| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 969,339 | A→G | 15.9% | R184R (CGA→CGG) | lpxK → | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 969,339 | 0 | A | G | 15.9% | 206.2 / 4.5 | 83 | R184R (CGA→CGG) | lpxK | tetraacyldisaccharide 4'‑kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (7/61); new base G (12/3); total (19/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.77e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGCC > NC_007779/969103‑969573 | gCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTgag‑ctag < 1:1901922/238‑1 (MQ=255) cGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGGGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTgag‑cgag < 1:2205510/237‑1 (MQ=255) aaCCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGGGTGAG‑GGGGCGGGGCGCTTa > 1:1393857/1‑239 (MQ=255) tgtgTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCCATGGGTGGGTGGAGCgggggcgttaagg > 2:159933/1‑230 (MQ=255) tgtgTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCAATGGGGGGG‑GGAGCGGGGGGCTTAAAg > 1:411058/1‑238 (MQ=255) gtgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGT‑GGGGCCAATGCGGTGG‑CGGGGGGGGGGCTTtaa > 2:1435478/1‑236 (MQ=255) tgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCGAAGCGGTGG‑CGGGGGGGGGGCTTTAAGGCg > 2:1170138/1‑239 (MQ=255) tgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCCATGCGTGGT‑GGGGGGGGGGGGTTAAAGTCg > 2:1571844/1‑239 (MQ=255) tgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGGGGGGG‑GGGGCGGGGGGGTTAAAGTCg > 1:869729/1‑239 (MQ=255) tgtTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTc < 1:298222/238‑1 (MQ=255) tGATTTCTCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGGTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGt < 1:1170138/238‑1 (MQ=255) aTTTATCAACGCACTGCTGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAAGGCGTGGG‑CGGGCGGGGCGCTTAAAggggggtga > 1:743244/1‑231 (MQ=255) tCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGGGGTTGCCGGC‑GGGGGGGATGGGTGGG‑GGGGGGGGGGGCTTTAAGTCggggggggtgg > 2:298222/1‑230 (MQ=255) aaCGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCACGTTCGTTCGGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTa < 1:1927442/239‑1 (MQ=255) aCTGATGCGCCTGTTGCGGTTTATCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAGTGGCGGCG‑GGGGCGGGGGGCTTATAGTTGGTTGGTGGGGtgaacgg > 1:1891238/1‑233 (MQ=255) cTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTc < 1:1395755/239‑1 (MQ=255) tGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGGCCAAT‑CGTGGG‑CGAGAGGGGCGCTTAAAGTGGGGGGAGGCGGGaaatcgg > 2:1497513/1‑233 (MQ=255) gcgcCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAAcgg < 1:1435478/239‑1 (MQ=255) cgcCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGGGGG‑CGGGCGGGGGGCCTTAAGTCTGGTTTTGGGGTGAACGTCGAcggc > 2:1652079/1‑239 (MQ=255) gcCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACACTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAAcggc‑g < 1:1228846/239‑1 (MQ=255) ccTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCggg > 2:488634/1‑200 (MQ=255) ccTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCggg < 1:488634/200‑1 (MQ=255) cTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACTCCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑Ggt < 1:490401/239‑1 (MQ=255) cTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGGGGGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGGTGCGGGAATCGTTAAcggg‑ggg > 1:292383/1‑238 (MQ=255) cTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑Ggt < 1:1691504/239‑1 (MQ=255) cTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑Ggt < 1:441634/239‑1 (MQ=255) tGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAGGCCATTCTGGCGCAACACCCTGAGGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑Ggtg < 2:1877570/239‑1 (MQ=255) tGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGTCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCCATGCGTGGG‑CGGGGGGGGGGCTTGAAGGTGGGTGGGGGGGGAAGCGTCAAtggc‑gggggg > 2:595422/1‑234 (MQ=255) ttttTCCCTTGCGTTCTGGTGCGGTGAAAGCCATTCTGGCGCAACTCCTGGATGTGCAGATCATCGTAAGCGACGACGGTTTACAGCATTGCCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTTGTTATTGATGGTGTGCGTCGCGTTGGCAATGGGTGGTGGTTGGCTGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGGAGGGCGGTTAGAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCGCTCg < 2:1242371/238‑1 (MQ=255) tttCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCg < 1:1785061/238‑1 (MQ=255) ttCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGCGGGGGCAAATGCG‑GGG‑CGGGGGGGGGGCGTAAAGTGGGGTGGTGGTGGGAACGTCGAcggc‑ggggggtcgccgc > 2:77344/1‑228 (MQ=255) tctcCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCCATGCGGGAG‑GGAGCGGGGGGCGTAAAGGCGGGTGGGGGGGGAATCGTTAAcggg‑gggggtccccccc > 2:1017291/1‑227 (MQ=255) gttcgttcTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCggg < 1:1767874/182‑1 (MQ=255) tcTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCAATGCGGGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGGCGGGTGGTGGGGCAACCGTCAAAGGCGGGTGTCCCCCGCACCggggcaaac > 2:1622940/1‑231 (MQ=255) ttCTGGCGCAACCCCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAg < 1:755529/208‑1 (MQ=255) ggCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAgg < 2:974220/239‑1 (MQ=255) ggCGCAACACCCGGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGGTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAgg < 1:2025063/239‑1 (MQ=255) cgcAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGc < 1:1017291/238‑1 (MQ=255) cgcAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGc < 1:122614/238‑1 (MQ=255) gcctcacCCTGATATGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTAGTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCgg < 2:250/235‑1 (MQ=255) cccTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCg < 1:1959404/166‑1 (MQ=255) gATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACg < 1:1652079/239‑1 (MQ=255) tgtgCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTa < 1:595422/239‑1 (MQ=255) tcatcGTAGCCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTAGTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTAcg < 1:1074061/239‑1 (MQ=255) tcatcGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGt < 1:1222718/236‑1 (MQ=255) tcatcGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTa < 2:1425558/237‑1 (MQ=255) tcatcGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTAc < 2:1982818/238‑1 (MQ=255) catcGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGGGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGGGTCCCTCGCAGCGGGGAAATCCCCCTGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGGGGATTTTCGTACCGGGAcgc > 1:1894860/1‑239 (MQ=255) aCCTACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGa < 1:159933/239‑1 (MQ=255) ccGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTaaa < 1:1254915/130‑1 (MQ=255) ccGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATccc < 1:1285359/184‑1 (MQ=255) cgGTTTACAGCGTTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAGATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCt < 1:1140380/238‑1 (MQ=255) cgGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCt < 1:1410918/238‑1 (MQ=255) ttACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCt < 1:2088138/239‑1 (MQ=255) tACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAAcggc‑g < 1:263555/147‑1 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAAc < 1:39545/237‑1 (MQ=255) aTTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGa < 1:501458/235‑1 (MQ=255) ccGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAg < 1:1507888/150‑1 (MQ=255) ccGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCAt < 1:236257/169‑1 (MQ=255) ccGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCt < 1:124278/223‑1 (MQ=255) cgTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATgg < 1:1571844/238‑1 (MQ=255) tgGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCt < 1:2263010/211‑1 (MQ=255) cGTTATTGATGGTGTGCGTGGCGTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATccg < 1:429968/238‑1 (MQ=255) cGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATccg < 1:77344/238‑1 (MQ=255) tATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCcgccgc < 1:752179/239‑1 (MQ=255) tATTGATGGTGGGCGGCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCcgccgc < 1:593236/239‑1 (MQ=255) tGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCt < 1:19845/195‑1 (MQ=255) gCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCa < 1:613206/239‑1 (MQ=255) cGTGGCTTGGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGGGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCa < 2:869729/238‑1 (MQ=255) cGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCa < 1:1622940/238‑1 (MQ=255) gTCGCTTTGGCAAGGGCTGGTGGTGGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑Cg < 1:1989131/239‑1 (MQ=255) gttttGCAATGGGTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGGCAATGCGTGAG‑CGGGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTg < 1:2027140/237‑1 (MQ=255) gtttGGCAATGGTGGGTGGTGGCGGGC‑GGGGCCAATGCGTGGG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGG‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTg < 2:411058/237‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGTGGTTGCGGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGGGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCAGGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGAtgtg < 1:1134134/239‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGAtgtg < 1:693368/239‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCa < 1:1886602/222‑1 (MQ=255) ggtTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGGGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCGTCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCT‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACa < 1:461496/238‑1 (MQ=255) ggtTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACaa < 1:955702/239‑1 (MQ=255) ggtTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACaa < 1:1944018/239‑1 (MQ=255) ggtTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACaa < 1:2228604/239‑1 (MQ=255) tGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAAcc < 1:1423329/238‑1 (MQ=255) cggc‑ggGTCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑a < 1:844184/238‑1 (MQ=255) gCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGt < 1:626416/103‑1 (MQ=255) ccAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGc < 1:1414029/205‑1 (MQ=255) gTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCt < 1:375966/238‑1 (MQ=255) ag‑cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGGGAATTTAAGTACCGGGACGCGGTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATTGCGGGGGGTGGGGCTCCCCCCCCCCTTTTTTTCCACCGCTGAAG‑TG‑GTGGGGGACAACCGGAAAAAATGTGTCCCggggc > 2:322769/1‑234 (MQ=255) g‑cgggcggGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGcc < 1:1593673/238‑1 (MQ=255) g‑cgggcggGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGcc < 1:1393121/238‑1 (MQ=255) g‑cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGcc < 1:1886106/238‑1 (MQ=255) g‑cgagcgGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCGCGCAGCGGTGAATTCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTGCGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGcc < 1:1777102/238‑1 (MQ=255) | GCGGGTGATGAACCTGTGTTGATTTATCAACGCACTGATGCGCCTGTTGCGGTTTCTCCCGTTCGTTCTGATGCGGTAAAAGCCATTCTGGCGCAACACCCTGATGTGCAGATCATCGTAACCGACGACGGTTTACAGCATTACCGTCTGGCGCGTGATGTGGAAATTGTCGTTATTGATGGTGTGCGTCGCTTTGGCAATGGCTGGTGGTTGCCGGC‑GGGGCCAATGCGTGAG‑CGAGCGGGGCGCTTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGC‑GGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCTGCCGGGTCAGGCGGTGAATTTACGTACCGGTACGCGTTGTGACGTTGCTCAGCTTGAACATGTAGTGGCGATGGC‑GGGGATTGGGCATCCGCCGCGCTTTTTTGCCA‑CGCTGAAGATGTGTGGCGTACAACCGG‑AAAAATGTGTACCGCTGGCC > NC_007779/969103‑969573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |