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t‑GA‑T‑TTGC‑GTCCCCCC‑AACCA‑TGCCTTTCA‑TTAATT‑CGCT‑A‑CGCCCCGCCCCTCCCAGAC‑CAAACAGCCC‑AACAATTTCACCACTGCGAACCGCCAGA‑CTTATTGGCGTACGCACGCCTGGTGCTTTCACAGCATCAAGACGTAGGCGCTCCTCGCCATAACTACGCGGTTGCCAGCCGTAGATATCGCCAATGTCGCGCCCGACCATCGCCTGCACCAGCGCGTCGTGGTCAACctg < 1:1769713/238‑1 (MQ=255) t‑GA‑T‑TTGC‑GCCCCGCC‑AAACA‑TGCCTTTCA‑TTAATT‑CGCT‑A‑CGCCCCGCCCCTACCAGAC‑CAAACAGCCC‑AACAATTTCACCACTGCGAACCGCCAGA‑CTTATTGGCGTACGCACGCCTGGTGCTTTCACAGCATCAAGACGTAGGCGCTCCTCGCCATAACTACGCGGTTGCCAGCCGTAGATATCGCCAATGTCGCGCCCGACCATCGCCTGCACCAGCGCGTCGTGGTCAACctg < 1:786821/238‑1 (MQ=255) | TTGAGCGAACGAATGTGGTGATCGGCATTGTTTTCTTCCCAACCGTTGTTGATTACACAACCGCCGAGCACATGTTTACGTCTGGCACTGATGTTGATATTGTCGCGAACGGAGTGCACGGGAATAATGCCTTCCGCTTTGCGATCTTCCGGGCAGA‑GCATCATGCCTGCGGCAAT‑GGCGTGGCTCGGTTTACGAATATCGATCGGCTGTTGGTCGATATAAACCTGA‑CCGGC‑GGT‑GA‑T‑TTGC‑GTCCCGCC‑AAACA‑TGCCTTTCA‑TTAATT‑CGCT‑A‑CGCCCCGCCCCTACCAGAC‑CAAACAGCCC‑AACAATTTCACCACTGCGAACCGCCAGA‑CTTATTGGCGTACGCACGCCTGGTGCTTTCACAGCATCAAGACGTAGGCGCTCCTCGCCATAACTACGCGGTTGCCAGCCGTAGATATCGCCAATGTCGCGCCCGACCATCGCCTGCACCAGCGCGTCGTGGTCAACCTG > NC_007779/1986047‑1986519 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |