Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 1,813,761 | A→G | 13.3% | I372V (ATT→GTT) | Y75_RS09105 → | cystine/sulfocysteine:cation symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,813,761 | 0 | A | G | 13.3% | 270.7 / 3.3 | 104 | I372V (ATT→GTT) | Y75_RS09105 | cystine/sulfocysteine:cation symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/68); new base G (14/2); total (33/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGGTATGGCCTGTGCTGACG‑TTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTT‑TGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGG‑TTGCG‑CCTA‑CGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATT‑GCGAC‑GCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACTGCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGT‑TGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGCTGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAG > NC_007779/1813531‑1813995 | aGGTATGGCCTGTGCTGACG‑TTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTT‑TGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGG‑TTGCG‑CCTA‑CGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATT‑GCGAC‑g < 1:627090/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |