Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 1,813,070 | T→C | 25.3% | G141G (GGT→GGC) | Y75_RS09105 → | cystine/sulfocysteine:cation symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 1,813,070 | 0 | T | C | 25.3% | 332.7 / 130.8 | 190 | G141G (GGT→GGC) | Y75_RS09105 | cystine/sulfocysteine:cation symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/74); new base C (28/20); total (95/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAATCCGACGTCAATTATCAGCGTGGTAATTTTTGCCGCATTCCTCGGCGTAGCTGCATTGAAACTGCTGAAGGATGATGCGCCGAAAGGTGAACGCGTCTTAGCCGCTATCGATA > NC_007779/1812836‑1813308 | tGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGa > 1:1219258/1‑239 (MQ=255) 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GTGGTTTAACATCGTTGGTAACGGCTATGTTCAACTGCTGCAAATGATCGTTATGCCGTTAGTCTTCGCCTCTATTCTGAGCGCGGTTGCCCGTCTGCATAACGCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAATCCGACGTCAATTATCAGCGTGGTAATTTTTGCCGCATTCCTCGGCGTAGCTGCATTGAAACTGCTGAAGGATGATGCGCCGAAAGGTGAACGCGTCTTAGCCGCTATCGATA > NC_007779/1812836‑1813308 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |