAATTGCTGCGTAAGCCAGACCGCCTGATAAGCCTGGTGTTAATCGGCAATAACCTGGTCAATATTCTTGCCTCCGCGCTCGGCACTATTGTTGGGATGCGTTTGTACGGCGATGCGGGCGTGGCAATTGCGACTGGTGTGCTGACTTTTGTCGTACTGGTATTTGCTGAGGTATTGCCGAAAACCATTGCCGCGCTGTACCCGGAAAAAGTCGCTTATCCGAGTAGTTTTCTGCTGGCTCCGCTGCAAATTTTGATGATGCCGCTGGTCTGGTTGCTGAATGCTATCACCCGTATGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAGAAGAGTTGCGCACTATCGTGCACGAATCACGCTCACAAATTTCCCGTCGCAAT > NC_007779/2747523‑2747996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |