Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,205,092 | C→A | 16.6% | intergenic (‑180/‑27) | ttdR ← / → ttdA | DNA‑binding transcriptional activator TtdR/L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,205,092 | 0 | C | A | 16.6% | 164.7 / 8.9 | 89 | intergenic (‑180/‑27) | ttdR/ttdA | DNA‑binding transcriptional activator TtdR/L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/48); new base A (2/12); total (28/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_007779/3204855‑3205326 | tgtgAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCa < 2:1944717/239‑1 (MQ=255) ccAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAAc < 1:911675/239‑1 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑GA‑TTTTT‑TTATACAAAAACAAAAAATgta > 2:911675/1‑237 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTgg < 1:351176/237‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑g < 2:1899232/239‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑g < 1:1308346/239‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑g < 1:289615/239‑1 (MQ=255) cAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TCAaaaaaaaaaaaaaaaaataggtgg > 1:1208959/1‑228 (MQ=255) tCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑GA‑ATTTT‑TTACACAAAAACACAAAAAGGA‑ggttgtctgt > 2:1050748/1‑230 (MQ=255) tttGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCatgatg < 2:2112437/239‑1 (MQ=255) tGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGG‑G‑GA‑ATTTT‑TCAGACAAAAAAAAAAAATACA‑GTT‑GTCCTGATGA‑g > 1:1815157/1‑239 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGTCATTCCCTGCTCTGGCGCCATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGa < 1:495074/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGa < 2:2096869/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGa < 2:1568310/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGa < 1:517479/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGa < 1:364245/238‑1 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑GA‑ATTTT‑TAAGAAAAATACAAAAAATAGA‑GTT‑TGCATGAGGG‑GCGAAAGGAATAAACaaa > 1:309262/1‑238 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAAc < 2:1343800/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:764311/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:1483864/237‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 2:1464212/237‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTg < 1:941058/239‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGC‑A‑GT‑TATTT‑TCAGACAAATACAAAAAACGGA‑GTT‑GTGCTGTCGC‑TCGAAAGAAATAAacaacaaacaggg > 1:2259518/1‑232 (MQ=255) ttATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAg < 1:1549700/239‑1 (MQ=255) gtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAAA‑TTTTT‑CCA‑AAAAAAAAAAAAAATAGA‑GTT‑TGCACGATGG‑GCGGAAAGAAAAAGAAAAAAAC‑AGTGAAAAAATTGTTAGAGAtt > 2:864466/1‑239 (MQ=255) cAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCatg < 1:1500914/181‑1 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAAACAAAAAAAAAAAATGTA‑GTT‑TGCATGAGTG‑GAGAAAGTAATAAGCAAAAAAA‑AGAGAATAAATTGTAAGAGATATTTGCT‑aaaattt > 1:1998433/1‑234 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAAACAAAAAAAAAAAAATGA‑AGT‑GTCGTGATGA‑GGGGAAGTAATAAGCAAAAACC‑AGGGAAAAAGATGAAAGAGATGGTTGGT‑AAAtttta > 1:1876778/1‑236 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TTAGACAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GTCACGGTGA‑GGGAAAGGAATAAAAAACAAGC‑AATGAAAAAGATGACAGAGATAGTTGCT‑AAACTTAACGcc > 1:1980268/1‑239 (MQ=255) tCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACGGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCa < 1:1050748/239‑1 (MQ=255) tCGCAAAACATTGCCATTCCCGGCTTGGGGGAAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCGCGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATAAAAAAACGGGA‑GTG‑GCCATGAGGA‑GCAAAAGTAATAAACAACAGGC‑AGTAAATAAGTTGACAGAGTTTTTCGTT‑AACTTTCCCGCCa < 2:1208959/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGA‑G‑AA‑ATTTT‑TCAGAAAAAAAAAAAAAATAGA‑GTT‑TTTCTGATGA‑GAGGAAGAAAAAAAAAAAAAGA‑AGAGAAAAAATTGACAGAGATTGTGGCC‑AACTTTAATCCCATGAt > 1:1870947/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TTAAACAAAAAAAAAAAATGGA‑GGT‑GGCGTGATGA‑TGGAGAGTAATAAAAAAAAAGA‑AGAGAATAAATTTAAAGAGAATTTGTCT‑AACTTTACACCCACGAttt > 2:1961191/1‑239 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGTAATATTCATTCTTATTTTCA‑CTTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CAAGACAAATCAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGAGAG‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGTTTGCCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:1553555/239‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCACAATATTCATTCTTATTTTCG‑CTTTGATTCACGAACTGTTATTTACTTATTCGCGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTAAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAAACAAATAAAAAAACTGAA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGAAACGGGC‑AGTGAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:1009440/239‑1 (MQ=255) ttCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TTAGAAAAAAAAAAAAAATGGA‑GTTGGCCTTGTGGA‑G‑GAAAAAAATAAGAAAAAAGT‑AGTGAATAAAATGACAGAGAGATTTGCT‑AACTTTATAGACATAATTTCTATCCGAAt > 2:759988/1‑239 (MQ=255) ttCCCTGCTCGGGGGAAATTTTATTTCTT‑TTTTCGTCGTGTATTCCCGAACTTTTAATTACAGTTTCGCGGGGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTGGGGGTGGTTTGTGGGGGT‑G‑AT‑TTTTT‑CCAGACAAACACAAAAAGTGGA‑GTT‑GCCAGGATGA‑GCAAAAGAAATAACCAACAGAA‑AGTAAATAAGTTGACAGATATAGCCGTT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAt < 2:620996/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGG‑G‑AA‑ATTTT‑TTAAAAAAAAACAAAAAATTGA‑GTT‑TGCATGGTGA‑GTGAAAGTAAAAAACAAAAAACAAGAAAAAAAATAGA‑AGAGAATGTTGCT‑AACTTTAAAGCCATGAATTTTACACgcaag > 2:2097036/1‑234 (MQ=255) tctGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCGCGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGTAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGTTATTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACGGGA‑GTT‑GCCTTGATGA‑ACGAAAGAAAGAAGCAACAGGC‑AGTAAATAGGTTGATAGAGTTTGTCGCT‑AACTTTTCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 1:1867128/239‑1 (MQ=255) gcgggaacAATATTTATACTTATTTTCG‑CAGTGATACACGAGCTGTTATTCACATATTCGCGGGGGAAAAAAATAAAAAACCACATTGTTAGTGGTAGTGTG‑GGGGGT‑G‑AAGTTTCT‑CCAAACAAAAACAAAAGCGGGG‑GTG‑CCGACGATGA‑GCGAAAAAAATAAGCAAGAGTC‑AGTGAATAAGTGGAGAGAGGTGGCCGCA‑AATTTACCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 2:691688/232‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TCAAACAAATAAAAAAAAAGGA‑GTT‑TTCATTAGGA‑GGGGAAGTAATAAAAAAAAAAC‑AATGAAAAAATTGACAGAGATTTTTGCT‑AACTTTATCACCCAGAATTTTACCCGAAAGCCCGATGACgt > 2:871228/1‑239 (MQ=255) gcAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCTCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:1493912/238‑1 (MQ=255) aaaattttatttcTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCAGGGGGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGGGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CAAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑GGTGAATAAGTTGAAAGGGATTGTCGCT‑ATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:1876778/228‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGtaat < 1:1382971/153‑1 (MQ=255) ttctttctTATTTTCG‑TGTTGATTCACGAACTTTTAATTAAATATCCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CAAGAAAAATAAAAAAACGGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGAAAAAAGCAACAGGT‑AGTAAAAAAGTTGACAGAGATTGCCGAT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATa < 2:1915993/239‑1 (MQ=255) tttttttCG‑CGTTGTTTCACAAACTGTTAATTAAATATTCACGGTGGAAAAAAAAAAAAAACAACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGGGGT‑G‑AA‑TTTTC‑CCAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAATAATAAGCAACAGGC‑AGTAAATAAGTTGACGGAGATTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 2:270990/236‑1 (MQ=255) ttATTTCCG‑TGTTGATTCACGAATTGTAAATTACATATTCAGGGTGGAAAAAAAAATAAAACAAAATTTTTGGTGGTAGTTTGGGGGGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CAAAAAAAATACAAAAACGGGG‑GTG‑GCCATGATGG‑GCAAAAGTAATAAGCACCAGGA‑GGGGAATAAGTGGACAGGGATTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 2:1073363/239‑1 (MQ=255) ttttttAG‑CGTTGATTCACGAACTGTAAATTACATATACCCGGTGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGGGGTGGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAATTAATAAGCAACAGCC‑AGTAAAAAGGTTGACAGAGTTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:793832/237‑1 (MQ=255) tgttttCG‑CGTTTATTCACAAATTGTTAATTAATTATTCACGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTGGGGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CAAAAAAAAAAAAAAAACGGGA‑GTT‑GCCATGGTGA‑GCAAAAGTAATAAACAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:1852752/237‑1 (MQ=255) ttttCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TCAGACAAATACAAAAAATGGA‑GTT‑GCGATGATGA‑GGGAAAGAAATAAAAAACAAGC‑AGTGAATAAAGTGACAGAGGATGTTGCT‑CACATTACACCCATGATTTTTAACCGAATGCCTGATGAAGCGGTGGTGAAACTaaaaaa > 1:99972/1‑237 (MQ=255) cg‑cgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAATTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACATAGATTGTCGTT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 1:759988/239‑1 (MQ=255) ttaaTTCACGATCTGTTAATAACATTTTACGGGTTGAAAAAATTATAAAACCACATTTTGTTTGGTAGTTTGTGGGGTT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAACGTGAA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAATGAAATAAGCACCAGAC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑ACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAgg < 1:2097036/236‑1 (MQ=255) gAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAAATTTTTAGTGTGATTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCAATGAGGA‑GAGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑GGTGAATAAGTGGACGGAGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGaaa < 1:181317/239‑1 (MQ=255) aaCTTTTAATTACATATTCCCGGTGCAAAAAAATAAAAACACAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGT‑A‑AT‑TTTTT‑CCAAAAAAAAACAAAAACGGGG‑GTT‑TCAATGAGGA‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAAAAAGTTGAAAGAGATGGTCGTT‑AACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAAc < 2:1288013/239‑1 (MQ=255) aaCTGTTAATTACATATTGAGGGTGAAAAAAAATAAAAAACAAAATTTTTGGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAAAAAAAAAAAAAAAGTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGTAATAAGCAAGAGGC‑GGTAAATAAGTTGAAAGATATTTTTGTA‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGaa < 2:2133534/237‑1 (MQ=255) gTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑GA‑ATTTT‑TCAAACAAAAAAAAAAAATGGA‑GGT‑GCCCTGATGA‑GCGGAAAAAAAAAACAAAAGGG‑AGAGAATAAAATGACAGAGATTTTTGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTTTACCCGAATGACTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAGCTAAAGGATG‑CCGAAAcgtcg > 1:23287/1‑239 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAAAACAAAAAATGGA‑GTT‑GCCCTGCTGA‑GAGAAAGAAATAAACAACAGGC‑AGAGAAAAAGGTGACAGAGATTGTCGCC‑AACCTTACCCACCTGATTTTTACCCGAAAGCCTAATGAAGTGGGGGAGAAACTAAAAAAGCTAAAGGATA‑CCCAAAcggcc > 2:1368830/1‑235 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TCAAAAAAAAACAAAAAAAGGA‑GGT‑GGCCTGGTGA‑GCGGAAGAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAGAAAAAGATGACAGAGATTGTCGCT‑AAATTTACCGCCATGATTTTTACCCCAATGACCGATGATGCGGGGGATAAACAAAAACAACTAAAAGAAG‑ACGaaaagacg > 2:871535/1‑233 (MQ=255) aTTAAATATTCACGGTGGAAAAAAAAAAAAAACCAATTTTTTATGGTTAGTTTGGGGCGTT‑A‑AT‑TTTTT‑CAAAAAAAAAAAAAAACCGGGA‑GTT‑GCCAGAATGA‑GAAAAAGAAAAAAGCAACAGGC‑AGTAAATAAGTGAACAGAGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGa < 2:1998433/239‑1 (MQ=255) ttACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACAACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCAATGATGA‑GCAAAAGTAATAAGCACAAGGC‑AGTGAATAAGTTGACGGATTTTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGAt < 1:2218177/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTAGGGGTAGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGTTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:169657/196‑1 (MQ=255) ttttCATGGGGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTGAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTC‑ACAAAAAAAAAAAAAAGCGGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGAAAGAAGCAACAGGC‑AGTAAATAATTAGACAGGGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1765213/237‑1 (MQ=255) tattacaggTGACAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGA‑GTT‑GCAATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACGGGA‑AGATAATAAGGTGACAGAGTTAGTCGCT‑AACTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:2156242/232‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGTAATAAGAAACAGCG‑AGTGAATAAGTTGACAGAGGTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1858816/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAGAAAAATAAAAAAAAAGGA‑GTT‑GCGATGATTG‑GCGGAAGTAAAAAGCAAAAAGA‑AAAGGATAAAATGAGAGAGATTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGAATTTTACCCGAAAGCCTGATGGCGTGGGGGGTAAAATAAAACAGCAAAAAGAAG‑CCCAAACGTCGTCGGTTGGGaa > 1:1667682/1‑239 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAAAAAAAAAAAAAAAAATGA‑GTT‑TTCATGATGA‑GGGGAAGGAAAAAAAAAAAAGC‑AGAGAATAAATTTAAAAAGAATGTCGCT‑AAATTTAACGCCCAGATTTTTAACCGAATACCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGATAAAAGATG‑GCCAAAAGTCGTGGATggggga > 1:1291554/1‑237 (MQ=255) tcgcGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGAT‑A‑AT‑TTTTT‑CGAGAAAAATACAAAAACTGGA‑GTG‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAGTCACCGGGC‑AGGGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGaaaa < 1:1840453/236‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGG‑AA‑TTTTT‑TCA‑ACAAAAAAAAAAAATAGA‑GTT‑GGCATTATGA‑GGGGAAATAATAAAAAAAAAAC‑AATGAAAAAAATTAAAGAGAATTTTGCC‑AACATTACCCCCCAGAATTTTACCCGAAAGCCTCATGACGTGGGGGATAAACCAAAAAAACTAAAAGAAG‑CCGAAACAGCGGCGGTggggggaa > 2:45028/1‑235 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGCGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑ATTTT‑TCAAACAAAAAAAAAAAAAGGA‑GGT‑GGCATTTTTG‑GGGGAAATAAAAAACAAAAAGA‑AGAGAAAAAATTGTAAGAGAATTTCGCT‑AACTTTTACCCCACGAATTCTAACCGACTTCCTGATGACGGGGGGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAAGAAG‑CCGAAACACCGCCCATggggggaa > 2:626731/1‑235 (MQ=255) ggggaaaaaaaaaaaaaCCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGAGGGGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAAAAAAAAAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GGAAAAGTAATAAGAAAAAGGC‑GGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:871228/233‑1 (MQ=255) gggcaaaaaaaTAAAAAACCACATTTTAAGTGATAGTTGGGGGCGGT‑A‑AA‑TTTTA‑CAAGAAAAAGACAAAAACTGAA‑GTT‑GCAATGAGGG‑GCAAAAGTAATAGGCACCGGTC‑ATTGAATAAGTTGAAAGAGTTGTTGGCT‑AGCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:913403/233‑1 (MQ=255) gggaaaaaaaaaaaaaaCCCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGTT‑A‑AA‑TTTAA‑CCAGAAAAAAAAAAAAACGAGA‑GTG‑GCCATAAGGA‑GCGAAAGTAAAAAGCAACAGCT‑GGTAAATAAGCGGACGGGGTTGGTCGTG‑AGTTTGACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:2186229/233‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAAAAAAACAATTTTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGAT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAAAAAAATACAAAACCTGGA‑GTT‑GCCAAGATGA‑GCAAAAGAAATAAGCACCGGGT‑AGTAAATAAGTTGGAAGAGATTGGCGTT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:864466/238‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑GA‑TTTTT‑TTCAACAAAAAAAAAAAAAGGA‑GGT‑TTCATGATTA‑GGGGAAATAAAAAAAAAAAAAC‑AGAGAAAAAAATGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTTTCGCCCTGCTTTTTACCCCACAGACTGATGACGCGGGGGGTAAACTAAAAAAACTAAAAGAAG‑GCGAAACGCCGTCCATgggggagaaaatat > 2:1840453/1‑229 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TAAGACAAATACAAAAACAGGA‑GAT‑GTCATGTTGA‑GGGAAAATAATAAACAAAAAGC‑AATGAATAAATTTACAGAGATTGTCGCC‑AACTTTTCCGCCATTATTTCTCCCCCAACGCCTTTTGACCTGGTGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGATG‑GCAGAAAGTCGGCGATGGGGGAAATTAttc > 1:200404/1‑237 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGG‑G‑AA‑TTTTT‑TCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGGTT‑GCC‑TGATGAGGGGAAAGAAAAAAAAAAAAGGA‑AG‑GAATAAGTTGGAAGAGAATTTCGCTAAACTTTA‑CGCCAAGATTTCTACCCCAAAGACCGATTGCGGGGTGGGAAAAATAAAAAAGCAAAAAGATGCCCGAAAGGCGGCGGAGGGGGAAAAtaaat > 2:278031/1‑235 (MQ=255) gaaaaaaaTATAACACCAATTTTTTAGTGGGTGTTTGTGGGGGT‑G‑AA‑TTTTC‑CCAAAAAAAACAAAAAACGGGA‑GTT‑GCAATGATGA‑GCAAAAAAAAAAAGCAACAGGG‑AGTAAATAAGTGGACAGAGTTTGTCGCT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTa < 2:1540727/236‑1 (MQ=255) aaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAAAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GGCATGATGG‑GCGCAAGAAATAAGAAAAAAAC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTTGCC‑AAAATTACCGCCATGATTTCTAACCGAATGACTGATGACGTGGGGGATAAAATAAAAAAGATAAAGGATG‑CCGAAACGTCGGCGGTGGGGGAAATTATATAcaa > 1:1860869/1‑237 (MQ=255) aaaaTATAAAACCCAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CCAAAAAAAAAAAAAAACGGGA‑GTT‑CCAATGATGA‑GCAAAAGAAATAAGCACCAGGA‑AGTGAATAATTTAAAAGTGTTTCTCGCT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:309262/239‑1 (MQ=255) aaaTATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTGTGTGGCGGT‑A‑AT‑TTTTA‑CCAAAAAAAGACAAAAGGGGGA‑GTC‑GCCTTGAGGG‑GGAAAAGAAAAAGGCAACAGGA‑AGTAAAAAAGTTGAAAGAAATTGTCGCT‑ACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTA‑CATACg < 1:1411651/239‑1 (MQ=255) aaaataAAACAACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCTGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAAACAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGAAAAAAGCAACAGAT‑AGTAAATAAGTGGACAGAGATTGTCGTT‑ATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:276629/236‑1 (MQ=255) acaTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGA‑GTT‑GCAATGATGA‑GCAAAAGAAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 2:23287/239‑1 (MQ=255) acaTTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGA‑G‑AA‑TTTTC‑CCAAAAAAATAAAAAAAGTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GAAAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTAAATAAGTTGACAGATTTTGTCGTA‑AACTTTACCGACATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:626731/239‑1 (MQ=255) gTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑TCAGACAAATACAAAAAATGGA‑GTT‑GCCCTGATGA‑GCGAAAGAAATAAAAAAAAAGC‑AATGAATAAGTTGACAGAGAATTTTGCT‑AACTTTAACCCCCAGAATTCTAACCCAATGGCCGATGAAGTGGTGGGTAAAATAAAAAAACTAAAGGAAG‑CCGAAAAGGCGCCGGTGGGGGAAAATATCTACCAAACAATGTTTGACAACATTGaaaa > 1:1443709/1‑239 (MQ=255) gttttGGGGCGGG‑A‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAAAAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCGAGGATGG‑GAGAAAGAAATAAGAAACAGGA‑AGTAAATAAGTTAACGGAGATTTTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:1860869/237‑1 (MQ=255) tggtgGGGGT‑A‑AA‑TTTTT‑CAAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCAATGATGA‑GCAAAAGAAATAAGCAACGGGC‑AGAGAATAAGTTGAAAGGGATTGTCGAT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGAtt < 1:351169/236‑1 (MQ=255) tttgGGGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGAAAAAAACAAAACCTGGA‑GTG‑GCCAGGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AATAAATAAGTGAACAGGTATGGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGa < 2:99972/237‑1 (MQ=255) gT‑G‑AA‑TTTTTGCAAGAAAAATAAAAAAACGGGA‑GTG‑GCCATGATGC‑GCGAAAGAAAAAAAAACCGGGA‑AGTGAATAAGTTGACAGA‑TTTTTGGCTAAACTTTTCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 1:1776920/238‑1 (MQ=255) ttttt‑CAAAAAAAATAAAAAAACGGGA‑GTT‑GCAATGAGGA‑GAGAAAGAAAAAAGCAACAGGC‑AGTAAATAGGTGGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 2:331355/146‑1 (MQ=255) ttcccAGAAAAATAAAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCAAAAGTAATAAGCAACGGGC‑GTTGAATAATTTGCAAGAGATTGTCTGT‑ACTTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:562141/236‑1 (MQ=255) tttcAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGAATGACCTGAATCGTcctg > 1:56740/4‑238 (MQ=255) | TGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_007779/3204855‑3205326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |