Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 4,231,754 | A→G | 14.5% | E145G (GAG→GGG) | Y75_RS20955 → | Na/Pi cotransporter family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 4,231,754 | 0 | A | G | 14.5% | 345.6 / 9.1 | 123 | E145G (GAG→GGG) | Y75_RS20955 | Na/Pi cotransporter family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/64); new base G (17/3); total (56/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ATGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAGGTGATCTTTGCCTCGCTGACCGGCGATATTCTGCTGGATGCGCTGATTGGCGCGATGTTCGCCATTATCAGCTACTCCAGCCTTGCTGCTGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCT > NC_007779/4231516‑4231985 | aTGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGTGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGa < 1:88044/239‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGa < 1:1700946/239‑1 (MQ=255) gCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCCCGTCGGGATTTGTCTTGGGGTGGTTTTTCCTGCGCTGGGGt > 2:1104914/1‑239 (MQ=255) ggTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCCCCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGa < 1:1287287/239‑1 (MQ=255) gTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTTCTCGGACGCCAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGGATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGGGTTGAt > 1:2164548/1‑239 (MQ=255) tGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCCCGCCGGGATTGGTCTTGGGGTGTTTTTGCTAGCGCCGGGGTTgtgt > 2:1555100/1‑236 (MQ=255) cTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATtgtg < 1:2211153/238‑1 (MQ=255) tCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCa < 1:1555100/239‑1 (MQ=255) tCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATCTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCa < 2:1969578/239‑1 (MQ=255) gTTTGTCGCTCAGGTCCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAgg < 1:1037457/239‑1 (MQ=255) 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tctGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGGCGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAgg < 1:1959120/239‑1 (MQ=255) tctGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAgg < 1:106761/239‑1 (MQ=255) ctGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAGGt < 2:816545/239‑1 (MQ=255) gTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGTCGCTAATTGCGCGTATTCTCGCCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTAGTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGa < 1:66363/185‑1 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aGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAGGTGATCTTTGCCTCGCTGACCGGCGATATTCTGCTGGATGCGCTGATTGGCGCGATGTTCGCCATTATCAGCTACTCCAGCCTTGCTGCTGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTg > 1:1886774/1‑206 (MQ=255) | ATGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAGGTGATCTTTGCCTCGCTGACCGGCGATATTCTGCTGGATGCGCTGATTGGCGCGATGTTCGCCATTATCAGCTACTCCAGCCTTGCTGCTGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCT > NC_007779/4231516‑4231985 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |