Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 3,790,458 | 0 | G | A | 19.8% | 160.9 / 34.5 | 75 | W60* (TGG→TGA) | uhpB | signal transduction histidine‑protein kinase/phosphatase UhpB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/51); new base A (3/12); total (12/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
AAAACTGGGCGTCAGTAACGACGTAGAGCTGGCGCGCCGCATGTTTGATGGCTGGTGATGAAGACGTTGTTCTCCCGCTTAATTACCGTTATTGCCTGCTTTTTTATCTTCTCTGCCGCATGGTTTTGCCTGTGGAGTATCAGCCTGCATCTGGTTGAGCGCCCTGATATGGCGGTGCTGTTATTTCCGTTTGGTCTGCGTCTGGGGCTAATGCTGCAATGCCCGCGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGGCGCGGAGTGGCTGCTGATTTACTGGCTAACGCAGGCGGTCGGTTTAACCCATTTTCCGTTATTGATGATCGGTAGTTTACTGACGTTACTGCCCGTAGCGCTGATCTCGCGCTATCGCCATCAGCGTGACTGGCGCACCTTGCTGTTACAGGGGGCGGCGTTAACGGCGGCGGCGTTGTTGCAGTCGCTGCCCTGGCTTTGGCACGGCAAAGAG > NC_007779/3790222‑3790686 | aaaaCTGGGCGTCAGTAACGACGTAGAGCTGGCGCGCCGCATGTTTGATGGCTGGTGATGAAGACGTTGTTCTCCCGCTTAATTACCGTTATTGCCTGCTTTTTTATCTTCTCTGCCGCATGGTTTTGCCTGTGGAGTATCAGCCTGCATCTGGTTGAGCGCCCTGATATGGCGGTGCTGTTATTTCCGTTTGGTCTGCGTCTGGGGCTAATGCTGCAATGCCCGCGCGGATACTGGc < 1:1127681/238‑1 (MQ=255) aaCGACGTAGAGCTGGCGCGCCGCATGTTTGATGGCTGGTGATGAAGACGTTGTTCTCCCGCTTAATTACCGTTATTGCCTGCTTTTTTATCTTCTCTGCCGCATGGTTTTGCCTGTGGAGTATCAGCCTGCATCTGGTTGAGCGCCCTGATATGGCGGTGCTGTTATTTCCGTTTGGTCTGCGTCTGGGGCTAATGCTGCAATGCCCGCGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGgcg 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gcAATGCCCGCGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGGCGCGGAGTGGCTGCTGATTTACTGGCTAACGCAGGCGGTCGGTTTAACCCATTTTCCGTTATTGATGATCGGTAGTTTACTGACGTTACTGCCCGTAGCGCTGATCTCGCGCTATCGCCATCAGCGTGACTGGCGCACCTTGCTGTTACAGGGGGCGGCGTTAACGGCGGCGGCCGTGTTGCAGTCGCTGGCCCGGGTTTgg > 1:1284970/1‑238 (MQ=255) cAATGCCCGCGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGGCGCGGAGTGGCTGCTGATTTACTGGCTAACGCAGGCGGTCGGTTTAACCCATTTTCCGTTATTGATGATCGGTAGTTTACTGACGTTACTGCCCGTAGCGCTGATCTCGCGCTATCGCCATCAGCGTGACTGGCGCAc < 2:1100808/173‑1 (MQ=255) cAATGCCCGCGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGGCGCGGAGTGGCTGCTGATTTACTGGCTAACGCAGGCGGTCGGTTTAACCCATTTTCCGTTATTGATGATCGGTAGTTTACTGACGTTACTGCCCGTAGCGCTGATCTCGCGCTATCGCCATCAGCGTGACTGGCGCAc > 1:1100808/1‑173 (MQ=255) aaTGCCCGGGCGGATACTGGCCCGTATTGCTGGGAGCGGAGTGGCTGCTGATTTACTGGCTAACGCAGGCGGTCGGTTTAACCCATTTTCCGTTATTGATGATCGGTAGTTTCCTGACGTTACTGCCCGTAGCGCTGATCTCGCGCTATCGCCATCAGCGTGACTGGCGCACCTTGCTGTTACAGGGGGCGGCGTTAACGGCGGCGGCGTTGTTGCAGTCGCTGCCCTGGCTTTGGCa < 2:1130772/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |