Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 3,205,125 | A→G | 11.9% | S3G (AGC→GGC) ‡ | ttdA → | L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,205,125 | 0 | A | G | 11.9% | 193.5 / 5.3 | 95 | S3G (AGC→GGC) ‡ | ttdA | L(+)‑tartrate dehydratase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/54); new base G (6/6); total (34/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.35e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑G‑AA‑TTTTT‑CCAGACAAATACAAAAACTGGA‑GTT‑GCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGC‑AGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCG > NC_007779/3204888‑3205359 | tGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCG‑CGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGG‑G‑GA‑ATTTT‑TCAGACAAAAAAAAAAAATACA‑GTT‑GTCCTGATGA‑g > 1:1815157/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |