| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 421,455 | A→T | 10.6% | I416F (ATC→TTC) | proY → | proline‑specific permease ProY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 421,455 | 0 | A | T | 10.6% | 390.7 / 5.8 | 136 | I416F (ATC→TTC) | proY | proline‑specific permease ProY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/91); new base T (14/2); total (42/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.02e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GTGATGACTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATC > NC_007779/421218‑421690 | gTGATGACTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTta‑ttat > 1:1651445/1‑239 (MQ=255) tgaCTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCggg < 1:984257/239‑1 (MQ=255) gaCTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGT‑GATTTTCCTGCTCTTTT‑TTATCgtgt > 1:1601623/1‑239 (MQ=255) cTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGGTg > 1:1763113/1‑239 (MQ=255) aCCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGAt < 1:1641473/239‑1 (MQ=255) ccGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTT‑TTATCGGGTTGAtt > 1:479679/1‑239 (MQ=255) tgTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCAc < 1:1811446/239‑1 (MQ=255) gTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCAcc < 2:879343/239‑1 (MQ=255) tGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCgg < 1:464181/239‑1 (MQ=255) aTCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTTTTCTCTTTT‑TTTTTGGGGTGATTTGTTTTCCCCCggctgcccgt > 2:1131862/1‑231 (MQ=255) gAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTAtct < 1:455517/239‑1 (MQ=255) aaCTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTAtct > 1:1177387/1‑238 (MQ=255) acgaaagcatGCCGGAAAACGTCTTCCTGGGGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTGCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGGTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCAGGTTGATTGGTTATCCCCCGGATACGAGTATCT‑Cg < 2:323123/232‑1 (MQ=255) aCTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑Cg < 1:468067/239‑1 (MQ=255) cTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGTTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGG‑GGATTTTCTGCTCTTTT‑TTTTCGGGGTGTTTGGTTTTTACCCGCGTACCCGTAtcttt > 2:306728/1‑236 (MQ=255) cTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GGTTTTTCTTCTCTTTATTTATGGGGTGGATTGGTT‑TCCCCCCGGTACGCGTAtct‑c > 1:650635/1‑237 (MQ=255) cTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTTTTACCCGGATACGCGGAttt‑c > 1:1343786/1‑237 (MQ=255) aCATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GGTTTTTCTGGCCTTTT‑TTTTCGGGGTTGTTGGTTTTTCCCCGGAGAAGCCCATct‑ctctt > 2:623447/1‑238 (MQ=255) aCATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTGCTCTTTT‑TTTTCGGGGTGATTGGTTATCACCCCGATACGCGTAtct‑c > 1:250308/1‑235 (MQ=255) aCATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTT‑TTATCGGGTTGAt > 1:668021/1‑208 (MQ=255) aCATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGAt < 2:668021/208‑1 (MQ=255) aCATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTg < 2:782210/239‑1 (MQ=255) catcatGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GGATTTTCTTCTCTTTT‑TTTTCGGGTTGTGTTGGTATAACCCGGGTACGCCTAtcctgcttt > 2:555305/1‑232 (MQ=255) tGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGT‑GATTTTTCTGCTCTTTA‑TTTTTGGGGTGGTTGGTTATCACCCCGGTACGCGGATCT‑CGCTTTATGTc > 1:698758/1‑239 (MQ=255) tGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GGTTTTTTTTCCCCTTT‑TTATTGGGGGGATTGGTTATTAACCCGATACACGTATCT‑CTCTGTTTg > 2:176688/1‑237 (MQ=255) cGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑t < 1:306728/239‑1 (MQ=255) gAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACTTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGT‑GGTTTTTCTGCTCTTTT‑TTTTCGGGTTGATTGGTTTTTACCCCGATACGCGTATCC‑TCCTGTTTGTTGG‑ttt > 2:294148/1‑239 (MQ=255) gAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGT‑GATTTTTTTGCGCTTTT‑TTTTCGGGTTGATTGGGTAACACCCCGATACACCGTTCT‑CGCTGTCTGTCTG‑ttt > 2:1220042/1‑239 (MQ=255) aaCGTCTTGCTGGTGATCGGCTCGGTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAACTTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTGAAGGCGCTGCAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGTCCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGTTCTTTA‑TTATCGGGTTGAGTGGGTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTAGG‑TTTcgc < 2:1494296/239‑1 (MQ=255) gTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTg < 2:1374341/239‑1 (MQ=255) gTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTg < 1:1826125/239‑1 (MQ=255) gTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTg < 1:176688/239‑1 (MQ=255) gTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTg < 1:538166/239‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGa < 1:1136910/239‑1 (MQ=255) gTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTGCTCTTTT‑TTATTGGGGTGATTGGTTTTCACCCGGGTACGCCTATCT‑CCCTGTTTGTCGG‑TTTCGCGTGGGTtgttgt > 1:620557/1‑239 (MQ=255) gATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGc < 2:1222421/239‑1 (MQ=255) gATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGc < 1:1257158/239‑1 (MQ=255) cttcgctGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGTGGATTTTCTGGCCCTTT‑‑TTATCCGGGTGGATGGGTATTACCCCGGTTCCCCGATCT‑CCCTGTTTGTTGGTTTTCGCG‑GGGttgttggtgttttt > 2:958993/1‑231 (MQ=255) cgctGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTGCTCTTTA‑TTATTGGGGTGATTGGTTTTCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑GTTTGCGTGGATTTTTgtggtggttgtt > 1:1565976/1‑233 (MQ=255) aaCCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTgg < 1:555305/238‑1 (MQ=255) aaCCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGa < 1:687768/239‑1 (MQ=255) tgtgggtgtggATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAAcgccg < 1:855328/238‑1 (MQ=255) gggtgtggATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCa < 1:940840/238‑1 (MQ=255) gggtgtggATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCa < 2:791970/238‑1 (MQ=255) gggtgtggATTATGATCCGGCTGTCGTAAATTGCGTTCCGTTGCCGTTTGCCGTCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCa < 2:1490633/238‑1 (MQ=255) tggATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCG‑GATTTTTCTTCTTTTTT‑TTTTCTGGTTGATTGGGTTTCACCCCGATGCGCGTATCT‑CGCTGGATTTCGG‑GTTCCCGTGGGTTTTTTTGTTGTTTATTTGGGGGGTGTTTTAAAgccgcccccaacc > 2:1830305/1‑232 (MQ=255) gATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GTTTTTTCTTCTCTTTT‑TTTTTGGGGTGTTTGGTTTTTACCCGGGTAAGCGTATCT‑CGCTGTTTGTTGG‑TTTTGTGTGGGTTTTTGTGCTGTTGATTGGTTGGGTGTTTTAACgccgcccccgtcct > 2:855328/1‑230 (MQ=255) gATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTAtc < 1:767382/166‑1 (MQ=255) gATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGc < 1:1699903/200‑1 (MQ=255) tgctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GGTTTTTTTGCTCCTTT‑TTTTTGGGTTGATTGGTTTTTACCCGGGTTCCCCGATCTCCCCTTTTTGTGGG‑TTTTG‑GGGGATTTTTGTGGTGTTGTTTTGTGGGGGGTTTTAACCCCGCCCCCCTCGTCGGCTGGCG‑Gag > 2:279585/1‑238 (MQ=255) tgctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑Gaa < 2:1177387/239‑1 (MQ=255) tgctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑Gaa < 1:812600/239‑1 (MQ=255) tgctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGGTGGTTGGTTATCACCCGGGTACGCGGATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGGGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGGTGGTTAAAAGCCGCCCCGATCGTCAGCTGGCT‑Gaa > 1:856161/1‑239 (MQ=255) gctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTTCTCTTTA‑TTATTGGGGTGATTGGGTATCACCCGGGTACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTTGCGGGGGTTTTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTTAACGCCGCCCCGATCGTCAGCTGGCT‑Gaaa > 1:940808/1‑239 (MQ=255) gctgTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑Gaaa < 1:1696887/239‑1 (MQ=255) gTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCC‑GATTTTCCTGCTCTTTT‑TTATCGGGTTGGTTTGTTATCACCCCGATACGCGTATCT‑CCCTTTATGTCGG‑TTTTGCGTGGGTTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGGGGTTTTAACGCCGCCACGTTCGTCAGCCGGCG‑Gtaaaac > 2:109585/1‑237 (MQ=255) cGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GTTTTTCCTGCTCTTTA‑TTATTGGGGTGATTTGTTATCACCCGGCTACGCGGCTCT‑CGCCTTATGTCGG‑GTTTTCGGGGGGTGTTGTGGTGTTGATTTGCGGGGGGTTTTAAAGCCCCCCCGAGCGTCTGCTGGCT‑GGAAAcacg > 2:526824/1‑236 (MQ=255) ttCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCg < 1:109585/239‑1 (MQ=255) cGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAg < 1:1830305/239‑1 (MQ=255) cGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAg < 1:511973/239‑1 (MQ=255) gTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GAGTTTCCTGCTCTTTA‑TTTTCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGc < 2:399340/239‑1 (MQ=255) gccAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCa < 1:636728/239‑1 (MQ=255) ccAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGGT‑GGTTTTTCTGCTCTTTT‑TTATCGGGGTGGTTTGTTTTTACCCCGATACGCGTATCT‑CGCTTTTTTTCGG‑TTTTTCGTGGGTTTTTGTGTTGTTTGTTTGGTGGGTGTTTTAAAGCCGCCCCCGTCGTCAGCTGGCTGGAAAACCA‑TAAGCCTTTCGTTCTGTAAGCCCGGTCag > 2:1765448/1‑239 (MQ=255) agaatgtAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGGGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCaggagg < 2:784563/232‑1 (MQ=255) agaagTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCaggagg < 2:479679/238‑1 (MQ=255) agaagGTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGTTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCGCCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCaggagg < 2:1705398/238‑1 (MQ=255) cTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGGTGGTTGGTTATCACCCCGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑GTTCGCGTGGGTTGTTGTGGTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAAAGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAAACAGAAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCg > 1:1838837/1‑238 (MQ=255) aaGTGCCGGGTGGGGAGGAATCGACCAGTGGCGGGCT‑GATTTTCCGACGCTGTA‑TTATTGGGGTGATTGTTTATCAACCGGATACGCGTATCT‑CGCGGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGaa < 2:515109/239‑1 (MQ=255) ccGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTTCTTCCCTTTT‑TTTTTGGGGTGATTGGTTTTTACCCGGATACGCGTATCT‑CCCTGTATGTTGG‑GTTTTCGTGGGTTTTTTTGTTGTTGGTTGGGTGGTTGGTTTAACGCCGCCCCGCTCGTTAGCTGGCT‑GGAAAACCGTAATCCTTGCGGTCTTTAAGACGGTTCTGGGGGAAAAACGCATCCGGGTATTCCGCAAGttt > 2:117968/1‑238 (MQ=255) cGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTAt < 2:274284/239‑1 (MQ=255) tgggtgtgcgaCGACCTGCGGCGGGCG‑CAGTTTCCTGCTCTTTA‑TTGTCGGGTTGATTGGTTAGCCCCCGGGTAGGCGTATCT‑CGCTTTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTGAATCGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCGTTGCATTCTATAAACCTGTTCGGGACGAAATCATGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATcct < 2:650635/228‑2 (MQ=255) aaCGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtc < 1:844543/237‑1 (MQ=255) aCGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtcctc < 1:1125014/239‑1 (MQ=255) gACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtcctcct < 1:395748/239‑1 (MQ=255) gACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtcctcct < 1:310960/239‑1 (MQ=255) gACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtcctcct < 1:1022559/239‑1 (MQ=255) aCCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTT‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCAG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTgg > 1:331516/1‑117 (MQ=255) aCCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCa > 1:358700/1‑134 (MQ=255) aCCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTAGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCa < 2:358700/134‑1 (MQ=255) aCCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCAG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTgg < 2:331516/117‑1 (MQ=255) ccATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGtcctcctcc < 2:698758/239‑1 (MQ=255) tCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTccccc < 1:1006451/239‑1 (MQ=255) tCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTccccc < 1:526824/239‑1 (MQ=255) gggCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAata < 1:1004591/239‑1 (MQ=255) tgt‑GATTTTCCGGCTCTTTA‑TTATCGGTGTTATTGGTTATCACCCGGTTACGCGTATCT‑GGCCGTATTTCGG‑TTTCGGCTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGTTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATACTGCTATTCCTAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAattt < 2:809132/236‑3 (MQ=255) gtttttCCTGCTCTTTA‑TTTTCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCtt < 2:646863/237‑1 (MQ=255) gATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCtt < 1:324636/239‑1 (MQ=255) gATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCtt < 1:713370/239‑1 (MQ=255) tCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAgat < 2:1309138/239‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGGTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGGGGATTGTTGTGCGGTTGATTGGCTGGATGTTGAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTAGCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAgatg < 2:463345/239‑1 (MQ=255) tGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAATCCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAgatgat > 1:211411/1‑239 (MQ=255) tctTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAg < 1:1765448/239‑1 (MQ=255) tctTTA‑TTATCGGGTTGATGGGTGATCGCCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCTG‑TTTCGCGTGGGTTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAACCGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAg < 2:265684/239‑1 (MQ=255) ta‑ttatCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGa > 1:459878/1‑238 (MQ=255) a‑ttttCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATc < 2:1838837/239‑1 (MQ=255) a‑ttatCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATc < 1:958993/239‑1 (MQ=255) a‑ttatCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATc < 2:620557/239‑1 (MQ=255) a‑ttatCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATc < 1:722118/239‑1 (MQ=255) a‑ttatCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATc < 2:419494/239‑1 (MQ=255) a‑ttatCGGGTTGATTGGTTAGCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCGCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCGTCAGATGATGAGTGGTc < 2:954743/239‑1 (MQ=255) | GTGATGACTACCGCGCTGCTGTTTGCGGTGTATCTGAACTACATCATGCCGGAAAACGTCTTCCTGGTGATCGCTTCGCTGGCAACCTTCGCCACGGTGTGGGTGTGGATTATGATCCTGCTGTCGCAAATTGCCTTCCGTCGCCGTTTGCCGCCAGAAGAAGTTAAGGCGCTGAAATTTAAAGTGCCGGGTGGGGTAGCAACGACCATCGGCGGGCT‑GATTTTCCTGCTCTTTA‑TTATCGGGTTGATTGGTTATCACCCGGATACGCGTATCT‑CGCTGTATGTCGG‑TTTCGCGTGGATTGTTGTGCTGTTGATTGGCTGGATGTTTAAACGCCGCCACGATCGTCAGCTGGCT‑GAAAACCAGTAATCCTTGCGTTCTGTAAGCCGGTTCAGGAGGAAATCCTGATCCGGCTATTCCGAAAGTTATCCGCCCCCGTCCTCCTCCCCCAAATATCCTTCAGATGATGAGTGATC > NC_007779/421218‑421690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |