Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 864,182 | A→G | 9.3% | D40G (GAT→GGT) | fsa → | fructose‑6‑phosphate aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 864,182 | 0 | A | G | 9.3% | 549.4 / 5.0 | 206 | D40G (GAT→GGT) | fsa | fructose‑6‑phosphate aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (85/93); new base G (21/2); total (107/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
ATTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGTGTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGC‑GGGTAAAAAA‑CCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAGCGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCC‑AGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGG > NC_007779/863946‑864414 | ttCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGTGTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGC‑GGGTAAAAAA‑CCGCTGGAtgttgt > 1:631734/1‑237 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |