| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 2,081,558 | 0 | C | T | 32.8% | 206.2 / 158.5 | 160 | intergenic (‑60/+112) | Y75_RS10545/Y75_RS10550 | DUF496 family protein/FUSC family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/53); new base T (25/27); total (79/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.66e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
GCTTCAACGCTCATCCCCGGCTTGATGTAATCGCTCAGGTTGTCCAGCAGCAGGACGCGCTTCTGGTTGTCACGGATCTTTTTCTCAACGTCCTGAATTTCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGAAGGCTTGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGCCAACATTACTCATAGCTGCCGCAGATGACAATGCTTTTATCCCTTTTCACTATCATACCCTTTATCCTTGCTGAATCGAAGCAGCAGCAAGATGATTCTGAAGTTCAGGAATTATTTGCGCAAGGCCCGGCAAATCAGATTCGATAGCAACTCAAGCTGATGCGCCGTTTCCATGTTCAGCCACACATAACCATAGATTGGTGTTTCCACAACCTTCAGGTCATGGTGGTTATTGA > NC_007779/2081320‑2081794 | gCTTCAACGCTCATCCCCGGCTTGATGTAATCGCTCAGGTTGTCCAGCAGCAGGACGCGCTTCTGGTTGTCACGGATCTTTTTCTCAACGTCCTGAATTTCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGAAGGCTTGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGc < 1:227670/239‑1 (MQ=255) 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ttGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGTCAACATTACTCATAGCTGCCGCAGATGACAATGCTTTTATCCCTTTTCACTATCATACCCTTTATCCTTGCTGAATCGAAGCAGCAGCAAGATGATTCTGAAGTTCAGGAATTATTTGCGCAAGGCCCGGCAAATCAGATTCGATAGCAACTCAAGCTGATgcg < 2:1569320/238‑1 (MQ=255) ttGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGCCAACATTACTCATAGCTGCCGCAGATGACAATGCTTTTATCCCTTTTCACTATCATACCCTTTATCCTTGCTGAATCGAAGCAGCAGCAAGATGATTCTGAAGTTCAGGAATTATTTGCGCAAGGCCCGGCAAATCAGATTCGATAGCAACTCAAGCTGATgcgc < 1:663745/239‑1 (MQ=255) tGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGTCAACATTACTCATAGCTGCCGCAGATGACAATGCTTTTATCCCTTTTCACTATCATACCCTTTATCCTTGCTGAATCGAAGCAGCAGCAAGATGATTCTGAAGTTCAGGAATTATTTGCGCAAGGCCCGGCAAATCAGATTCGATAGCAACTCAAGCTGATGCGcc > 2:400385/1‑239 (MQ=255) 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GCTTCAACGCTCATCCCCGGCTTGATGTAATCGCTCAGGTTGTCCAGCAGCAGGACGCGCTTCTGGTTGTCACGGATCTTTTTCTCAACGTCCTGAATTTCACGTTGCAGTTTGTTCTTACGACGGAACAGACGAACAAATTCCAGTACGTCCTGGAATGAAGGCTTGGTAGTTTCCATTTTTATACCCCTGATAATGTGAGAGTCGGATTCGTTTAAGCAACCGCTATTCGTTAGGGCCAACATTACTCATAGCTGCCGCAGATGACAATGCTTTTATCCCTTTTCACTATCATACCCTTTATCCTTGCTGAATCGAAGCAGCAGCAAGATGATTCTGAAGTTCAGGAATTATTTGCGCAAGGCCCGGCAAATCAGATTCGATAGCAACTCAAGCTGATGCGCCGTTTCCATGTTCAGCCACACATAACCATAGATTGGTGTTTCCACAACCTTCAGGTCATGGTGGTTATTGA > NC_007779/2081320‑2081794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |