| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,923,939 | 0 | G | T | 9.7% | 511.9 / 5.8 | 163 | intergenic (‑71/‑82) | Y75_RS19450/Y75_RS19455 | OmpA family lipoprotein/biotin sulfoxide reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/81); new base T (17/2); total (80/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |