| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 1,667,148 | T→C | 25.1% | S52S (AGT→AGC) | clcB → | voltage‑gated ClC‑type chloride channel ClcB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 1,667,148 | 0 | T | C | 25.1% | 322.1 / 113.1 | 170 | S52S (AGT→AGC) | clcB | voltage‑gated ClC‑type chloride channel ClcB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (72/55); new base C (23/20); total (95/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TAAAGCACGCACTGCTTTTGCGGCTGGCCTCTTTTGCCGCAAAATAGTCGCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTTCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAGTGGTTGTTCCTCAATAATGACTCCGGCAGTCTGGTCAATGCAGCGACAAACCTTTCCCCCTGGCGACGGTTGCTAACTCCGGCGCTCGGCGGACTGGCGGCGGGTTTGTTG‑C‑TGATGGGC‑TGGCAGAAATTTACCCAACAACGCCCT‑CATGCGCCGACCGATTATATGGAAGCGTTGCAAACCGATGGACAGTTCGATTACGCAGCAAGCCTGGTTAAATCGCTTGCCTCTCTGCTGGTAGTAACCAGCGGCAGTGCAATTGG > NC_007779/1666916‑1667381 | acgcacTGCTTTTGCGGCTGGCCTCTTTTGCCGCAAAATAGTCGCCCGTGTTTCATTGCCCATTTCTGCTCATGCATCATCTACACATCTATCCGGATCTGCGCACTATGTTCCACCGTCTGCTTATCGCAACAGTCGTCGGTATTCTCGCGGCCTTTGCCGTTGCCGGGTTTCGTCATGCGATGCTGCTACTGGAGTGGTTGTTCCTCAATAATGACTCCGGCAGTCTGGTCAATg < 1:1523185/237‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |