New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_007779 | 3748316 = | 0 (0.000) | 145 (0.890) | 82/424 | NT | 100% | pseudogene (665/873 nt) | tnaB | low affinity tryptophan permease TnaB |
? | NC_007779 | = 4056987 | NA (NA) | coding (391/417 nt) | Y75_RS20060 | hypothetical protein |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTCTATAAAATTCATTTACGGCAAAAAGGTTTTTAACTGAAGGTTCTGGAATCGAGAGGCTAAATAATCGTAATCCATTAACTTCGAATCCATCCATTGCTCTTAAAAAAGTAAGATAATCAGGTTGATTCTTAAAAAGAATACTAACTTC > NC_007779/4056752‑4057224 | tatCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTc < 2:802559/239‑1 (MQ=33) 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cAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATa < 1:709202/239‑1 (MQ=34) cAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTGGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATa < 2:962764/239‑1 (MQ=21) tGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCa < 2:209605/234‑1 (MQ=33) 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cACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTCTATAAAATTCATTTACGGCAAAAAGGTTTTTAACTGAAGGTTCTGGAATCGAGAGGCTAAATAATCGTAATCCATTAACTTCGAATCCATCCATTGCTCTTAAAAAAGTAAGATAATCCGGTTGATTCTTAAAAAGAATACTa < 1:836647/236‑1 (MQ=255) cACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTCTATAAAATTCATTTACGGCAAAAAGGTTTTTAACTGAAGGTTCTGGAATCGAGAGGCTAAATAATCGTAATCCATTAACTTCGAATCCATCCATTGCTCTTAAAAAAGTAAGATAATCCGGTTGATTCTTAAAAAGAATACTa > 2:836647/1‑236 (MQ=255) cACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTCTATAAAATTCATTTACGGCAAAAAGGTTTTTAACTGAAGGTTCTGGAAACGAGAGGCTAAATAATCGTAATCCATTAACTTCGAATCCATCCATTGCTCTTAAAAAAGTAAg > 2:361176/1‑205 (MQ=255) cACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTCTATAAAATTCATTTACGGCAAAAAGGTTTTTAACTGAAGGTTCTGGAAACGAGAGGCTAAATAATCGTAATCCATTAACTTCGAATCCATCCATTGCTCTTAAAAAAGTAAg < 1:361176/205‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |