Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,802,255 | 0 | T | C | 28.7% | 224.4 / 100.6 | 132 | Q33R (CAG→CGG) | infC | translation initiation factor IF‑3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/49); new base C (16/22); total (61/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.47e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AGTTTTACCTGATAGTCGCCTTCATCTGTACCAGGACGGAATTTAATTTCCTTAACCTGGATAACTTTTTGCTTTTTCTTCTGTTCCTTAGAAGACTTGCTCTTTTCATAGAGGAATTTGCCGTAATCCATTATACGACAAACCGGCGGCTCGGCGTTAGGGCTGATCTCGACTAAGTCTACTCCGGCTTCTTCTGCTTTCTCCAGAGCTTCTCTCAGACTCACAATACCAAGCTGCTCGCCTTCCAGACCTGTTAAGCGAACTTCCTGGGCGCGAATTTCGCCATTGATACGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGTTTAAGACTGCGGCTGCGAATCTCTTGTTGCAGCTTCTCGATCACTTCATTTACGTCCATGCTTCCCAGGTCTTTACCACGGCGGGTGCGAACGGCAACTTTGCCTGATTCCAC > NC_007779/1802021‑1802484 | gTTTTACCTGATAGTCGCCTTCATCTGTACCAGGACGGAATTTAATTTCCTTAACCTGGATAACTTTTTGCTTTTTCTTCTGTTCCTTAGAAGACTTGCTCTTTTCATAGAGGAATTTGCCGTAATCCATTATACGACAAACCGGCGGCTCGGCGTTAGGGCTGATCTCGCCTAAGTCTACTCCGGCTTCTTCTGCTTTCTCCAGAGCTTCTCTCAGACTCACAATACCAAGCCGCTc < 1:1241827/238‑1 (MQ=255) cTGATAGTCGCCTTCATCTGTACCAGGACGGAATTTAATTTCCTTAACCTGGATAACTTTTTGCTTTTTCTTCTGTTCCTTAGAAGACTTGCTCTTTTCATAGAGGAATTTGCCGTAATCCATTATACGACAAACCGGCGGCTCGGCGTTAGGGCTGATCTCGACTAAGTCTACTCCGGCTTCTTCTGCTTTCTCCAGAGCTTCTCTCAGACTCACAATACCAAGCCGCTCGCCTTCCa 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |