Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,392,432 | 0 | G | A | 23.8% | 384.5 / 129.7 | 194 | intergenic (‑120/+7) | mpaA/Y75_RS06995 | murein tripeptide amidase MpaA/NAD‑dependent dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (75/72); new base A (27/19); total (102/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-01 |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTT‑TATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAAC > NC_007779/1392196‑1392668 | cgGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCAt > 1:310046/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |