Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 4,322,904 | A→C | 12.9% | V180G (GTG→GGG) | phnK ← | phosphonate C‑P lyase system protein PhnK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,322,904 | 0 | A | C | 12.9% | 170.2 / 2.7 | 83 | V180G (GTG→GGG) | phnK | phosphonate C‑P lyase system protein PhnK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/20); new base C (8/5); total (58/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCATCCGGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGTGCCCCGGTCGCCATCAGCCGCTCGCCGATATTGCCGCC > NC_007779/4322668‑4323136 | cgcATCCGGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCAcc > 1:1563014/1‑239 (MQ=255) aTCCGGCACCGGCTCAATTCGGCAAAACCGAGGACCCCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGCCGTCGAGCACCCGGTCGGTTAACCCACTCTCCCCCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGCCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGac < 2:4961/239‑1 (MQ=255) tCCGGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCa < 1:22836/233‑1 (MQ=255) gCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACAGTCCGCCAGCAGGCGCGCGACGCCTAACTCATGGGTGACAATCACCACCGCGCGGTTCAGCTCCCCCACCAGGCCGCGCAGCAGGCCGAGCAGGCGGGCCCGCCCCGCCACAt > 1:706095/1‑238 (MQ=255) ggCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGGTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCCAGCAGGCGGGCCCCCACCCACACACCCacc > 2:358283/1‑236 (MQ=255) gCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACCCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCCCGCACCAGGTCCAGCACGCGGGCCTGCCCCCCCACATCCCGcc > 2:2144531/1‑238 (MQ=255) ttCTGCAAACCCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCCCCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCCCCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCcggt < 1:358283/239‑1 (MQ=255) cAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACCCATCCCGCCCGCcggtcggg > 1:1310721/1‑237 (MQ=255) cAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCcggtcggt > 1:707996/1‑238 (MQ=255) aaaaCCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTGCATCCCCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGtt < 1:73084/238‑1 (MQ=255) 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tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCCGTCGGGTTATCCCTCAACACCCACCTCGGATGCCCCACCAg > 2:1602390/1‑239 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCCGTCGGGTCATCCATAAAAACCAGCTTCGGATGCGTccccca > 1:747692/1‑237 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCCACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACCCCAGCTTCGGATGCGCCACCAg > 1:254821/1‑239 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGt > 1:685266/1‑239 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGGTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCCCCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAg > 1:514427/1‑219 (MQ=255) ggTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCCCCCACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCCTCGGATGCGTCCCCAGGGTGCgg > 2:2091073/1‑239 (MQ=255) gtcgAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCaa > 1:1476827/1‑239 (MQ=255) cccgccggccggtAAACCCCCCCCCCCCCCCTTG‑CCCCTGCTCCACCCCCA‑GCAAACGGCCCCCCGGCGGGCGGGCGCCGCCAAAACCATGGGTGACAACCCCCCCCGCGGGGTTCAGCCCCCCCACCGGCCCGCGCAGCAGGTCGAGCGGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCGGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGc < 2:685266/234‑1 (MQ=255) cgcgGTCGGTAACCCCACCCCCCCCCACTCC‑CCCCTGCTTCACCCCCA‑GCACACGGCCCGCCAGCGGGCGGCCGCCCCCTAAATCAGGGGTGACAACCCCCCCCGCGAGGTTCAGCCCCCCCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCaaa < 2:747692/239‑1 (MQ=255) 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tcggtTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTAGGATTCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACcct > 1:1181731/1‑238 (MQ=255) ttACCCCACTCCCCCCCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCAGGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCCCCCCCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGtt < 1:233446/177‑1 (MQ=255) ccctccCCACCTCTGG‑CCCCTCCTTCAT‑ACCACGAAAACGGCCCGCCGGCGGGGGGGGGCCGCCAAAACCATGGGTGCAAATCCCCCCCGCGGGGTTCAGCCCCCCCCCCAGGCCGCGGAGCGGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATAccg < 2:1787039/237‑1 (MQ=255) cACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATAcc > 1:325176/1‑238 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cTTCATCACCA‑GCAACCGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCCCCACCCCCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCa < 1:9943/200‑1 (MQ=255) tcatcaCCA‑GCAAACGGCCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCCCCCCCGCGAGGTTCAGCCCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCaa < 1:2087688/192‑1 (MQ=255) ccGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGGCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGa > 1:228167/1‑239 (MQ=255) cagcggGCGGGCGCCGCCTAAATCATGGGTGACAATCCCCCCCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCGGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtct < 1:2091073/239‑1 (MQ=255) cagGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGCCACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCCTCGGATGCGTCCCCAGGTTGGGGGCAATCTGCAAACGCCCGCGCATACCCCCGGCAAAGGGGGGCGGCAGGTCGACGGTCCGGTTTGCgggggctccc > 2:825165/1‑231 (MQ=255) cagGCGGGCGACGCCTAAATCAGGGGTGACAATCCCCCCGGGGGGGTTCAGCCCCCCCCCCAGGCCGCGCCGAAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCg < 1:1786521/149‑1 (MQ=255) ggcgggcgACGCCTAAATCATGGGGGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACCTCCAGCCCGCCGGGCGGGTCCTCCATAAACCCCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTTCAAACGCCGCTGCATACCCCCGGGAAAGGAGGCCGGCAGGTCGTCGAACCGGTTGGCggggaccgcccc > 2:103983/1‑229 (MQ=255) ccTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGcc > 1:433558/1‑238 (MQ=255) tGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGGCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGCTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGGGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGTTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc > 1:451486/1‑239 (MQ=255) gggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCa > 1:1719555/1‑132 (MQ=255) gggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGGCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCCCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGcgcg > 1:271002/1‑239 (MQ=255) gggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGGCGGCAGGGCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGcgcg > 1:640772/1‑239 (MQ=255) ggggccAACCACCACCGGGGGTTTCAGCCCCCCCCCCAGGCCGCGCAGAGGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGcgcg < 1:2086821/233‑1 (MQ=255) ggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCCGGTCGGCGATCCGGTTGGCCGGAATCTCCACCTCCTTCCGCCCCCTCCGCGCgg > 2:451597/1‑239 (MQ=255) caccGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAgg > 1:20793/1‑164 (MQ=255) cgcgAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg > 1:1299523/1‑238 (MQ=255) cgAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCg > 1:341876/1‑239 (MQ=255) ttCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGGAAAGGAGGTCGGCCAGGCGGCGATCCGGTTGGCGGGGATCTCCCCCTCTTCCCGCCCCCTCTGCCCGGTGGGCCGAAAATCGCCggtaat > 2:2060965/1‑234 (MQ=255) ccccaccgGGCCCCGCGGCGGTCCGGCCAGCCGGCCCTGCCCCGCCCCATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGTGccc < 1:2204294/237‑1 (MQ=255) caccaccaGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGCGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACtt > 1:797748/1‑201 (MQ=255) ccaccaGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGCAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCCCTTCTGCGCGGGGGCACGAAGATCGCCGGAATGACGTGCCCCg > 2:9248/1‑239 (MQ=255) ccccgcgccgccCAGCGGGGCGGGCAGGAGGCCCTCCCCCCACACACCCCCCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGTGCCCCgg < 2:254821/233‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 1:225041/1‑187 (MQ=255) ccGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGGGGCCCGAATATCGCCGTAAAGACGTGCCCCGGTCCCCa > 2:965367/1‑238 (MQ=255) cgcAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGGGCCCCGGTCGCCATCa > 1:637450/1‑238 (MQ=255) cgcAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCCCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGGCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACCTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGCGCCCCGGTCCCCATCa > 1:2110326/1‑238 (MQ=255) cGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGGGGCACGAATATCGCCGTAATGACGTGCCCCGGGCGCCCTCCGCCCCCCCCCGATAtttc > 2:1680283/1‑236 (MQ=255) cGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGGCGGTTCCTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCCGCCCCTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGCGCCCCGGTCGCCATCACCCCCCCGCCGatctgtc > 2:1776648/1‑233 (MQ=255) ccTGCAACGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCCTAAACACCAGCCTCGGAAGCGCCCCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGGCGCCGGACCGGCTGGCGGGGATATTCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCGCGAAAATCGCCGTAATCACGCGCCCCGACCCCCATCCCCCGCTCGCCGCTATCcccgcc > 2:2054246/1‑238 (MQ=255) cTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACAcc > 1:254656/1‑46 (MQ=255) cTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACAcc < 2:254656/46‑1 (MQ=255) | CGCATCCGGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTG‑CCCCTGCTTCATCACCA‑GCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATGACGTGCCCCGGTCGCCATCAGCCGCTCGCCGATATTGCCGCC > NC_007779/4322668‑4323136 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |