Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 3,329,674 | T→G | 12.5% | V286G (GTA→GGA) | dacB → | serine‑type D‑Ala‑D‑Ala carboxypeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,329,674 | 0 | T | G | 12.5% | 488.1 / 4.8 | 165 | V286G (GTA→GGA) | dacB | serine‑type D‑Ala‑D‑Ala carboxypeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/90); new base G (25/2); total (72/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.62e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TCCCCCGTGGTTCTGCCGAAGCGCAATACTGCGAACTGGATGTGGTGCCAGGCGACCTGAACCGCTTTACGCTGACGGGATGCCTGCCACAACGTTCTGAGCCGCTCCCGTTGGCTTTTGCCGTGCAGGATGGAGCCAGCTATGCCGGTGCAATTCTGAAAGATGAGTTAAAACAGGCGGGTATCACCTGGAGCGGAACACTGCTGCGCCAGACTCAGGTTAACGAACCTGGAACGGTAGTTGCCAGTAAACAGTCGGCCCCGCTGCACGATCTGCTTAAGATTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATAC‑GGTTTTCCGCATGATAGGCCATGCGCGCTTCAATGTGCCTGGAACA‑TGGCGGGCC‑GGGTCGGACGCCGTGCGTCAGATCCTGCGCCAGCAAGCCGGTGTCGATATTGGAAACACCATTATTGCCGATGGTTCAGGGCTTTCGCGGCATAACCTGAT > NC_007779/3329437‑3329911 | cGTGGTTCTGCCGAAGCGCAATACTGCGAACTGGATGTGGTGCCAGGCGACCTGAACCGCTTTACGCTGACGGGATGCCTGCCACAACGTTCTGAGCCGCTCCCGTTGGCTTTTGCCGTGCAGGATGGAGCCAGCTATGCCGGTGCAATTCTGAAAGATGAGTTAAAACAGGCGGGGATCACCTGGAGCGGAACACTGCTGCGCCAGACTCAGGTTAACGAACCTGGAACGGTAGTTg > 1:767097/1‑238 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |