| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 1388812 | 135 (0.830) | 9 (0.060) | 7/412 | NT | 6.0% | coding (379/1542 nt) | tyrR | transcriptional regulator TyrR |
| ? | NC_007779 | = 1388962 | 151 (0.950) | coding (529/1542 nt) | tyrR | transcriptional regulator TyrR | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
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2:1022261/239‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACAGGCGCAGAAACTGGCGATGCTAAGCGCGCCGCTGCTGATTACGGGTGACACAGGTACAGGTAAAGATCTCTTTGCCTACGCCTGCCATCAGGCAAGCCCCAGAGCGGGc < 1:1694589/239‑1 (MQ=255) | TGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACAGGCGCAGAAACTGGCGATGCTAAGCGCGCCGCTGCTGATTACGGGTGACACAGGTACAGGTAAAGATCTCTTTGCCTACGCCTGCCATCAGGCAAGCCCCAGAGCGGGCA > NC_007779/1388726‑1389199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |