| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,146,870 | T→G | 12.9% | G118G (GGT→GGG) | rluC → | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,146,870 | 0 | T | G | 12.9% | 301.0 / 4.5 | 103 | G118G (GGT→GGG) | rluC | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/54); new base G (13/2); total (47/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.19e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GTAAAGGCGAAGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTACTGAA > NC_007779/1146644‑1147106 | gTAAAGGCGAAGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCgg < 1:1705525/238‑1 (MQ=255)gTAAAGGCGAAGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGc < 1:1621595/239‑1 (MQ=255) tAAAGGCGAAGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGc < 2:1397068/238‑1 (MQ=255) aaGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGGGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCAAATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGCGGGAAAA‑TGGGGGGGGGGGTTTAAGATTGGGGGTttttaa > 1:1360823/1‑237 (MQ=255) gggTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTg < 2:1721139/239‑1 (MQ=255) aCAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCg < 2:442126/239‑1 (MQ=255) aaaaaaCGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGtt < 2:645641/239‑1 (MQ=255) aaaaaCGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTg < 2:925072/239‑1 (MQ=255) cTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGcgcg < 1:744394/238‑1 (MQ=255) cTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGcgcg < 1:1611093/238‑1 (MQ=255) tataAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCt < 2:686926/239‑1 (MQ=255) gggTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGcgcg < 1:1514904/219‑1 (MQ=255) gggTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCa < 1:325957/237‑1 (MQ=255) gTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCg < 1:770251/238‑1 (MQ=255) gatgaGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTc < 1:1094319/238‑1 (MQ=255) gatgaGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCCTTGCTGGGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGGGCTGGCGGACGTCATCTTATATCAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGTGTTGCGGGAGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCGTGAACTGGATCATGGTc < 2:152413/238‑1 (MQ=255) ggTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACAGCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGAc < 1:632125/238‑1 (MQ=255) gCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCgg < 1:1677426/238‑1 (MQ=255) gCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCgg < 1:411655/238‑1 (MQ=255) gTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGa < 1:154270/238‑1 (MQ=255) gTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGa < 1:670544/238‑1 (MQ=255) gTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGa < 1:648886/238‑1 (MQ=255) tGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAg < 1:1778756/239‑1 (MQ=255) gggAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGaaa < 1:1751477/239‑1 (MQ=255) tCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcg < 1:1094584/239‑1 (MQ=255) tCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcg < 1:856604/239‑1 (MQ=255) gCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt < 1:903576/239‑1 (MQ=255) cAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGGACATTGGGGGAGGGGGTTTAACCTTCGCGGTTTTTAAGGGTTTG‑GGGGGGTGCGGCCGGGAAGGCGGGTCCTTTAAATTGGTCATTCTGCTTAGCGGGGCACCCCAGGGGTTTTTGTGGGGGGGGAAAAACGCGTGGGGGTGCGTTTTCCGCGTgt > 2:356975/1‑238 (MQ=255) ggcggcGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCGCATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTGTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCGTGAACTGGTTCATCGTCTGGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTGGCGTTGTCTGCATGA‑GCAATTa < 2:877226/238‑1 (MQ=255) gTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt < 1:1586410/205‑1 (MQ=255) cATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCaa < 1:981443/238‑1 (MQ=255) tCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCA‑CGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt < 2:491165/200‑1 (MQ=255) tCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCA‑CGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt > 1:491165/1‑200 (MQ=255) ttATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGa < 1:439664/239‑1 (MQ=255) atGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGGGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGGTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTTACCGGGGAACCCCCGGGGGTTTTCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTggctga > 2:1586410/1‑200 (MQ=255) tGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTAcc < 2:390472/239‑1 (MQ=255) tGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTAcc < 1:809850/239‑1 (MQ=255) tGAAGATGATCACAACCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAAGTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTAcc < 1:1327173/239‑1 (MQ=255) aaGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGGGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTg > 1:577045/1‑239 (MQ=255) aGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCGATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTgg < 2:328001/239‑1 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCCGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTTTTGAAGGGTTGCGGGGGGTGCGCCCGGAAGCGCGGGTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTTACCGGGGCACCCCAGGCGTTTTGCTGGGAGGGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCCTGC‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTcgcg > 2:520051/1‑239 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCa > 1:1758344/1‑127 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCa < 2:1758344/127‑1 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgttgcgtt < 1:1233982/189‑1 (MQ=255) atgatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGGGGGTTAAGCTTAGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGGTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCCTCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGgc > 1:370745/1‑238 (MQ=255) gatCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTAAA‑TGGCGGCCGTGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTTAAGGGGTGCGGGCGTTGCGCCCGGGAGCGCGGGTCCTTTAACTGGGTCATTGTCTTGTCCGGGGCCCCCCAGGGGTTTTGCTGGTTGGGTAAAAAACCCCCGCGTGGGGTTCTCTGCCTGG‑GCCATTTCGGGAAAAAGGGATGCAAAAAAATTACCTGgggcg > 2:1411135/1‑238 (MQ=255) atCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGGGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTg > 1:526960/1‑239 (MQ=255) atCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGAACA‑TGGCGGCCGGGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTGTGCGGGCGGTGCGCCCGGAAGGGGGGGTCCTTGAACTGGGTCATCGTCTTGACCGGGGCACCTCCGGTGTTTTTCTGGTAGCGAAAAAAACCTCGGCGTTGCGGTCTCTGCATGA‑GCAAATTAGTGAAAAAAGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGGTg > 2:174652/1‑239 (MQ=255) caTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGGGGGTTAAGCTTCCGCGCTATTGTAGGTTTGCGGGCGGTGCGCCCGGGAGGGCGGGTCCTTTAACTGGTTCATCGGCTTGACCGGGGCCACTCAGGGGGTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGGTCTCTGCATGT‑GCAATTAAGGGAAAAAGGGGTGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTgg > 2:48916/1‑238 (MQ=255) aTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTgcg < 1:1485276/239‑1 (MQ=255) aTCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCATGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTgcg < 1:1323971/239‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTTTTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGGTCCTTGAACTGGGTCATCGTCTTTACCGGGACACCTCAGGGGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAAAGCCCGGCGTTGGGTTCTCTGCAtta > 2:1233982/1‑187 (MQ=255) tGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTAAA‑TGGCGGCCGTGGGTTTAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGCACTGGTTCATCGTTTTGACCGGGACACCCCAGGAGGTTTGCTGGTAGGGAAAAAACGCCCGGGGGTGGGTTCTCTGCATGA‑GCCATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGGGCTGGTGGGCggg > 2:108353/1‑238 (MQ=255) ggTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCCGTGGGTTTAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGTACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGGGGTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGGTCTCCGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCCGGCGGTGGGGCGCGGtg > 2:106751/1‑238 (MQ=255) ggTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTc > 1:1639748/1‑239 (MQ=255) ggTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTc > 1:211382/1‑239 (MQ=255) ggTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGGGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGGAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTc > 1:1520640/1‑239 (MQ=255) gTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCa > 1:201370/1‑239 (MQ=255) gTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGCAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGGAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GGAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCa > 1:1398029/1‑239 (MQ=255) gTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGGTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCa > 1:166453/1‑239 (MQ=255) gTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGGTTAAGCTTCGGCGTTTTTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGGCACCCCCGGGGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAAAGCCCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGCGAAAAAGGGGTGCAAAAAAATTACCTGGCGCTGGGGCGCgggac > 2:894182/1‑236 (MQ=255) tGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGGCACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAg > 1:114866/1‑239 (MQ=255) tGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGgcgtt < 1:1783060/169‑1 (MQ=255) tGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTg > 1:1645657/1‑238 (MQ=255) tGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TAGCGGCAGCGGTTTAAGACTCGACGCTTTTGAAGGGTTTCCGGCGTTGCGCCCGGAAGCCCGGGGCCTTGGACTGGTGTTTCTTCTTGACCGGGAAACCCCCGGCGTTTTGATTGTCGCGGAAAAAAACCCGGCGTTGCGGTCTTCGAAAAAGGCAATTA‑GTGAAAAAGGGATGGCAAAAGATTACCCGGCGCTGGTGCGCggaccgagg > 2:1485276/1‑232 (MQ=255) gAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTgg < 2:270314/238‑1 (MQ=255) aaTAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCa > 1:392268/1‑239 (MQ=255) aaTAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCa > 1:699797/1‑239 (MQ=255) aaTAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGGTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGGGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCa > 1:517913/1‑239 (MQ=255) aaTAAACCATCCGGAACGGC‑GGGACA‑TGGCGGCAGTGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTGTGCGGGCGTTGCGTCCGGAAGCGCGGGTCCTTGAACTGGTTGATCGTCGTGACCGGGACGCCGCGGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATAACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTGCCGGGCGCTGGGCCGCGGGCAGTgtc < 2:1827916/238‑3 (MQ=255) tAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGt < 2:1261627/239‑1 (MQ=255) acccTTCCGGTACGGA‑GGTACA‑CGGCGGCAGTGGTTTAAGATGCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTATGGCCCGGTAGCGCGGTTGCTTGAACTGGTTCATAGTCATGACCGTGACACCTCAGTTGTGTTGATGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCGCTGCATGA‑GCAATTACGCGACAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTCGCTCTGATGCGCGGTCAGTGGCAGTCg < 2:1319106/237‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCg < 1:575998/239‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCg < 1:520051/239‑1 (MQ=255) aCCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGc > 1:1580635/1‑239 (MQ=255) ccGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCCGGGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGGCACCTCACGGGTTTTTCTGGTGGCGAAAAAACGCCCGGCGGTGCGGTCTCTCCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAAGGGAGGAAAAAGATTACCCGGCGCCGGTGCGCGGGCAGTGGGGGGCGCAtgtg > 2:1629411/1‑239 (MQ=255) ccGGTACGGC‑GGTAAA‑TGGCGGCAGTGGGTTAAGCTTCGGCGGTATTGAAGGGTTGCGGGCGGTGCGCCCGGGAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGGCACCCCAGGTGTTTTTCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGGTGCGTTCTCTTCCTGA‑GCAATTACGTGAAAAAAGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCATGGGCAGgcgcccgtg > 2:1794121/1‑234 (MQ=255) ggTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGaa < 2:411326/239‑1 (MQ=255) aCGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAagag < 1:1650538/239‑1 (MQ=255) aCGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAagag < 2:213745/239‑1 (MQ=255) cggc‑ggTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGc > 1:1690704/1‑239 (MQ=255) gc‑ggTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGt > 1:1339985/1‑239 (MQ=255) ggTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGtt < 2:1339985/238‑1 (MQ=255) aCA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAg < 2:1619964/239‑1 (MQ=255) cA‑TGGCGGCCGGGGGTTAAGCTTCGGGGTTATTGAAAGTATGGGGGGGGTGCGCCCGGAAAGGCGGGTCCTTGAACTGGTTTCTCGTCTTGAGCGGGACCCCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCCCAGCGGTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTAAGGGAAAAAAGGAGGCAAAAAGATTAACTGGTGCTGGTGCGTGGGCAGTGGGAGGGGGATGTGTACAGCGTTTAAg > 2:143723/1‑238 (MQ=255) aa‑TGGAGGCAGTGGGTTAAACTTGGGGGTTATTGAAGGTTTGTGGGCGTTGCGCCCGGGAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGAACGGGGCAACTCAGGCGGTTTGCTGGTAGGGAAAAAAAGCTCGGCGGTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGGGGAAAAGGGAAGCAAAAAAACTACCTGGAGCTGGTGCGAGGGCAGTGGGAGGAGCCTGTGACGAGCGTACAAga > 2:1050306/2‑238 (MQ=255) ggcggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCAcc > 1:1623074/1‑239 (MQ=255) ggcggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCAcc > 1:948723/1‑239 (MQ=255) ggcggcAGTGGGTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGGGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCAc > 2:595916/1‑238 (MQ=255) gcggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCg > 1:1602565/1‑239 (MQ=255) cggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGt > 1:1335918/1‑239 (MQ=255) cggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGt > 1:772652/1‑239 (MQ=255) cggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCCGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGGTGCGTTCCCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGGGCTGGTGCGCGGTCAGTTGCAGGCCCCTGGGAAGAGCGTTCAAGGACCGt > 2:741918/1‑239 (MQ=255) ggcAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGtt > 1:1856884/1‑239 (MQ=255) cAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGtt > 2:577608/1‑237 (MQ=255) cAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGtt > 2:1319216/1‑237 (MQ=255) cAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTa < 1:815019/238‑1 (MQ=255) cAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTa < 1:953920/238‑1 (MQ=255) ggTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTACt < 1:80492/236‑1 (MQ=255) ggTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTACTGaa < 2:1690704/239‑1 (MQ=255) | GTAAAGGCGAAGTGCGGGTGAACAAAAAACGTATTAAGCCTGAATATAAACTCGAAGCGGGTGATGAGGTGCGTATTCCACCGGTTCGCGTTGCTGAGCGGGAAGAAGAGGCGGTTTCGCCACATCTGCAAAAGGTGGCGGCGCTGGCGGACGTCATCTTATATGAAGATGATCACATCCTGGTGCTGAATAAACCTTCCGGTACGGC‑GGTACA‑TGGCGGCAGTGGTTTAAGCTTCGGCGTTATTGAAGGTTTGCGGGCGTTGCGCCCGGAAGCGCGGTTCCTTGAACTGGTTCATCGTCTTGACCGGGACACCTCAGGTGTTTTGCTGGTAGCGAAAAAACGCTCGGCGTTGCGTTCTCTGCATGA‑GCAATTACGTGAAAAAGGGATGCAAAAAGATTACCTGGCGCTGGTGCGCGGTCAGTGGCAGTCGCATGTGAAGAGCGTTCAAGCACCGTTACTGAA > NC_007779/1146644‑1147106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |