Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 3,858,404 | T→G | 17.2% | G184G (GGT→GGG) | cysE → | serine O‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,858,404 | 0 | T | G | 17.2% | 257.0 / 6.2 | 107 | G184G (GGT→GGG) | cysE | serine O‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/52); new base G (19/5); total (50/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.88e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TGAAGGGTTTTCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCC‑GAAAATTCGTGAAGGT‑GTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAAGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACCGGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTA > NC_007779/3858166‑3858639 | tGAAGGGTTTTCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGt < 1:771100/239‑1 (MQ=255) 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ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGGTTGTAAACGACGGATCGATTGTGCCATCTGTGACGCTTGGCGGGCCggggg > 1:1118016/1‑237 (MQ=255) ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGGTTGAAAACGACGGATCGATTCTGCAATGTGTGAAGCTTGGGGGGACgggga > 2:150613/1‑237 (MQ=255) ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 1:2017579/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |