Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,600,253 | 0 | C | T | 34.9% | 106.2 / 116.4 | 106 | intergenic (‑453/+78) | Y75_RS07965/lsrK | autotransporter barrel domain‑containing lipoprotein/autoinducer‑2 kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/25); new base T (21/16); total (65/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.93e-05 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATAAAATAAGGGTTGTGCTTAATGCTTTAAGAAAAATAGCAATTTTCCCTTGAATATCGTACTGGTGATGGAACGATGAATCTGCAAGCTGGCTTTTAACAAGCCAGCTCTAAAAGAAGGGAAATAAGAATAACTATACTCAAAAACTAACAGCCACGGTCATCATGATGTGGCTGTCAATGAAACTATAACCCAGGCGCTTTCCATAACGACGTCGTCAGTCCATGATCAACCAGCCCCAGCTGATCCTGATAAACTGCCTGCCACTTATCGCGTGAATCCTGATAAAGTTCATGCTTTTCCGGGTCTGGTGTGTGCGTCCGTTCCCAGCGAACCAGGCGTTCT > NC_007779/1600020‑1600490 | aGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATAAAATAAGGGTTGTGCTTAATGCTTTAAGAAAAATAGCAATTTTCCCTTGAATATCGTACTGGTGATGGAACGATGAATCTGCAAGCTGGCTTTTAACAAGCCAGCTCTaa < 1:127321/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |